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CSV取り込み対応の給与計算ソフトおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026年03月05日
給与計算ソフトと一口に言っても、勤怠データのCSV取り込みひとつとっても製品ごとの対応力には大きな差があります。レイアウトを自由にマッピングできる製品もあれば、指定フォーマットへの加工が毎月必要な製品もあり、この違いが日々の業務負荷を左右します。さらに近年は、CSV運用からAPI自動連携へ段階的に移行できる製品や、給与計算をERPの一部として統合管理できる製品も増えており、選択肢はますます多様化しています。FitGapでは、こうした製品の違いを「人事労務一体型」「給与計算特化型」「ERP統合型」の3タイプに整理し、要件定義から最終選定までを具体的にガイドします。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
人事労務と一体管理できるタイプ 🧑‍💼
freee人事労務
/ マネーフォワード クラウド給与
/ 弥生給与Next
給与計算の精度・柔軟性に特化したタイプ 🎯
給与奉行クラウド
/ PCAクラウド給与
/ 給料王
ERP・統合管理で全社最適化するタイプ 🏢
マネーフォワード クラウドERP
/ COMPANY 給与計算システム
/ ProActive C4
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
関連カテゴリ
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タイプ別お勧め製品

人事労務と一体管理できるタイプ 🧑‍💼

このタイプが合う企業:

従業員数10〜300名程度の中小企業で、給与計算・勤怠管理・社会保険手続きなどをバラバラのツールで運用していて一元化したい企業の人事・総務担当者の方

どんなタイプか:

給与計算だけでなく、勤怠管理・労務手続き・年末調整などの人事労務業務をひとつのシステムで完結できるタイプです。CSVで勤怠データや従業員情報を取り込むのはもちろん、同シリーズの勤怠管理や労務管理とつなげることで、手入力を大幅に減らせます。FitGapでは、給与計算の前後に発生する人事業務もまとめて効率化したい企業にとって、最も満足度の高い選択肢になると考えています。

このタイプで重視すべき機能:

🔗シリーズ連携による勤怠データ自動取り込み
同じベンダーの勤怠管理システムや労務管理システムとワンクリックで連携でき、CSVを手動で加工・取り込みする手間を省けます。他社の勤怠ツールを使っている場合でもCSVレイアウトの柔軟な設定に対応しているため、既存環境を変えずに導入しやすいのが特長です。
📋年末調整・社会保険のワンストップ処理
毎月の給与計算データをそのまま年末調整や社会保険届出に活用でき、従業員がWeb上で申告書を提出するだけで手続きが完了します。紙の回収・転記が不要になるため、年末の繁忙期の負担を大きく減らせます。

おすすめ製品3選

freee人事労務
おすすめの理由
給与計算・勤怠・労務・年末調整をオールインワンで提供し、CSV取り込みにも対応。中小企業でのシェアが高く、初心者でも直感的に操作できる点が支持されています。
価格
2,000円
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
マネーフォワード クラウド給与
おすすめの理由
勤怠データや従業員情報のCSV一括取り込みに対応し、同シリーズの勤怠・会計・社会保険とのシームレスな連携が強み。幅広い企業規模で導入実績があります。
価格
2,480円
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
弥生給与Next
おすすめの理由
2023年リリースのクラウド型で、CSVによる勤怠データ取り込みに対応。弥生ブランドの信頼性と初心者向けのわかりやすい操作画面が評価されており、100名規模までの企業に特化しています。
価格
9,000円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

給与計算の精度・柔軟性に特化したタイプ 🎯

このタイプが合う企業:

手当の種類や計算ルールが複雑な企業、パート・アルバイトが多く雇用形態が多様な企業、または税理士・社労士事務所で複数社の給与計算を代行している方

どんなタイプか:

複雑な給与体系や多様な雇用形態への対応力に優れたタイプです。正社員・パート・日給制・複数事業所といった条件が入り組んだ企業でも、CSV取り込みで大量の勤怠データを正確に反映し、きめ細かい計算ルールを設定できます。FitGapとしては、手当や控除のパターンが多い企業、あるいは独自の給与規定を持つ企業には、このタイプが最も実用的だと感じています。

このタイプで重視すべき機能:

⚙️給与体系ごとのカスタム計算式設定
支給・控除項目を自由に追加でき、計算式も企業独自のルールに合わせて細かく設定できます。CSVで取り込んだ勤怠データに対して、雇用形態別の計算ロジックを自動適用できるため、手作業での調整が不要になります。
📄CSVレイアウトの自由設計
取り込むCSVファイルの列順や項目名を自由にマッピングできるため、既存の勤怠管理システムや外部ツールから出力されたCSVをそのまま使えます。フォーマット加工の手間がなくなり、毎月のデータ連携がスムーズになります。

おすすめ製品3選

給与奉行クラウド
おすすめの理由
CSV取り込み機能の評価が最も高く、指定フォルダへの保存だけで自動取り込みする仕組みが特長。複雑な給与体系への対応力と豊富な帳票作成機能で、中堅企業を中心に高いシェアを持っています。
価格
5,500円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
PCAクラウド給与
おすすめの理由
100におよぶ給与項目を自由に設定可能で、パートタイマー対応の有給付与計算にも対応。他社勤怠ソフトやタイムレコーダーからのCSVデータ取り込み実績が豊富です。
価格
13,860円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
中小・小規模事業者向けに特化しつつ、給与体系のカスタマイズ性が高い。法令改正への自動対応や手厚い電話サポートが評価され、初めてでも安心して導入できます。
価格
44,000円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

ERP・統合管理で全社最適化するタイプ 🏢

このタイプが合う企業:

従業員数300名以上の中堅〜大企業で、給与計算だけでなく会計・経費精算・販売管理なども含めてシステムを統合したい企業、またはグループ会社の給与を一括管理したい企業

どんなタイプか:

給与計算を会計・販売管理・人材管理などの基幹業務と統合し、企業全体のデータを一元管理できるタイプです。CSVでの外部データ取り込みだけでなく、ERP内の各モジュール間でデータが自動連携するため、部門をまたいだ情報活用が進みます。FitGapでは、従業員数が多くグループ会社や複数拠点を抱える企業には、このタイプが長期的に最もコストパフォーマンスが高いと考えています。

このタイプで重視すべき機能:

🔄基幹業務モジュールとのデータ統合
会計・販売管理・経費精算など他の業務システムと共通のデータベースで連携するため、給与データが自動的に仕訳や経費に反映されます。CSVで外部データを取り込む場合も、統一されたマスタで整合性が保たれます。
🌐複数会社・複数拠点の一括給与処理
グループ企業や複数拠点の給与計算をひとつのシステム上でまとめて処理でき、拠点ごとに異なるCSVフォーマットにも対応します。シェアードサービスとしての運用にも耐えうる処理性能を備えています。

おすすめ製品3選

マネーフォワード クラウドERP
おすすめの理由
給与計算を含むバックオフィス業務を統合管理でき、CSV取り込みにも幅広く対応。中堅企業から大企業まで導入が拡大しており、同シリーズ間の連携のしやすさが強みです。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
COMPANY 給与計算システム
おすすめの理由
4万名規模の給与計算を10分以内で処理できる高性能が特長。大企業やシェアードサービスでの導入実績が豊富で、複雑な給与体系やマルチカンパニー運用にも対応します。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
給与計算から会計・経費精算・勤怠管理まで一気通貫でカバーするERP。大企業の多様な人事制度や雇用形態に対応し、ナビゲーション形式の操作画面で業務フローがわかりやすいのが特長です。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

📐CSVレイアウトの自由設計
勤怠管理システムから出力されるCSVの列順や項目名は製品ごとに異なります。取り込み側でレイアウトを自由にマッピングできるかどうかが、毎月の加工作業をゼロにできるかの分かれ目です。FitGapでは、ここが最も差が出る要件だと考えています。
🔗勤怠システムとのAPI連携
CSV取り込みだけでなく、KING OF TIMEやジョブカンなど主要勤怠システムとAPI連携できる製品を選ぶと、将来的にCSV運用から自動連携へスムーズに移行できます。現時点でCSV運用でも、API対応の有無は必ず確認しておきましょう。
⚙️給与体系の柔軟な設定
月給・日給・時給の混在や独自手当の計算式など、自社の給与規定にどこまで合わせられるかは製品によって大きく異なります。特に複数の雇用形態を抱える企業は、計算ルールのカスタマイズ性を重点的にチェックしてください。
👥対応できる従業員規模
小規模事業者向けの製品は数十名までを想定した設計になっており、数百名を超えると処理速度や管理機能が不足するケースがあります。逆に大企業向け製品は小規模企業には高コストになりがちですので、自社の人数帯に合った製品を選ぶことが大切です。
🧾年末調整の電子化対応
年末調整をWeb上で完結できるかどうかは、年に一度とはいえ業務負荷に大きく影響します。従業員がオンラインで控除申告書を提出でき、そのデータがそのまま給与計算に反映される製品を選ぶと、紙の回収・入力の手間を大幅に削減できます。
📒会計ソフトへの仕訳連携
給与計算後の仕訳データを会計ソフトへスムーズに渡せるかも見落としがちなポイントです。CSV出力やAPI連携で仕訳を自動作成できれば、経理担当者の二重入力が不要になります。FitGapとしては、勤怠側だけでなく会計側との連携も必ず確認すべきと考えます。

一部の企業で必須

🏛️社会保険の電子申請(e-Gov連携)
算定基礎届や月額変更届などの届出を電子申請で提出したい場合に必要です。社労士に手続きを委託していない企業では、この機能があると届出業務の工数を大きく減らせます。
📱Web給与明細の配信
従業員にスマホやPCから給与明細を閲覧させたい場合に必要です。紙の印刷・配布コストを削減できるだけでなく、リモートワーク環境にも対応しやすくなります。全社ペーパーレス化を進めている企業には優先度が高い要件です。
🏦全銀フォーマット(FB)データ出力
給与振込を銀行の総合振込サービスで行う場合、全銀協フォーマットのFBデータを出力できる製品が必要です。手動で振込データを作成している企業は、この機能の有無で振込業務の工数が大きく変わります。
🔒マイナンバー管理
源泉徴収票の作成などでマイナンバーが必要になるため、給与計算ソフト上で安全に収集・保管したい場合に重要です。別途マイナンバー管理ツールを導入済みの企業であれば、給与計算ソフト側の対応は必須ではありません。
🏢複数事業所・複数法人の管理
拠点やグループ会社が複数ある企業では、一つの管理画面から複数事業所の給与計算を横断的に処理できるかが重要です。単一事業所の企業であればこの機能は不要ですので、自社の組織構造に合わせて判断してください。

ほぼ全製品が対応

🔢社会保険料・所得税の自動計算
健康保険料・厚生年金・雇用保険料・所得税などの自動計算は、現在販売されているほぼすべての給与計算ソフトが標準で対応しています。この機能の有無で差がつくことはほとんどありません。
📜法改正・料率変更の自動アップデート
毎年の税率改定や社会保険料率の変更に自動対応する仕組みは、クラウド型を中心にほぼ全製品が備えています。設定漏れのリスクを心配する必要がない点は、給与計算ソフト導入の大きなメリットです。
💰賞与計算
賞与の支給額計算や賞与明細の発行は、ほぼすべての給与計算ソフトで対応しています。賞与計算のためだけに製品を選ぶ必要はありません。
📥CSV取り込み
今回のテーマであるCSV取り込み機能自体は、主要な給与計算ソフトの大半が対応しています。ただし前述のとおり、レイアウトの自由度や対応フォーマットには製品ごとの差がありますので、そちらを重点的に比較してください。

優先度が低い

🗂️組織図の自動作成
従業員データから組織図を自動生成する機能は、人事管理ツールや労務管理システム側で対応できるケースが多く、給与計算ソフトに求める優先度は低いです。
🤖AIメニュー・AI-OCR機能
利用頻度に応じたメニュー表示の最適化や、紙の申告書をAI-OCRで読み取る機能は便利ですが、給与計算の正確性や効率化に直結する要件ではありません。あれば嬉しい程度の位置づけです。

CSV取り込みの給与計算ソフトの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

CSV取り込み対応の給与計算ソフトを導入する際、どのような点に注意すべきですか?
CSV取り込み対応の給与計算ソフトをスムーズに導入するカギは、「データ形式とフィールド定義の統一」と「データ品質管理と検証体制の構築」を事前に把握しておくことです。データ形式とフィールド定義の統一については、既存システムから出力されるCSVファイルの形式と給与計算ソフトが要求するデータ形式が一致しない場合があります。データ品質管理と検証体制の構築については、取り込まれたデータに欠損や異常値が含まれていても、システムが自動的に判断することは困難な場合があります。このほか「セキュリティとアクセス権限の管理」「システム間連携の複雑性と運用負荷」「導入時のデータ移行とテスト期間」なども、事前に確認しておくことをおすすめします。

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