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残業手当を自動計算できる給与計算ソフトおすすめ9選｜タイプ別の選び方ガイド

更新：2026年02月27日

給与計算ソフトと一口にいっても、残業手当の自動計算ひとつとっても対応力には大きな幅があります。固定残業代の差額計算や月60時間超の割増率自動切替に対応した製品もあれば、基本的な割増率設定のみの製品もあり、自社の残業ルールの複雑さによって最適な選択肢はまったく変わります。本記事では、残業手当の自動計算に対応した給与計算ソフトを「労務管理一体化型」「基幹業務統合型」「シンプル特化型」の3タイプに分類し、それぞれの代表製品を紹介します。さらに、要件定義のコツと製品選定の具体的な手順もガイドしていますので、自社に合った一本を見つけてください。

タイプ別お勧め製品

労務管理と一体化した中小企業向けタイプ 🏢

このタイプが合う企業：

従業員数300名以下の中小企業で、給与・労務を少人数で兼任している担当者の方

どんなタイプか：

給与計算だけでなく、勤怠管理・入退社手続き・年末調整といった労務業務をひとつのサービスでまとめて処理できるタイプです。勤怠データから残業時間を自動取得し、割増賃金の計算までシームレスにつなげられるため、転記ミスや手作業を大幅に減らせます。FitGapでは、従業員数が数名〜300名程度の中小企業で、給与担当が他の業務と兼任しているケースに特におすすめしています。労務の専門知識が少なくても画面のガイドに沿って進められる操作性が、このタイプの大きな魅力です。

このタイプで重視すべき機能：

⏱️勤怠データからの残業手当自動連携

打刻データや勤怠申請をもとに法定内残業・時間外労働・深夜労働・休日労働を自動で区分し、それぞれの割増率を適用して残業手当を自動計算します。勤怠と給与がひとつのサービス内で連動するため、Excelへの転記や手入力が不要になります。

📋入退社・社会保険手続きとの一気通貫処理

従業員の入社時の情報登録から社会保険の届出書類作成、月々の給与計算、退職時の離職票発行まで、一連の労務手続きをワンストップで完結できます。従業員情報を一か所にまとめて管理するため、情報の二重入力やデータの散在を防げます。