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有給管理対応の給与計算ソフトおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2025年10月02日
有給管理に対応した給与計算ソフトは、中小企業向けのバックオフィス統合型から大企業向けERP・人事給与パッケージ、さらには給与BPO連携型まで、製品の性格が大きく異なります。自社の有給ルールの複雑さや従業員規模によって最適なタイプが変わるため、「どの製品が人気か」だけで選ぶと導入後にミスマッチが起こりがちです。FitGapでは、有給ルールの複雑度・雇用形態の多様さ・勤怠管理との連携方法という3つの軸で製品タイプを整理し、要件定義から最終選定までを4ステップで解説します。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
中小企業向けバックオフィス統合タイプ 🏢
freee人事労務
/ 弥生給与Next
/ マネーフォワード クラウドERP
大企業向けERP・人事給与パッケージタイプ 🏛️
奉行クラウド HR DX Suite
/ COMPANY 給与計算システム
/ ProActive C4
給与BPO・アウトソーシング連携タイプ 📋
PROSRV
/ PROSRV on Cloud
/ PCAクラウド給与
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
関連カテゴリ
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タイプ別お勧め製品

中小企業向けバックオフィス統合タイプ 🏢

このタイプが合う企業:

従業員数が数名〜300名程度の中小企業で、勤怠・給与・労務をなるべく1つのサービスにまとめて管理コストを下げたい企業の方に向いています。

どんなタイプか:

勤怠管理・有給管理・給与計算・年末調整・社会保険手続きなどをワンストップで完結できる、中小企業に人気の製品グループです。FitGapでは、従業員数が数名〜数百名規模で「まず1つのサービスにまとめたい」という企業に最もフィットするタイプだと考えています。有給の自動付与や残日数管理が給与計算と直結しているため、担当者がExcelで有給台帳を別管理する必要がなくなります。会計ソフトとの仕訳連携もスムーズなので、経理と人事を少人数で兼務している企業ほど導入効果を実感しやすいでしょう。

このタイプで重視すべき機能:

🗓️有給休暇の自動付与・残日数リアルタイム管理
入社日や勤続年数に応じた有給の自動付与と取得状況の可視化を、給与計算と同じ画面上で一元管理できます。年5日取得義務のアラート機能も備わっているため、管理漏れを防ぎやすい点がポイントです。
🔗給与・勤怠・会計のワンクリック連携
打刻データから給与を自動計算し、その結果を会計ソフトへ仕訳として自動連携します。手入力のステップがほぼなくなるため、転記ミスの削減と月次締め作業の大幅な時短につながります。

おすすめ製品3選

freee人事労務
おすすめの理由
勤怠打刻から有給管理・給与計算・年末調整・社保手続きまでを1つのサービスで完結でき、中小企業のシェアが非常に高い統合型の代表格です。
価格
2,000円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
弥生給与Next
おすすめの理由
老舗ブランドの安心感と業界最安水準の価格設定が魅力で、はじめて給与計算ソフトを導入する小規模企業から支持されています。有給管理機能も標準搭載です。
価格
9,000円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
マネーフォワード クラウドERP
おすすめの理由
給与・勤怠・会計・経費・請求書など幅広いクラウドサービスをシリーズで展開しており、成長フェーズの企業が段階的に機能を拡張しやすい点が強みです。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

大企業向けERP・人事給与パッケージタイプ 🏛️

このタイプが合う企業:

従業員数が数百名〜数万名規模の中堅・大企業で、複雑な就業規則や複数法人管理に対応する必要がある企業の方に向いています。

どんなタイプか:

数百名〜数万名規模の従業員を抱える企業に対応できる、高機能な人事給与パッケージやERP製品のグループです。複雑な給与体系・複数法人・グループ会社間の横断管理など、中小企業向け製品ではカバーしきれない要件を満たせるのが最大の特長といえます。FitGapとしては、有給管理においても「半日・時間単位取得」「積立年休」「グループ共通ルールと法人別ルールの併用」など、きめ細かい設定が求められる企業にはこのタイプが第一候補になると見ています。導入には一定のコストと期間が必要ですが、人事制度の変更にもシステム側で柔軟に追従できるメリットがあります。

このタイプで重視すべき機能:

⚙️複雑な有給ルールのマスタ設定と積立年休管理
法定有給に加え、半日・時間単位の取得区分や特別休暇、積立年休(失効有給の繰越)などを柔軟にマスタ設定できます。雇用形態ごとに異なるルールも一括管理でき、大規模組織の運用に耐える設計です。
🏗️グループ会社・複数法人の給与一括処理
法人ごとに異なる給与体系・社会保険適用を管理しつつ、グループ全体の人件費をまとめて集計・分析できます。出向者の按分計算など大企業特有の処理にも対応しています。

おすすめ製品3選

奉行クラウド HR DX Suite
おすすめの理由
OBCの長年の実績をベースに、人事・給与・勤怠・労務をクラウドで一体提供し、中堅〜大企業の複雑な運用要件にも柔軟に対応できる定番パッケージです。
価格
18,750円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
COMPANY 給与計算システム
おすすめの理由
大手企業の約3社に1社が導入しているといわれる実績を持ち、複雑な給与制度や大量の従業員データ処理に強みがあります。有給管理も詳細に設定可能です。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
国産ERPとして人事給与・会計・販売管理までをカバーし、グループ経営管理に必要な機能を幅広く備えています。大企業の基幹システムとして導入実績が豊富です。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

給与BPO・アウトソーシング連携タイプ 📋

このタイプが合う企業:

社内に給与・労務の専任者がいない、または属人化による業務リスクを解消したい企業の方に向いています。IPO準備中で内部統制を強化したいケースにもフィットします。

どんなタイプか:

給与計算や有給管理の実務そのものを外部の専門スタッフに委託する「BPO(ビジネス・プロセス・アウトソーシング)」を前提としたサービス群です。FitGapでは、社内に給与計算の専任担当者を置けない企業や、属人化リスクを根本的に解消したい企業にとって有力な選択肢になると考えています。有給の付与計算や取得状況の管理もBPOベンダーが代行してくれるため、法改正への対応漏れや管理ミスのリスクを大幅に減らせます。自社でソフトを運用するタイプと異なり、運用負荷を外部に移せる点が最大の違いです。

このタイプで重視すべき機能:

🤝有給管理を含む給与業務のフルアウトソーシング
毎月の給与計算だけでなく、有給の自動付与・残日数管理・取得促進アラートの運用まで外部の専門チームに一括委託できます。社内担当者はチェック・承認のみで済むため、コア業務に集中しやすくなります。
📜法改正・制度変更への自動追従
労働基準法の改正や社会保険料率の変更などをBPOベンダー側が責任を持ってシステムに反映します。自社で法改正情報を追いかける負担がなくなるため、コンプライアンスリスクを大きく下げられます。

おすすめ製品3選

おすすめの理由
三菱総研DCSが提供する給与BPOサービスで、大企業を中心に豊富な受託実績があります。有給管理を含む人事給与業務をフルアウトソーシングできる点が強みです。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
PROSRV on Cloud
おすすめの理由
PROSRVのクラウド版として、BPOのメリットはそのままに導入期間の短縮とコスト最適化を実現しています。中堅企業にも利用しやすいサービス設計です。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
PCAクラウド給与
おすすめの理由
会計事務所との連携に強みを持つPCAブランドのクラウド給与ソフトで、税理士・社労士へ業務を一部委託しながら運用する企業から高い支持を得ています。
価格
13,860円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

🔗勤怠管理との連携・一体化
有給の取得データを勤怠管理と自動連携できるかは、製品選定で最も差が出るポイントです。一体型なら申請・承認から給与計算まで二重入力なしで完結しますが、給与計算特化型では外部連携が必要になります。自社の勤怠管理方法に合った連携範囲を見極めてください。
🤖有給の自動付与・残日数自動計算
入社日や勤続年数に応じた有給休暇の自動付与と残日数の自動計算に対応しているかは、運用負荷を大きく左右します。FitGapでは、一斉付与と入社日基準付与の混在に対応できるかまで確認することをおすすめします。
時間単位・半日単位の有給取得管理
時間単位や半日単位での有給取得を認めている企業は増えていますが、すべての給与計算ソフトがこの最小取得単位に対応しているわけではありません。自社の就業規則で認めている取得単位をカバーできるか、必ず確認してください。
🔔年5日取得義務の管理・アラート機能
労働基準法により年5日の有給取得が義務化されていますので、取得が不足している従業員を自動検知してアラート通知できる機能は非常に重要です。管理者だけでなく従業員本人にも通知が届く製品を選ぶと、取得促進がスムーズに進みます。
📋年次有給休暇管理簿の自動作成
企業には有給休暇管理簿の作成と3年間の保存が義務付けられています。ボタン一つで管理簿を出力できる製品とそうでない製品では、管理工数に大きな差が出ます。FitGapとしては、この機能の有無を必ずチェックしていただきたいです。
🏖️特別休暇・独自休暇の柔軟な設定
リフレッシュ休暇や慶弔休暇など、企業独自の休暇制度をシステムに登録して管理できるかどうかも、選定の分かれ目になります。設定の自由度が低いと手作業が残り、導入効果が半減してしまいます。

一部の企業で必須

有給取得の申請・承認ワークフロー
従業員がシステム上で有給申請し、上長がオンラインで承認できるワークフロー機能です。紙やメールでの申請運用をしている企業にとっては業務改善効果が大きいですが、既に別の申請システムがある場合は不要なこともあります。
👥パートタイマーの比例付与計算
パート・アルバイトなど所定労働日数が少ない従業員がいる場合、法定の比例付与日数を自動計算できる機能が必要です。正社員のみの企業では優先度が下がりますが、多様な雇用形態を抱える企業では必須になります。
🔄有給繰越・失効の自動処理
2年間の有効期限を超えた有給の失効処理や、翌年への繰越計算を自動で行う機能です。従業員数が多い企業ほど手作業でのミスリスクが高まるため、数十名以上の規模では重要度が上がります。
📱従業員セルフサービス(残日数確認)
従業員自身がスマホやPCから有給の残日数や取得履歴をいつでも確認できる機能です。問い合わせ対応の削減と取得促進につながりますが、小規模な事業所では口頭確認で済む場合もあります。
🏦積立休暇(失効有給の積立)
失効する有給休暇を積立休暇として別管理できる機能です。福利厚生の一環として積立休暇制度を設けている企業には必要ですが、制度がなければ不要です。

ほぼ全製品が対応

📄給与明細の自動作成・配信
毎月の給与明細をシステムから自動作成し、Web配信やPDF出力できる機能です。ほぼすべての給与計算ソフトに標準搭載されていますので、この機能自体で製品を絞り込む必要はありません。
🧮社会保険料・税金の自動計算
所得税・住民税・社会保険料・雇用保険料などの控除額を自動計算する機能です。給与計算ソフトの基本機能として、どの製品でも対応しています。
⚖️法改正への自動アップデート
税率や保険料率の改定があった際にシステムが自動で反映される機能です。クラウド型の製品であればほぼ標準で対応していますので、製品選定の差別化要因にはなりにくいです。
🎄賞与計算・年末調整
賞与の計算処理や年末調整に対応する機能です。給与計算ソフトとしては基本機能に含まれるため、どの製品を選んでも利用できます。

優先度が低い

🗂️組織図の自動作成
人事情報から組織図を自動生成する機能です。あると便利ですが、有給管理や給与計算の正確性とは直接関係しないため、選定時の優先度は低くなります。
🌐多言語対応(英語表示など)
システムの画面を英語など他言語で表示できる機能です。外国人従業員が多い企業では役立ちますが、大多数の国内企業にとっては選定の決め手にはなりません。

有給管理の給与計算ソフトの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

有給管理対応の給与計算ソフトを導入する際、どのような点に注意すべきですか?
有給管理対応の給与計算ソフトは業務効率化に役立つ一方で、「初期設定の複雑さと時間的負担」や「既存データの移行における精度確保」といった点を事前に理解しておくことが重要です。初期設定の複雑さと時間的負担については、有給管理システムの初期設定は、企業の就業規則や有給制度に合わせた詳細なカスタマイズが必要です。既存データの移行における精度確保については、従来の管理方法から新システムへのデータ移行では、データの整合性確保が大きな課題となります。このほか「従業員への教育と運用定着の困難さ」「システムの技術的制約と柔軟性の限界」「セキュリティと個人情報保護の責任増大」なども、事前に確認しておくことをおすすめします。

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