e-Tax対応の給与計算ソフトおすすめ9選｜タイプ別の選び方ガイド

更新：2026/5/13

給与計算ソフトのe-Tax対応と一口に言っても、実際の製品は「e-Tax用データをCSV出力するだけのもの」から「ソフト内のボタン一つでe-Taxへ直接送信できるもの」まで対応レベルに大きな幅があります。さらに、年末調整の電子化やeLTAXへの給与支払報告書提出まで一気通貫で処理できるかどうかも製品ごとに異なります。FitGapでは、企業規模と給与体系の複雑さという2つの軸で製品を3タイプに分類し、タイプごとの代表製品の紹介から要件定義・選定手順まで、初めてのe-Tax電子申告でも迷わず製品を選べるようガイドしています。

レビュー担当 加藤杏奈

業務システムベンダーでCOMPANY・リシテア等の人事・給与・勤怠システムの導入支援に5年間従事。要件確認・設定・テスト・保守対応まで一連の工程を経験し、制度と運用の両面を踏まえた評価を行っている。

FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

経費精算システムのおすすめ製品を製品ごとにタイプ、料金、企業規模、評価ポイントで比較する表
製品名	タイプ	料金	企業規模	評価ポイント
freee人事労務	中小企業向けクラウド一体型タイプ 🌤️	2,000円月	中小中堅大企業	専門知識が少なくても使いやすい。中小企業シェアがトップで少人数運用に強い。
弥生給与Next	中小企業向けクラウド一体型タイプ 🌤️	9,000円年	中小中堅大企業	弥生シリーズで給与から勤怠・労務・会計へ段階拡張でき、中小企業シェアもトップ。
マネーフォワードクラウド年末調整	中小企業向けクラウド一体型タイプ 🌤️	2,980円月	中小中堅大企業	既存給与ソフトを残して年末調整だけクラウド化。導入が容易で電子申告まで対応。
PCAクラウド給与	中堅企業向け給与専門タイプ 🏢	13,860円月	中小中堅大企業	人事・勤怠・会計とつなげられる。PCAシリーズ併用の給与運用に強い。
給料王	中堅企業向け給与専門タイプ 🏢	44,000円本	中小中堅大企業	給与・年末調整を一つのソフトで処理。低コストで社労士連携にも対応。
給与大臣NX Super	中堅企業向け給与専門タイプ 🏢	要問合せ	中小中堅大企業	高度な権限制御・操作ログ・部門別配賦まで対応。給与業務を厳密に管理できる。
COMPANY 給与計算システム	大企業向けERP・統合人事タイプ 🏗️	要問合せ	中小中堅大企業	海外拠点・複数通貨まで給与を統合管理。大企業シェアトップで大規模運用に強い。
PROSRV	大企業向けERP・統合人事タイプ 🏗️	要問合せ	中小中堅大企業	給与システムと業務代行を段階的に選択できる。大企業シェアトップで外部化に強い。
POSITIVE	大企業向けERP・統合人事タイプ 🏗️	要問合せ	中小中堅大企業	人事・給与・勤怠・タレント管理を一体化。大企業の人材データ活用に強い。

タイプ別おすすめ製品

中小企業向けクラウド一体型タイプ 🌤️

このタイプが合う企業：

従業員300名以下の中小企業やスタートアップで、バックオフィスの人数が限られており、給与計算から電子申告まで1つのサービスで済ませたい企業

どんなタイプか：

給与計算、年末調整、法定調書作成、e-Tax連携をクラウド上で一体化するタイプです。画面案内に沿って電子申告用データまで出力できる点が特徴です。

このタイプで重視すべき機能：

📋年末調整のWeb回収・自動計算

Web入力された控除申告をもとに保険料・扶養控除を自動計算し、紙回収や転記を減らします。

📤e-Tax・eLTAX向けデータ一括出力

源泉徴収票や法定調書、給与支払報告書を電子申告ソフトへ取り込める形式で出力します。