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農業、林業、漁業におすすめ給与計算ソフト9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/4/9
給与計算ソフトと一口に言っても、農林漁業の現場では「変形労働時間制への対応」「季節労働者やパートの出入りに伴う人数変動」「労働基準法の適用除外」など、他業種にはない独自の要件が求められます。さらに製品ごとに、シンプルな計算特化型からバックオフィス全体を統合するクラウド型、複数法人を束ねるERP型まで設計思想が大きく異なります。FitGapでは、この業界特有の事情と製品タイプの違いを整理し、自社に合った1本を迷わず選べるよう、タイプ別の製品紹介・要件定義・選定ステップの3部構成でガイドをまとめました。
レビュー担当 加藤 杏奈
業務システムベンダーでCOMPANY・リシテア等の人事・給与・勤怠システムの導入支援に5年間従事。要件確認・設定・テスト・保守対応まで一連の工程を経験し、制度と運用の両面を踏まえた評価を行っている。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
少人数・シンプル運用タイプ 🌾
弥生給与Next
/ 給料らくだプロ
/ 給料らくだ普及版
クラウド一体型・バックオフィス統合タイプ ☁️
freee人事労務
/ マネーフォワード クラウド給与
/ 給与奉行クラウド
ERP・人事給与統合タイプ 🏢
マネーフォワード クラウドERP
/ MJSLINK DX
/ CCS給与計算
企業規模
大企業
個人事業主
デバイス
その他
関連カテゴリ
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タイプ別お勧め製品

少人数・シンプル運用タイプ 🌾

このタイプが合う企業:

従業員が少ない農業・漁業の個人事業主や家族経営の事業者で、専門知識がなくても手軽に給与計算を始めたい方

どんなタイプか:

従業員数が少ない農家や漁業の個人事業主に向いているタイプです。給与手当の金額を直接入力し、残業代や法定控除を自動計算するシンプルな設計が特徴で、パートタイム労働者や季節労働者の給与処理を手軽にこなせます。FitGapでは、まず「専任の経理担当がいない」「従業員10名以下」という小規模事業者の方に最初に検討いただきたいタイプだと考えています。操作のわかりやすさとコストの低さが最大の魅力で、Excelでの給与計算から初めてソフトへ移行する方にもおすすめです。

このタイプで重視すべき機能:

🧮法定控除の自動計算
社会保険料や所得税・住民税の控除額をソフトが自動で算出してくれます。法改正があってもアップデートで対応されるため、手計算のミスや法令違反のリスクを大幅に減らせます。
📩給与明細のWeb配信
作成した給与明細を紙で印刷せずに、スマホやPCから従業員に配信できます。圃場や漁港など事務所から離れた場所で働く従業員にも確実に届けられるため、農林漁業の現場に特に便利です。

おすすめ製品3選

弥生給与Next
おすすめの理由
農業・漁業の現場で給与明細を圃場や漁港にいる従業員にも届けたい個人事業主には、本製品が第一候補です。クラウド型給与計算ソフト・給与明細(Web)・電子申請対応の3つを○(対応)しており、変形労働時間制対応・割増賃金自動計算・時給制・日給制もすべて○(対応)で、季節労働者やパートの混在運用に向きます。FitGapの調査では農業、林業、漁業シェアはおすすめ9製品中1位で、同タイプ3製品の中でも採用実績が先行しています。一方、退職金計算と社労士向け機能は×(非対応)のため、退職金規程を社内で運用する事業者や、社労士事務所として顧問先給与をまとめて受託したい方にはタイプ内の他製品を比較ください。
価格
9,000円
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
給料らくだプロ
おすすめの理由
勤怠連携と振込指示書出力までインストール型ソフト一本で完結させたい家族経営の農家・漁業者向けの製品です。同タイプ3製品の中で、振込指示書出力・社労士向け機能・複数企業一括管理(マルチカンパニー)の3つを○(対応)しているのは本製品のみで、税理士や社労士に給与データを渡しつつ自家用と法人用を1ライセンスでさばく運用に向きます。FitGapの料金評価はおすすめ9製品中2位タイで、勤怠管理連携・打刻データ取込・変形労働時間制対応も○(対応)です。ただしクラウド型給与計算ソフトと電子申請対応は×(非対応)、給与明細(Web)は追加オプションのため、社会保険手続きをオンラインで済ませたい方や圃場の従業員にスマホで明細を配りたい方には別タイプを推奨します。
価格
-
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
給料らくだ普及版
おすすめの理由
1人〜数人規模で給与明細を紙で手渡しでき、初期費用を最小限に抑えたい個人事業主向けの選択肢です。FitGapの料金評価は同タイプ3製品の中で1位タイで、勤怠管理連携・打刻データ取込・変形労働時間制対応・時給制・日給制も○(対応)しているため、季節雇用の単純な給与計算であれば本製品で運用が回ります。社労士向け機能・複数企業一括管理(マルチカンパニー)も○(対応)で、顧問社労士に毎月CSVを渡す運用にも向きます。一方で給与明細(Web)・住民税年度更新・源泉徴収票・法定調書出力は×(非対応)、年末調整自動化は追加オプション扱いのため、年末調整や住民税切替を本製品内で完結させたい事業者は同タイプの上位製品か別タイプの検討が必要です。
価格
5500
買い切り
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

クラウド一体型・バックオフィス統合タイプ ☁️

このタイプが合う企業:

従業員の入れ替わりが多い中小規模の農業法人・漁業法人で、勤怠から会計まで一気通貫で効率化したい方

どんなタイプか:

給与計算だけでなく、勤怠管理・年末調整・社会保険手続き・会計連携までをひとつのプラットフォームで完結できるタイプです。農繁期と農閑期で労働時間が大きく変わる農林漁業では、勤怠データがそのまま給与計算に反映される仕組みが業務効率化に直結します。FitGapとしては、パート・季節労働者の出入りが頻繁で、毎月の給与計算だけでなく入退社手続きや年末調整の負担も大きいと感じている事業者にこのタイプを推奨しています。会計ソフトと自動連携できるため、人件費の仕訳を手入力する手間もなくなります。

このタイプで重視すべき機能:

⏱️勤怠データの自動連携
スマホ打刻やICカード打刻で記録された勤怠データが、給与計算ソフトに自動で取り込まれます。農繁期の残業や変形労働時間制にも対応でき、手入力のミスや二重作業を防げます。
📋年末調整のオンライン完結
従業員がスマホやPCから扶養控除申告書などを入力し、年末調整の計算から源泉徴収票の発行までオンラインで完結します。紙の書類を回収する必要がないため、拠点が分散しがちな農林漁業に最適です。

おすすめ製品3選

freee人事労務
おすすめの理由
経理専任者を置けない農業法人・漁業法人で、勤怠から年末調整までを最短で立ち上げたい場合に第一候補となる製品です。FitGapの操作性評価・導入容易性評価・サポート評価がいずれもおすすめ9製品中1位で、季節労働者の入退社が頻発する現場でも担当者が短期間で運用に乗せられます。タイプ重要要件である変形労働時間制対応・勤怠管理連携・打刻データ取込・会計ソフト連携・年末調整自動化・電子申請対応はすべて○(対応)で、農林漁業シェアもおすすめ9製品中2位と採用実績があります。一方で退職金計算・複数企業一括管理・カスタマイズ性は×(非対応)のため、退職金規程が複雑な大規模法人や、複数の関連法人を1ライセンスで束ねたい組織にはタイプ内の他製品が向きます。
価格
2,000円
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
マネーフォワード クラウド給与
おすすめの理由
勤怠・給与・会計・経費精算までをマネーフォワード基盤で一気通貫に回したい中小農業法人・漁業法人で候補になる製品です。FitGapの機能性評価・連携評価・セキュリティ評価がおすすめ9製品中1位タイで、ERP連携・経費精算連携・複数企業一括管理・退職金計算・人事評価連携にも○(対応)しているため、複数の関連法人や子会社を抱える農業法人がバックオフィスを横串で運用できます。要件対応数もおすすめ9製品中3位タイ(45項目中33件対応)で対応範囲が広い点も判断材料になります。ただし年末調整自動化は×(非対応)、社労士事務所向け機能・電子申請対応・源泉徴収票出力は追加オプションのため、年末調整を自社で完結したい単一法人や、初期費用を抑えたい小規模事業者にはfreee人事労務の方が向きます。
価格
2,480円
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
給与奉行クラウド
おすすめの理由
従業員規模が拡大しても給与計算の精度と社労士連携を維持したい中堅規模の農業法人・漁業法人で候補になる製品です。FitGapの機能性評価・セキュリティ評価・連携評価がおすすめ9製品中1位タイで、社労士向け機能・操作ログ監査・高度権限制御・社会保険料改定処理・ERP連携に○(対応)しています。大企業シェアはおすすめ9製品中2位、製造シェアは1位と中堅以上での採用実績があり、農繁期に従業員が数十名単位で増減する大規模農業法人でも統制を維持できます。一方で給与明細(Web)・電子申請対応・退職金計算・源泉徴収票出力・複数企業一括管理・多拠点管理はいずれも追加オプションで、農林漁業シェアもおすすめ9製品中4位タイのため、初期費用を抑えて素早く立ち上げたい小規模法人や、年末調整までを標準機能で完結したい事業者にはタイプ内の他製品が向きます。
価格
5,500円
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

ERP・人事給与統合タイプ 🏢

このタイプが合う企業:

従業員数が多い農業法人・森林組合・漁業協同組合や、複数拠点・複数法人をまとめて管理したい中堅以上の組織

どんなタイプか:

給与計算を人事情報管理や経営管理と一体化したERPの一部として運用するタイプです。従業員数が数十名以上の農業法人や漁業協同組合、あるいは複数法人を束ねるグループ経営を行っている場合に真価を発揮します。FitGapでは、単なるコスト削減ではなく「経営データとしての人件費の可視化」や「グループ全体での人員配置の最適化」といった経営課題を抱える組織に向いていると考えています。導入・運用コストは高めですが、人事異動・昇給シミュレーション・タレントマネジメントまで一気に対応できる拡張性が魅力です。

このタイプで重視すべき機能:

👥人事マスタとの統合管理
従業員の人事情報(等級・資格・異動履歴など)と給与データが一つのシステムで管理されます。昇給や人事異動が発生しても給与への反映が自動化されるため、転記ミスや反映漏れを防ぎます。
🏗️グループ・複数法人の一括処理
複数の法人や事業所の給与計算をまとめて処理できます。農業法人と加工会社を別法人で運営しているケースや、複数の漁協をまとめて管理したいケースで、法人ごとの給与体系を統一管理できます。

おすすめ製品3選

マネーフォワード クラウドERP
おすすめの理由
農業法人や漁協の本部経理を、給与・会計・経費精算まで1基盤で束ねたい組織に向く製品です。ERP連携・経費精算連携・人事評価連携・操作ログ監査がすべて○(対応)で、複数法人一括管理にも○(対応)、FitGapの要件対応はおすすめ9製品中1位(45項目中35件対応)、連携・拡張性評価もおすすめ9製品中1位タイです。中堅〜大企業向けは○(推奨)で、グループ法人をまたいだ人件費の見える化に踏み込みたい中堅組織に向きます。一方で振込指示書出力と退職金計算は×(非対応)、農業・林業・漁業シェアはおすすめ9製品中3位タイで、農協・漁協系の独自慣行を多く抱える現場ではMJSLINK DXの方が適合度が高い場合があります。
価格
要問合せ
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
森林組合や漁協など、大企業並みの権限統制と中堅規模の人件費分析を両立したい組織で候補になる製品です。大企業シェアと中堅企業シェアがいずれもおすすめ9製品中1位、FitGapのセキュリティ・統制評価もおすすめ9製品中1位タイで、人件費予測・シミュレーション・経営ダッシュボード・操作ログ監査・退職金計算がすべて○(対応)し、要件対応はおすすめ9製品中2位(45項目中34件対応)です。中堅〜大企業向けが×(非推奨)である一方、複数法人一括管理は○(対応)で、複数組合を束ねる本部運用に向きます。料金評価はおすすめ9製品中5位で、価格は非公開のため小規模な単一法人では投資回収が難しく、雇用契約形態管理・電子申請・社労士向け機能・源泉徴収票出力は追加オプション扱いとなる点に注意が必要です。
価格
要問合せ
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
CCS給与計算
おすすめの理由
教育・学習支援や医療・福祉のシェアがおすすめ9製品中1位で、林業大学校や水産系専門学校・診療所を束ねる事業体の本部給与に採用例が積み上がっている製品です。複数企業一括管理は○(対応)、人件費分析レポートと部門別コスト配賦も○(対応)で、複数法人の人件費を一括処理したい組織で検討余地があります。一方、変形労働時間制対応・勤怠管理連携・打刻データ取込・雇用契約形態管理・会計ソフト連携・クラウド型がいずれも×(非対応)で、要件対応はおすすめ9製品中7位(45項目中22件対応)、農業・林業・漁業シェアもおすすめ9製品中5位にとどまります。季節労働者の打刻データを取り込みたい農業法人や、勤怠連携で変形労働時間制を運用したい漁協では要件不足となるため、その用途ではマネーフォワード クラウドERPやMJSLINK DXを優先検討してください。
価格
27,500円
パッケージ
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

🔄変形労働時間制への対応
農林漁業では農繁期・農閑期など季節によって労働時間が大きく変動するため、1年単位や1ヶ月単位の変形労働時間制に対応した給与計算ができるかが極めて重要です。FitGapでは、変形労働時間制の設定パターンが柔軟な製品を優先的におすすめしています。
👥多様な雇用形態の給与体系管理
正社員・パート・季節労働者・外国人技能実習生など、一つの事業所で複数の雇用形態が混在しやすい業界です。それぞれ異なる時給・日給・月給の計算ルールや社会保険の適用区分をまとめて管理できる製品かどうかが、選定の大きな分かれ目になります。
⏱️勤怠管理システムとの連携
天候や圃場の状態で労働時間がイレギュラーに変動しやすい現場では、勤怠データを正確に給与計算へ反映する仕組みが欠かせません。FitGapとしては、勤怠管理システムからのデータ自動取り込みに対応している製品を強くおすすめします。
💰従業員数の増減に柔軟な料金体系
農繁期には短期雇用者が増え、農閑期にはほとんど従業員がいないというケースも珍しくありません。年間を通じて従業員数が大きく変動する業界だからこそ、人数課金の上限や料金の柔軟性が製品選定の決め手になります。
📊会計ソフトとの連携
農業所得や漁業所得の確定申告では、人件費を正しく経費計上する必要があります。給与計算の結果を会計ソフトへ自動仕訳連携できる製品を選ぶと、転記ミスの防止と記帳作業の大幅な効率化が期待できます。
⚖️労働基準法の適用除外設定
農業では時間外労働・休日労働の割増賃金が適用除外となるケースがある一方、食品加工部門など適用される部門も混在します。部門ごとに割増賃金の適用・非適用を切り替えられるかどうかは、この業界特有の重要な要件です。

一部の企業で必須

🌏外国人技能実習生の管理機能
農業や漁業では外国人技能実習生を受け入れる事業所が増えています。在留資格の期限管理や、外国語での給与明細発行に対応した製品が必要になるケースがあります。
🗺️複数拠点・複数圃場での一括管理
農地や漁港が複数に分散している場合、拠点ごとの勤怠・給与データを一元管理できる機能が求められます。FitGapでは、離れた現場の管理者がクラウド上でリアルタイムに情報共有できる製品を推奨しています。
📈賞与計算・昇給シミュレーション
法人化が進む農業経営体や一定規模の漁業法人では、賞与支給や昇給の計算が必要になります。就業規則に基づいた賞与・昇給の自動計算やシミュレーション機能は、成長段階の法人ほど重視される要件です。
🗓️年末調整機能
従業員を通年雇用している法人では、年末調整の処理が毎年発生します。保険料控除や扶養控除の申告書を電子化でき、給与データと連動して自動計算できる製品は、繁忙期と重なりがちな年末の事務負担を軽減してくれます。
🏥社会保険の適用判定サポート
短期間・短時間の雇用者が多いこの業界では、社会保険の加入要否判定が複雑になりがちです。雇用期間や所定労働時間から適用判定を自動で行い、保険料計算に反映する機能があると安心です。

ほぼ全製品が対応

🧮所得税・住民税の自動計算
源泉所得税の自動計算や住民税の特別徴収は、ほぼすべての給与計算ソフトが標準で対応しています。税額表(甲欄・乙欄)の自動適用も含め、基本機能として備わっている要件です。
📄給与明細の発行
紙またはWeb形式での給与明細発行は、どの給与計算ソフトでも対応しています。特にクラウド製品ではスマートフォンから明細を確認できる機能が標準的に備わっているため、差別化要因にはなりにくい要件です。
🔔法改正への自動アップデート
社会保険料率の変更や税制改正への対応は、クラウド型・インストール型を問わず、主要製品であればアップデートで対応してくれます。製品選定の差別化ポイントにはなりにくい部分です。

優先度が低い

✈️海外赴任者向け給与計算
海外駐在員手当や外貨建て給与計算は、農林漁業の大半の事業者には不要な機能です。グローバル展開を行う一部の大手企業を除き、優先度は低いと考えてよいでしょう。
🏢大規模組織向けワークフロー
承認階層が多段階にわたるワークフローや、数千名規模を想定した一括処理機能は、小規模事業者が中心のこの業界では過剰スペックになりがちです。

農業、林業、漁業の給与計算ソフトの選び方

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かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

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