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源泉徴収票作成対応の給与計算ソフトおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026年03月05日
給与計算ソフトの中でも源泉徴収票の作成機能を備えた製品は、年末調整の自動計算や法定調書の出力、eLTAX連携など対応範囲に大きな差があります。小規模企業向けのクラウド一体型から、中堅企業向けの専門パッケージ、大企業向けのERP・BPO連携型まで、自社の従業員規模や給与体系の複雑さによって選ぶべきタイプは異なります。FitGapでは、この3タイプの違いと選定の決め手となる要件を整理し、自社に合った1製品にたどり着くための実践ガイドをまとめました。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
小規模・中小企業向けクラウド一体型タイプ 🏢
freee人事労務
/ 弥生給与Next
/ マネーフォワード クラウドERP
中堅企業向け専門パッケージタイプ 📊
奉行クラウド HR DX Suite
/ PCAクラウド給与
/ 給与大臣NX
大企業・グループ経営向けERP/BPO連携タイプ 🏗️
PROSRV on Cloud
/ COMPANY 給与計算システム
/ ProActive C4
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
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タイプ別お勧め製品

小規模・中小企業向けクラウド一体型タイプ 🏢

このタイプが合う企業:

従業員数が数名〜100名程度の中小企業やスタートアップで、会計ソフトとの連携を重視し、できるだけ少ない製品で管理業務を完結させたい企業の方に向いています。

どんなタイプか:

会計・勤怠・労務などのバックオフィス業務をひとつのブランドでまとめて運用できるタイプです。源泉徴収票の作成はもちろん、年末調整から給与明細のWeb配信まで一気通貫で対応できるため、専任の経理・労務担当がいない企業でも無理なく運用できます。FitGapでは、初めて給与計算ソフトを導入する方にまずおすすめしたいグループです。

このタイプで重視すべき機能:

🔗会計ソフト自動連携
給与計算の結果から仕訳データを自動で会計ソフトへ連携できます。手入力による転記ミスがなくなり、月次決算のスピードが大幅に上がります。
📱年末調整のオンライン回収
従業員がスマートフォンやPCからアンケート形式で保険料控除や扶養情報を入力でき、紙の申告書を回収・転記する手間をまるごと削減できます。

おすすめ製品3選

freee人事労務
おすすめの理由
給与計算・勤怠・年末調整・労務手続きを1つのソフトに統合しており、源泉徴収票の作成までワンストップで完結できます。直感的なUIで初心者にも扱いやすく、freee会計との連携がシームレスです。
価格
2,000円
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
弥生給与Next
おすすめの理由
長年の実績を持つ弥生シリーズのクラウド版で、個人事業主や少人数の法人に特に人気があります。源泉徴収票・給与支払報告書の作成に標準対応しており、操作のわかりやすさに定評があります。
価格
9,000円
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
マネーフォワード クラウドERP
おすすめの理由
給与計算に加え、会計・経費精算・請求書など幅広いバックオフィス機能をシリーズで揃えられます。源泉徴収票は年末調整機能と連動して自動作成でき、成長中の企業が段階的に機能を拡張しやすい設計です。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

中堅企業向け専門パッケージタイプ 📊

このタイプが合う企業:

従業員数100〜1,000名規模の中堅企業で、複数の給与体系や独自の手当ルールがあり、法改正対応やセキュリティ基準を重視する企業の方に向いています。

どんなタイプか:

給与計算を主軸に、社会保険・労働保険の届出や複雑な手当計算など、専門性の高い機能を備えたタイプです。給与体系が複雑になりがちな中堅企業が、法改正への追従や正確な源泉徴収票の出力を安心して任せられることを重視して設計されています。FitGapとしては、従業員100名を超えたあたりから導入効果が実感しやすいグループだと考えています。

このタイプで重視すべき機能:

⚙️複数給与体系の一括管理
正社員・契約社員・パートなど雇用形態ごとに異なる給与規定をまとめて設定でき、源泉徴収票もそれぞれの計算結果を正確に反映して出力できます。
📜法改正の自動アップデート
税率や社会保険料率の改定に合わせてシステムが自動で更新されるため、担当者が手動で設定を変更する必要がなく、源泉徴収票の計算誤りを防げます。

おすすめ製品3選

奉行クラウド HR DX Suite
おすすめの理由
中堅・中小企業の給与計算ソフトとして導入シェアが非常に高く、源泉徴収票を含む法定帳票の出力精度に定評があります。専門家ライセンスで社労士・税理士とのデータ共有もスムーズです。
価格
18,750円
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
PCAクラウド給与
おすすめの理由
給与体系のカスタマイズ性が高く、業種特有の手当計算にも柔軟に対応できます。源泉徴収票や法定調書の出力を含む年末調整機能が充実しており、中堅企業での運用実績が豊富です。
価格
13,860円
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
給与大臣NX
おすすめの理由
オンプレミス型で安定した運用ができ、データを自社内で管理したい企業に支持されています。源泉徴収票の自動作成に加え、各種届出書類の出力にも幅広く対応しています。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

大企業・グループ経営向けERP/BPO連携タイプ 🏗️

このタイプが合う企業:

従業員数1,000名以上の大企業やグループ経営を行う企業で、人事給与業務のBPO委託やERPとの統合運用を前提に製品を選びたい方に向いています。

どんなタイプか:

数千名規模の従業員を抱える大企業やグループ企業が、人事・給与業務をERPシステムやアウトソーシング(BPO)と組み合わせて運用するタイプです。源泉徴収票の作成だけでなく、グループ会社間での給与データ統合や業務プロセスの外部委託まで見据えた設計になっています。FitGapでは、社内に専門の人事部門があり、大量の源泉徴収票を正確かつ一括で処理したい企業にフィットするグループだと捉えています。

このタイプで重視すべき機能:

🤝給与業務のBPO対応
給与計算や源泉徴収票の発行業務をシステム提供元にアウトソーシングでき、法改正への対応やチェック業務まで含めて外部に委託できます。
🌐グループ会社の統合管理
複数法人の給与データを一元管理し、グループ横断で源泉徴収票や法定調書を一括出力できます。組織再編や人事異動にも柔軟に対応します。

おすすめ製品3選

PROSRV on Cloud
おすすめの理由
三菱総研DCSが提供するクラウド型人事給与システムで、給与計算から源泉徴収票作成、さらにBPOサービスまでワンストップで利用できます。大企業の導入実績が豊富です。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
COMPANY 給与計算システム
おすすめの理由
大企業向け統合人事システムとして高い知名度を誇り、数千名規模の源泉徴収票を一括処理する運用力が強みです。人事・勤怠・給与をシームレスに連携できます。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
SCSK提供のクラウドERPで、人事給与モジュールが会計・販売管理と統合されています。グループ経営での給与データ集約と源泉徴収票の一括出力に対応しています。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

🧮年末調整の自動計算
毎月蓄積された給与データをもとに、年税額の過不足を自動で算出できます。手作業では膨大な時間がかかる控除額の計算や還付・徴収の判定まで一気通貫で処理できるかどうかが、源泉徴収票作成の効率を大きく左右します。FitGapでは、この機能の対応範囲が製品ごとに最も差が出るポイントだと考えています。
📱Web明細・電子交付
作成した源泉徴収票を従業員がWebやアプリから自分で閲覧・ダウンロードできる機能です。紙の配布が不要になり、再発行依頼への対応もなくなります。FitGapとしては、従業員数が多い企業ほどこの機能の有無が業務負荷に直結するため、選定の決め手になりやすいと感じています。
📋法定調書合計表の自動作成
源泉徴収票のデータから、税務署に提出する法定調書合計表を自動で生成できる機能です。手入力で合計表を作成すると転記ミスが起きやすいため、ここが自動化されているかどうかは実務上の大きな分岐点になります。
🏛️給与支払報告書の作成・eLTAX連携
源泉徴収票と同じ内容を市区町村へ提出するための給与支払報告書を自動作成し、eLTAXで電子提出できる機能です。紙での郵送が不要になるため、年末年始の繁忙期に大きな時短効果があります。FitGapでは、この機能が源泉徴収票作成とセットで使えるかを必ず確認することをおすすめしています。
🔄税制改正の自動アップデート
毎年変わる所得税率や各種控除額の改正内容をソフト側で自動的に反映する機能です。特にクラウド型は自動更新が標準的ですが、インストール型では手動でのバージョンアップが必要な場合もあります。源泉徴収票の正確性に直結するため、選定時に重視すべきポイントです。
📝従業員からの申告情報Web回収
扶養控除等申告書や保険料控除申告書などを、従業員がスマホやPCから直接入力・提出できる機能です。紙の配布・回収・転記が不要になり、記入ミスも大幅に減ります。FitGapでは、この機能があるかないかで年末調整全体の工数が数倍変わることもあると考えています。
🔐マイナンバー管理
従業員のマイナンバーをソフト内で安全に保管し、源泉徴収票の税務署提出用に自動で記載できる機能です。マイナンバーの取り扱いにはセキュリティ要件が厳しいため、専用の管理機能が組み込まれているかどうかは見落とせないポイントです。

一部の企業で必須

💻e-Tax電子申告連携
源泉徴収票や法定調書のデータをe-Taxに直接送信できる機能です。法定調書の提出枚数が100枚以上の場合は電子提出が義務化されているため、該当する企業にとっては必須の要件になります。
⚙️複数給与体系への対応
正社員・パート・役員など異なる給与体系ごとに計算式や手当項目を個別設定できる機能です。雇用形態が多様な企業では源泉徴収票の内容も従業員ごとに異なるため、柔軟な設定ができないと運用が回りません。
⏱️勤怠管理システムとのデータ連携
他社の勤怠管理ソフトや自社の打刻データをAPI・CSV等で取り込み、給与計算に自動反映する機能です。すでに勤怠管理ソフトを導入済みの企業では、連携の有無が導入可否を左右します。
📊会計ソフトへの仕訳連携
給与計算の結果から人件費の仕訳データを自動生成し、会計ソフトへ取り込める機能です。経理部門と連携して業務を回している企業では、この連携がないと二重入力の手間が発生します。
🚪退職者の源泉徴収票発行
年の途中で退職した従業員に対して、退職時点までの源泉徴収票をすぐに発行できる機能です。法律上、退職後1か月以内に交付する義務があるため、人の入れ替わりが多い企業では確実に必要になります。
🌐多言語対応
源泉徴収票や年末調整の画面を英語など他言語で表示・入力できる機能です。外国人従業員が多い企業では、母国語での入力補助がないと申告ミスや問い合わせが増える原因になります。

ほぼ全製品が対応

🖨️源泉徴収票のPDF出力
作成した源泉徴収票をPDF形式で出力・印刷できる基本機能です。源泉徴収票作成に対応している給与計算ソフトであれば、ほぼすべての製品が標準で備えています。
🏥社会保険料の自動計算
健康保険料・厚生年金保険料・雇用保険料などを等級や料率に基づいて自動計算する機能です。源泉徴収票の控除額に直結するため、給与計算ソフトの基本機能として大半の製品が対応しています。
💴所得税の自動計算
毎月の給与・賞与から源泉所得税を税額表に基づいて自動算出する機能です。源泉徴収票の根幹となるデータを生成するため、ほぼすべての製品で標準搭載されています。
📒賃金台帳の作成
従業員ごとの月別支給・控除データを一覧で管理・出力できる機能です。労働基準法で作成が義務付けられている帳簿であり、給与計算ソフトの標準機能として広く対応されています。

優先度が低い

🗂️組織図の自動作成
従業員の所属情報をもとに組織図を自動生成する機能です。人事管理としては便利ですが、源泉徴収票の作成や年末調整業務には直接関係しないため、選定時の優先度は低めです。
人事評価機能
従業員の目標設定や評価結果を管理する機能です。人事給与一体型の製品に搭載されていることがありますが、源泉徴収票作成を目的とした選定では重視する必要はありません。

源泉徴収票作成機能の給与計算ソフトの選び方

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