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医療・福祉向け在庫管理システムおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/5/29
医療・福祉の在庫管理システムは、一般的な倉庫管理とは異なり、使用期限・ロット番号の追跡や電子カルテとの連携など業界固有の要件が求められます。さらに近年はAIによる処方実績ベースの需要予測や、GS1バーコードを活用した医事請求漏れ防止など、単なる在庫の数量管理を超えた機能が標準になりつつあります。しかし製品ごとに得意領域は大きく異なり、調剤薬局向けの医薬品特化型から、医療材料・消耗品まで幅広くカバーする販売在庫一体型、さらにグループ病院全体を統合するERP型まで多様です。FitGapでは「管理対象の物品範囲」と「施設規模」という2つの軸で3タイプに整理し、選び方をガイドします。
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FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
調剤薬局・クリニック向け医薬品在庫特化タイプ💊
Retriever
/ freee販売
/ 弥生販売
医療法人・福祉施設の販売在庫一体管理タイプ🏥
弥生販売ネットワーク
/ OBIC7 販売情報ソリューション
/ Convi.BASE
大規模病院グループ向けERP・サプライチェーン統合タイプ⚙️
OBIC7 生産情報システム
/ Dynamics 365 Supply Chain Management
/ Oracle ERP
企業規模
個人事業主
その他
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おすすめ製品の早見表

タイプ別おすすめ製品 9

医療、福祉向けの在庫管理・倉庫管理システムのおすすめ製品を製品ごとにタイプ、料金、企業規模、評価ポイントで比較する表
製品名タイプ料金企業規模評価ポイント
Retriever
調剤薬局・クリニック向け医薬品在庫特化タイプ💊
150,000円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

需要予測と店舗間移動で薬局在庫を本部で最適化。医療・福祉分野のシェアもトップ。

freee販売
調剤薬局・クリニック向け医薬品在庫特化タイプ💊
3,980円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

小規模医療法人の請求・売上管理をクラウド化。freee会計との連携で入金まで管理。

弥生販売
調剤薬局・クリニック向け医薬品在庫特化タイプ💊
36,700円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

物販の売上・仕入・在庫を弥生会計と連携して管理。中小企業シェアもトップ。

弥生販売ネットワーク
医療法人・福祉施設の販売在庫一体管理タイプ🏥
288,000円買い切り
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

複数施設の物品移動と在庫台帳を共有。最大20台で同時利用できる。

OBIC7 販売情報ソリューション
医療法人・福祉施設の販売在庫一体管理タイプ🏥
要問合せ
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

販売・仕入・在庫・会計を一体管理。カスタマイズ性が高く中堅・大企業に強い。

Convi.BASE
医療法人・福祉施設の販売在庫一体管理タイプ🏥
20,000円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

医療機器・備品を1点ずつ台帳管理。バーコード棚卸で現場負担を減らせる。

OBIC7 生産情報システム
大規模病院グループ向けERP・サプライチェーン統合タイプ⚙️
要問合せ
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

医薬品・検体の調達と在庫を同じERPで管理。複数施設の購買も本部で扱える。

Dynamics 365 Supply Chain Management
大規模病院グループ向けERP・サプライチェーン統合タイプ⚙️
31,484円ユーザー/月
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

在庫・購買・物流をMicrosoft基盤で統合。需要予測や施設横断分析まで対応。

Oracle ERP
大規模病院グループ向けERP・サプライチェーン統合タイプ⚙️
要問合せ
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

財務・調達・在庫をOracle Cloudで統合。多通貨・監査対応と権限管理に強い。

タイプ別おすすめ製品

調剤薬局・クリニック向け医薬品在庫特化タイプ💊

このタイプが合う企業:

調剤薬局、個人クリニック、小規模病院の薬剤部門など、医薬品の在庫管理・発注業務を効率化したい方

どんなタイプか:

調剤薬局や小規模クリニックの医薬品在庫に特化したタイプです。処方実績に基づく需要予測、自動発注、期限・ロット管理、卸やレセコン連携を扱います。

このタイプで重視すべき機能:

📊処方実績に基づく需要予測・自動発注
過去の処方データから発注量を予測し、発注点に達した医薬品をリスト化して欠品や過剰在庫を抑えます。
🔍使用期限・ロット番号のトレーサビリティ管理
使用期限とロット番号を一元管理し、期限切迫品の警告や品質問題時の追跡をしやすくします。

おすすめ製品3選

Retriever
おすすめの理由
Retrieverは、調剤薬局チェーンの医薬品在庫を本部主導で最適化する、同タイプ内では最も医薬品管理に寄った製品です。使用期限順の払い出しを支える期限管理・FEFO、廃棄期限通知、ロット管理・ロットトレース、リコール、医薬コードに対応し、FitGapでは医療、福祉シェアがカテゴリ129製品中1位です。処方履歴を使った需要予測補充や店舗間移動管理も備えるため、複数店舗の発注量、不動在庫、廃棄ロスを本部で見たい薬局に向きます。一方、許可証管理、GMPラベル管理、温湿度記録・アラートは非対応です。単独クリニックには過剰になりやすく、治験薬や麻薬・向精神薬まで厳密に電子管理したい大規模病院は別製品も比べる必要があります。
価格
150,000円
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
freee販売は、医薬品在庫を深く管理する製品というより、自由診療や物販を行うクリニックの請求・売上管理をクラウドで軽く整える製品です。請求書発行、入金消込、freee会計との連携をまとめやすく、FitGapでは操作性・導入しやすさ・料金評価が同ページのおすすめ製品内で1位です。医薬コードには対応するため、美容医療材料やサプリメントなどを販売品として扱う小規模医療法人には候補になります。一方、ロット管理、期限管理、FEFO、廃棄期限通知は非対応で、保険調剤の期限切れ防止やロット単位の回収には向きません。医薬品在庫を本格管理する薬局はRetriever、販売・在庫を弥生系でまとめたい場合は弥生販売と比べると選びやすいです。
価格
3,980円
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
弥生販売は、弥生シリーズの画面でクリニックの物販売上・仕入・在庫と会計連携をまとめる、freee販売より在庫管理寄りの販売管理ソフトです。請求書・納品書、仕入、在庫評価、バックオーダ管理まで扱え、FitGapでは操作性と料金評価が同ページのおすすめ製品内で1位、サポート評価も上位です。医薬コードや検疫在庫管理に対応し、ロット管理とラベルテンプレート設計は追加オプションのため、医療消耗品や自由診療関連商品の管理を弥生会計と合わせたい小規模〜中小医療法人に向きます。一方、期限管理、FEFO、廃棄期限通知、特定医薬品管理、許可証管理は非対応です。調剤薬局の使用期限順払い出しや麻薬・向精神薬管理まで必要なら、Retrieverを優先して比べる方が合います。
価格
36,700円
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

医療法人・福祉施設の販売在庫一体管理タイプ🏥

このタイプが合う企業:

中規模病院、介護施設、社会福祉法人など、医薬品以外の物品も含めた在庫と購買コストを一括管理したい事業者

どんなタイプか:

医薬品に加え、医療材料・消耗品・福祉用具まで販売在庫を一体管理するタイプです。多品目・多部門の在庫と仕入コストを横断して把握できます。

このタイプで重視すべき機能:

📦多品目・多部門の在庫一元管理
品目カテゴリや部門・拠点をまたいで在庫を可視化し、二重発注や欠品を防ぎます。
💰仕入・購買コストの可視化と分析
仕入先別の単価や購買金額を分析し、価格交渉や部門別コスト把握に使えます。

おすすめ製品3選

弥生販売ネットワーク
おすすめの理由
弥生販売ネットワークは、拠点や担当者が増えた医療法人でも販売伝票と在庫台帳を同じ基盤で扱える、弥生販売のネットワーク版です。複数ユーザーの同時入力・照会に加え、多拠点在庫管理、施設間の物品移動、入荷待ちを管理するバックオーダに対応するため、中規模クリニックや介護・福祉施設が本部で物品の出入りをそろえたい場合に向きます。FitGapでは医療・福祉シェアが9製品中2位、操作性1位、料金2位で、運用負荷と費用を抑えたい法人にも候補にしやすい製品です。一方、ロット管理、期限管理、期限の近いものから出すFEFO、廃棄期限通知、許可証管理、特定医薬品管理は非対応で、サーバー環境の準備も必要です。医薬品の期限や規制物品まで厳密に管理したい法人は、他製品との比較が欠かせません。
価格
288,000円
買い切り
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
OBIC7 販売情報ソリューション
おすすめの理由
OBIC7 販売情報ソリューションは、販売・仕入・在庫・会計を一体で管理し、大きな組織の業務に合わせて作り込める販売管理基盤です。医療法人本部で複数施設の物品を統制したい場合、ロケーション管理、多層ロケーション、ロット・シリアル管理、期限管理、期限の近いものから出すFEFO、許可証管理、特定医薬品管理まで扱えるため、規制物品や医薬品を含む運用に向きます。FitGapでは中堅企業・大企業シェアが9製品中1位で、機能性やセキュリティ評価も上位です。独自業務へのカスタマイズや導入コンサルを前提に、病院グループ規模で販売在庫を統合したい法人に合います。一方、価格は問い合わせ型で初期投資・保守費用が重く、運用にも専門支援が必要です。単一クリニックや小規模介護施設は、弥生販売ネットワークなど軽量な候補も比較した方がよいです。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
Convi.BASEは、販売伝票中心の在庫管理よりも、バーコードやICタグで医療機器・福祉用具などの現物を1点ずつ追跡する固定資産・物品管理に強いクラウドサービスです。病棟や施設に分散する備品を台帳化し、シリアル番号、保有部署、点検・廃棄期限をひも付けたい医療法人に向きます。FitGapでは導入しやすさ・操作性が9製品中1位、料金・サポート・セキュリティも2位で、現場職員が棚卸や貸出記録を回しやすい点が魅力です。シリアル管理、期限管理、廃棄期限通知、許可証管理、特定医薬品管理に対応し、在庫APIで既存システム連携も検討できます。一方、基本在庫数管理、多拠点在庫管理、ロット管理、リアルタイム在庫更新、在庫予約引当は追加オプションです。消耗品の発注や売上連動の引当まで主軸にする場合は、弥生販売ネットワークやOBIC7との併用・比較が必要です。
価格
20,000円
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

大規模病院グループ向けERP・サプライチェーン統合タイプ⚙️

このタイプが合う企業:

大規模病院グループ、複数施設を運営する医療法人・社会福祉法人、独立行政法人など、基幹業務全体の統合管理を必要とする組織

どんなタイプか:

複数施設の在庫・購買・会計などをERPで統合するタイプです。施設間の在庫融通、共同購買、基幹業務連携まで含めてサプライチェーンを管理します。

このタイプで重視すべき機能:

🔗グループ施設横断のサプライチェーン最適化
複数施設の在庫を一元化し、余剰在庫の融通や共同購買で調達をまとめ、購買条件を見直しやすくします。
🏢会計・人事など基幹業務との統合連携
在庫データを会計・人事などとつなぎ、購買から支払い、原価把握までの二重入力を減らします。

おすすめ製品3選

OBIC7 生産情報システム
おすすめの理由
OBIC7 生産情報システムは、国産ERPとして物資調達・在庫・会計周辺までを同じ基盤に寄せやすい、大規模病院グループ向けの統合型製品です。医薬コード、許可証、特定医薬品、QP判定、検体管理に対応し、ロット・期限・温度帯管理や定数棚補充も扱えるため、病棟ごとの定数管理と本部購買を一体で運用したい法人に向きます。FitGapでは大企業シェアが同タイプ内で単独1位で、複数施設の購買量をまとめたい組織と相性があります。一方、在庫APIやWebhookは非対応のため、電子カルテや外部DBとリアルタイム連携する構想ではDynamics 365 SCMやOracle ERPも比較すべきです。個別見積もりやベンダー調整も前提となるため、小規模施設には重くなりやすい製品です。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
Dynamics 365 Supply Chain Management
おすすめの理由
Dynamics 365 Supply Chain Managementは、Microsoft基盤上で病院グループの在庫・購買・物流データを広くつなげたい場合に候補になるクラウドERPです。温湿度記録アラート、FEFO、廃棄期限通知、LPN管理、SSCC発行・受入、需要予測補充、在庫API、Webhookまで対応し、病棟在庫から本部のサプライチェーン分析まで拡張しやすい点が強みです。FitGapでは同タイプ内で対応範囲が最も広く、Power BIやTeamsを使って施設横断の可視化を内製したい法人に向きます。一方、医療・福祉シェアは6位タイで、SPD業者やレセコンとの個別連携は追加開発を見込む必要があります。Microsoft 365やAzureを全施設で使っていない法人では、教育・運用コストとクラウド前提の業務設計を慎重に確認すべきです。
価格
31,484円
ユーザー/月
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
Oracle ERPは、在庫・購買だけでなく財務、原価、統制まで同じデータ基盤で管理したい大規模病院グループ向けのエンタープライズERPです。医薬コード、許可証、特定医薬品、QP判定、英語監査、多通貨、在庫APIに対応し、輸入医薬品や治験薬を含む調達、海外拠点を含む監査対応まで視野に入る法人に向きます。FitGapの評価では機能性・サポート・セキュリティ・連携拡張性が同タイプ内で1位で、Oracle DBを院内基幹に使う組織ではデータ基盤をそろえやすい点も魅力です。一方、ロケーション管理、FEFO、モバイル棚卸、在庫予約引当、SSCC発行は追加オプションです。病棟現場のSPD運用を標準機能中心で始めたい場合や、費用を抑えたい法人は他製品との比較が欠かせません。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

比較すべき機能の優先度マップ

どこから比較すべきか

製品には数多くの機能がありますが、選定の決め手になるのは一部の機能だけです。そこで各機能を「多くの企業で必要か」と「製品ごとに対応が分かれるか」の2つの軸で4つに分け、比較する順番が分かるように並べました。下の表では、このページに登場した製品が各機能にどう対応しているかを、上から順に確認できます。
標準対応
オプション/条件付き
非対応

選定の決め手

医療・福祉施設で期限切れや取り違えを防ぐには、ロット、使用期限、読取端末、補充判断まで製品差を重点的に確認します。
Retriever
freee販売
弥生販売
弥生販売ネットワーク
OBIC7 販売情報ソリューション
Convi.BASE
OBIC7 生産情報システム
Dynamics 365 Supply Chain Management
Oracle ERP
バーコード・RFID対応
バーコード/QR/RFIDで入出庫・検品ができるか
ロット管理対応
ロット単位で入出庫・在庫管理ができるか
期限管理対応
賞味/使用期限の属性で出荷制御できるか
FEFO対応
期限が早い順(FEFO)で出庫順を自動制御できるか
需要予測補充(AI含む)
需要予測に基づく補充提案ができるか
モバイル棚卸対応
ハンディ/スマホで棚卸ができるか

一部の企業で必須

冷蔵品、特定医薬品、許認可、リコール対応が必要な医療・福祉法人では、規制や品質管理に関わる対応範囲を見ます。
Retriever
freee販売
弥生販売
弥生販売ネットワーク
OBIC7 販売情報ソリューション
Convi.BASE
OBIC7 生産情報システム
Dynamics 365 Supply Chain Management
Oracle ERP
リコール対応
対象ロットの出荷先を即時抽出・出力できるか
温度帯管理
冷蔵/冷凍/常温の温度帯ロケーションを管理できるか
許可証管理
許認可の期限を管理し期限切れアラートできるか
特定医薬品管理
権限制御で特定医薬品の出庫を限定できるか

ほぼ全製品が対応

医療・福祉向けでも、基本的な在庫数、拠点間の共有、検疫区分、医薬コード出力は多くの製品で比較しやすい土台です。
Retriever
freee販売
弥生販売
弥生販売ネットワーク
OBIC7 販売情報ソリューション
Convi.BASE
OBIC7 生産情報システム
Dynamics 365 Supply Chain Management
Oracle ERP
基本在庫数管理
入庫・出庫・棚卸の在庫数を基本機能で管理できるか
多拠点在庫管理
複数倉庫・拠点の在庫を一元管理できるか
検疫在庫管理
検疫対象在庫を別区分として管理できるか
医薬コード対応
医薬コード(HOT等)を帳票へ出力できるか

優先度が低い

一般的な病院・薬局・福祉施設の在庫管理では、越境取引や特殊な会計評価は該当する運用だけ確認すれば十分です。
Retriever
freee販売
弥生販売
弥生販売ネットワーク
OBIC7 販売情報ソリューション
Convi.BASE
OBIC7 生産情報システム
Dynamics 365 Supply Chain Management
Oracle ERP
越境EC対応
通関書類/インボイス等を自動生成できるか
HSコード自動判定
商品属性からHSコードを自動推奨できるか
在庫評価(LIFO)
LIFOで在庫評価ができるか

医療、福祉の在庫管理・倉庫管理システムの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

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よくある質問

医療・福祉の在庫管理で、使用期限やロット番号も追跡できますか?

追跡できます。医療向けの在庫管理は、医薬品や医療材料の使用期限・ロット番号を追跡し、期限切れや取り違えを防げます。RetrieverやConvi.BASEは医療現場の物品管理に対応します。GS1バーコードを活用して医事請求の漏れを防ぐ機能を持つ製品もあり、調剤薬局か病院かで必要な範囲が変わります。

調剤薬局やクリニックの医薬品在庫に特化した製品はありますか?

あります。医薬品在庫に特化した製品は、薬の発注点管理や期限の近い在庫の警告、処方実績に基づく需要予測などに対応します。調剤薬局やクリニックの薬剤部門で、発注業務と在庫の適正化を進めたい場合に向きます。扱う医薬品の種類や規模に合うかを試用で確かめておきましょう。

大規模病院で物品の購買から在庫まで一括管理できますか?

一括管理できます。ERP・サプライチェーン統合型は、医薬品以外の医療材料や事務用品も含めて、購買から在庫、コスト管理までを扱えます。OBIC7やOracle ERPは大規模病院グループの基幹管理に対応します。複数施設を運営する医療法人ほど、統合管理の効果が大きくなります。

医療・福祉向けの在庫管理システムの料金はどのくらいですか?

月数千円から、大規模向けは要問い合わせです。freee販売は月3,980円、Convi.BASEは月20,000円が目安で、弥生販売は年36,700円です。医薬品特化のRetrieverは月150,000円、OBIC7やOracle ERPは個別見積もりです。施設の規模と管理する物品の範囲で費用が変わります。

一般的な在庫管理システムを医療・福祉でそのまま使うと困りますか?

使用期限やロット番号の追跡、電子カルテや医事システムとの連携に対応しない製品では、期限切れや請求漏れを防ぎきれません。数量管理だけの製品では、医療特有の品質管理の要件を満たせないことがあります。調剤か病院か、管理する物品は何かを整理し、医療対応の機能を確かめて選びましょう。

※掲載している機能・対応範囲・料金は一般的な目安です。製品・プラン・契約条件により異なる場合があるため、導入前に各製品の最新の公式情報や比較表でご確認ください。

サービスカテゴリ

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汎用生成AI・エージェント
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エージェントフレームワーク
エージェントオートメーション基盤

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オフィス環境・総務・施設管理
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データ分析・連携