あなたにぴったりの
個人事業主向けの在庫管理・倉庫管理システム
を無料で選定
Q. どちらに当てはまりますか?
個人事業主向けの在庫管理・倉庫管理システムを知りたい
あなたにおすすめ
条件に合う在庫管理・倉庫管理システムを知りたい
在庫の過不足や棚卸し作業を改善したい
現在のシステムで入出庫ミスや在庫差異が多い

個人事業主におすすめ在庫管理・倉庫管理システム9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/5/29
在庫管理・倉庫管理システムと一口に言っても、売上・仕入と在庫を一体で管理する販売管理型から、入出庫の見える化に特化した軽量ツール、さらには業種固有の要件に応える統合型ERPまで、製品の性格は大きく異なります。個人事業主の場合、扱う商品の種類や販売チャネル、すでにお使いの会計ソフトとの相性によって最適な製品タイプが変わるため、「有名だから」で選ぶと機能過多やコスト負担に悩まされがちです。本ガイドでは、製品を3タイプに分類したうえで、要件の優先度整理から具体的な選定ステップまでを順を追って解説します。
続きを読む
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
販売管理一体タイプ 🧾
弥生販売
/ freee販売
/ 販売王
在庫管理特化タイプ 📦
ロジクラ
/ 在庫らくだプロ
/ LOGILESS
業務システム統合タイプ 🏢
商蔵奉行クラウド
/ アラジンオフィス
/ GEN PRODUCTS
企業規模
個人事業主
その他
すべて表示

おすすめ製品の早見表

タイプ別おすすめ製品 9

個人事業主向けの在庫管理・倉庫管理システムのおすすめ製品を製品ごとにタイプ、料金、企業規模、評価ポイントで比較する表
製品名タイプ料金企業規模評価ポイント
弥生販売
販売管理一体タイプ 🧾
36,700円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

販売・在庫を弥生会計までつなげられる。中小企業シェアもトップ。

freee販売
販売管理一体タイプ 🧾
3,980円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

案件別損益と請求・会計をつなげられる。受託型の採算管理に強い。

販売王
販売管理一体タイプ 🧾
44000買い切り
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

買い切り型で月額費用を抑えやすい。複数拠点や店舗在庫にも対応。

ロジクラ
在庫管理特化タイプ 📦
0円~
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

スマホで検品・棚卸まで行える。専用端末なしで現場在庫を始めやすい。

在庫らくだプロ
在庫管理特化タイプ 📦
-
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

買い切り型でPC内に在庫データを保管。低コストで在庫帳簿を残せる。

LOGILESS
在庫管理特化タイプ 📦
20,000円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

ECの受注から在庫引当、出荷指示まで一体管理。自動出荷にも強い。

商蔵奉行クラウド
業務システム統合タイプ 🏢
13,000円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

販売・仕入・在庫を奉行シリーズで統合。サポートも手厚く相談しやすい。

アラジンオフィス
業務システム統合タイプ 🏢
要問合せ
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

業種別テンプレートとカスタマイズに強い。卸売・小売のシェアもトップ。

GEN PRODUCTS
業務システム統合タイプ 🏢
24,300円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

製造・販売・購買まで一体管理。ロットや製番単位の在庫管理にも強い。

タイプ別おすすめ製品

販売管理一体タイプ 🧾

このタイプが合う企業:

物販・卸売を行う個人事業主で、売上管理・仕入管理・在庫管理を一つのソフトにまとめて効率化したい方

どんなタイプか:

見積・受注・売上・仕入・請求と在庫を同じ基盤で扱うタイプです。在庫数量と販売データが連動し、会計ソフト連携まで含めやすい点が特徴です。

このタイプで重視すべき機能:

🔗売上・仕入と在庫の自動連動
売上・仕入データに合わせて在庫数量を自動更新し、手入力の増減処理を減らします。
📊会計ソフト連携による転記レス
売上・仕入データを会計ソフトへ連携し、帳簿転記や確定申告前の整理を減らします。

おすすめ製品3選

弥生販売
おすすめの理由
弥生販売は、弥生会計との連携を軸に見積・受注・売上・請求・入金・仕入・在庫をまとめる、販売管理寄りの在庫管理ソフトです。会計処理まで弥生でそろえたい個人事業主や家族経営の小規模法人なら、二重入力を抑えながら販売と在庫を始めやすく、FitGapでも中小企業シェアが同カテゴリ1位、料金・操作性評価が上位です。電子インボイスや電子帳簿保存法対応もあり、帳票発行から入金管理までPC中心に回す事業者に向きます。一方、バーコード/RFID、期限管理、モバイル棚卸、在庫API・Webhook連携、送り状API連携は非対応で、多拠点在庫やロット管理は追加対応が必要です。複数倉庫やEC受注をハンディ端末で処理したい場合は、販売王や在庫管理特化型も比べるべきです。
価格
36,700円
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
freee販売は、請求書発行・案件別損益・freee会計連携をクラウドでつなぐ販売管理サービスで、在庫管理よりも請求と売上管理の自動化に強い製品です。freee会計で記帳や確定申告を行う個人事業主が、見積・受注・請求・入金消込まで同じ画面で進めたい場合に向き、FitGapでは操作性・導入しやすさ・料金の評価が同ページ内で上位、中小企業シェアも2位です。サービス業、制作、IT、士業のように案件単位で売上・原価・粗利を見たい事業者には選びやすい一方、基本在庫数管理、多拠点在庫、バーコード/RFID、ロット・期限管理、リアルタイム在庫更新、モバイル棚卸、POS連携には対応しません。常時在庫を抱える物販やEC中心なら、弥生販売や販売王、在庫管理特化型を優先して比較した方がよいです。
価格
3,980円
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
販売王は、伝票入力に近い操作感で見積・請求に加えて仕入・在庫まで扱える、PCインストール型の販売管理ソフトです。同じ販売管理一体タイプの中では在庫寄りの機能が厚く、多拠点在庫管理、店舗間移動、ラベル発行、リアルタイム在庫更新、返品不良在庫管理、セット可能数自動計算に対応する点が弥生販売やfreee販売との違いです。FitGapでは料金評価が上位で、操作性・サポートも比較的高く、月額課金を抑えながら複数拠点や店舗在庫を管理したい個人事業主に向きます。一方、バーコード/RFIDは追加対応で、在庫API、Webhook、モバイル棚卸、送り状API、POS連携、需要予測補充は非対応です。ECモール連携やハンディ端末中心の倉庫運用を重視する場合は、在庫管理特化型クラウドも候補に入れるべきです。
価格
44000
買い切り
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

在庫管理特化タイプ 📦

このタイプが合う企業:

Excelや紙での在庫管理に限界を感じている個人事業主で、低コストかつ手軽に在庫の見える化を実現したい方

どんなタイプか:

販売管理や会計を持たず、入出庫・棚卸・在庫数の可視化に絞るタイプです。スマホのバーコード・QR読み取りで現場登録を始めやすい点が特徴です。

このタイプで重視すべき機能:

📱スマホでのバーコード・QR読み取り
スマホでバーコードやQRコードを読み取り、倉庫や店舗の入出庫データをその場で登録できます。
🔔在庫アラート・発注点管理
基準在庫を下回った商品を自動通知し、欠品前の発注タイミングを把握できます。

おすすめ製品3選

おすすめの理由
ロジクラは、スマホをハンディ端末代わりにして入出荷・検品・棚卸を進められる、現場作業寄りのクラウド在庫管理システムです。バーコード・RFID、モバイル棚卸、出荷検品、シングル/バッチピッキングに対応し、FitGapでは操作性評価が同ページ1位、料金評価も2位のため、専用端末を買わずに副業ECや小規模物販の現物管理を始めたい個人事業主に向きます。EC・店舗・卸の複数チャネル在庫を扱える点も強みです。一方、Shopifyやスマレジなど外部連携は追加費用で、多拠点在庫管理や検品中在庫は追加オプション、在庫分析と多単位換算は非対応です。受注から出荷までの自動化を重視するならLOGILESS、買い切りPC管理で足りるなら在庫らくだプロも比較候補になります。
価格
0円~
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
在庫らくだプロ
おすすめの理由
在庫らくだプロは、Windowsパソコンにインストールして使う買い切り型の在庫管理ソフトで、クラウド連携よりも手元のPCで在庫帳簿を確実に残すことを重視した製品です。入出庫、複数倉庫、ロケーション、ロット・シリアル管理、在庫分析に対応し、FitGapでは料金評価が同ページ1位のため、月額課金を避けたい個人事業主や小規模店舗に向きます。インターネット接続が難しい環境や、在庫情報を社外に出したくない運用にも合います。一方、バーコード・RFID、EC受注在庫連動、3PL向け運用は対象外で、会計ソフトやECとの連携もCSVなど手作業が前提です。スマホ検品ならロジクラ、複数モールの受注から出荷まで自動化したい場合はLOGILESSを比較した方がよいです。
価格
-
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
LOGILESSは、OMS(受注管理)とWMS(倉庫管理)を一体化し、ECの受注から在庫引当、出荷指示までを同じ画面で動かすEC物流向けクラウドです。リアルタイム在庫更新、在庫予約引当、倉庫自動選定、ドロップシップ、KPIダッシュボード、在庫APIに対応し、FitGapでは連携・拡張性評価が同ページ1位です。複数モールや自社ECを運営し、配送条件や倉庫とのやり取りを自動化したい個人事業主に向きます。RPAマクロで条件に応じて出荷指示を変える運用を組める点も、注文数が増えた段階で有効です。一方、EC以外の単純な在庫帳簿や、自宅発送1チャネルだけの現物管理には重くなりやすい製品です。スマホ作業中心ならロジクラ、低コストの買い切りなら在庫らくだプロが比較対象になります。
価格
20,000円
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

業務システム統合タイプ 🏢

このタイプが合う企業:

取引先や商品点数が多く、販売・仕入・会計を横断した一気通貫の業務管理を求める個人事業主や、法人化を視野に入れている方

どんなタイプか:

販売・購買・会計などの基幹業務を、在庫管理と同じ統合基盤で扱うタイプです。業種別テンプレートやロット・期限管理など拡張性を重視します。

このタイプで重視すべき機能:

🔧業種別テンプレート・カスタマイズ
業種別の商慣習に合わせ、ロット管理や賞味期限管理などの要件を設定できます。
🔄受発注から会計までの一気通貫管理
受発注から出荷・請求・入金までを同じ流れで管理し、二重入力や情報のズレを減らします。

おすすめ製品3選

商蔵奉行クラウド
おすすめの理由
商蔵奉行クラウドは、販売・仕入・在庫を奉行シリーズの同一基盤で扱い、会計など周辺業務まで広げやすい業務統合型の製品です。見積から請求、発注、在庫分析までつなげられるため、個人事業主が法人化を見据えて紙やExcel管理を減らしたい場合に向きます。FitGapではサポート・セキュリティ・操作性が同ページ内で1位で、専任担当者を置きにくい小規模体制でも相談しながら運用しやすい点が強みです。バリエーション管理、多単位換算、期限管理、ABC分析に対応する一方、ロット管理・シリアル管理・FEFOには非対応です。食品・化粧品・医薬品のようにトレース管理が必須の事業や、月数件の取引から安く始めたい段階では、軽量な在庫管理製品も比較して下さい。
価格
13,000円
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
アラジンオフィス
おすすめの理由
アラジンオフィスは、販売・在庫・生産管理を業種別テンプレートとカスタマイズで現場に合わせる総合基幹システムです。卸売・小売・製造・ECなど事業形態が変わっても同じ基盤で育てやすく、個人事業主が取扱品目や販路を増やして中小〜中堅規模へ伸ばす場面に向きます。FitGapではシリアル管理、FEFO、廃棄期限通知、各種ピッキング、ASN、店頭受取在庫連携まで対応し、サポート評価も上位です。商蔵奉行クラウドより業種固有の在庫・倉庫運用を作り込みやすい一方、会計は外部連携が基本で、リアルタイムAPI連携や独自カスタマイズには追加工数・費用がかかります。受発注だけを安く素早く始めたい場合は過剰になりやすいです。
価格
要問合せ
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
GEN PRODUCTSは、在庫管理を製造・販売・購買まで広げ、メーカーの見積から入金までをクラウドでつなぐ製造業向けERPです。個人事業主でも、自社で組み立てや加工を行い、将来は複数拠点や委託販売まで管理したい場合に候補になります。FitGapではBOM、MRP、WIP管理、工数収集、設変履歴、ロット・シリアルトレース、HACCP、温湿度記録などに対応し、機能性と操作性の評価も同タイプで上位です。アラジンオフィスより製造工程とトレーサビリティを深く見たい企業向きですが、会計・銀行連携は非対応で、外部連携はCSV中心です。単一商材の販売や小さな倉庫管理だけなら、月額アカウント課金とサポート料に対して機能が重くなります。
価格
24,300円
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

比較すべき機能の優先度マップ

どこから比較すべきか

製品には数多くの機能がありますが、選定の決め手になるのは一部の機能だけです。そこで各機能を「多くの企業で必要か」と「製品ごとに対応が分かれるか」の2つの軸で4つに分け、比較する順番が分かるように並べました。下の表では、このページに登場した製品が各機能にどう対応しているかを、上から順に確認できます。
標準対応
オプション/条件付き
非対応

選定の決め手

個人事業主が物販や小規模ECの在庫管理を始める際に、製品ごとの差が出やすい実務機能を優先して確認するための比較です。
弥生販売
freee販売
販売王
ロジクラ
在庫らくだプロ
LOGILESS
商蔵奉行クラウド
アラジンオフィス
GEN PRODUCTS
基本在庫数管理
入庫・出庫・棚卸の在庫数を基本機能で管理できるか
バーコード・RFID対応
バーコード/QR/RFIDで入出庫・検品ができるか
バリエーション管理
色・サイズなどの在庫をマトリクス管理できるか
モバイル棚卸対応
ハンディ/スマホで棚卸ができるか
POS連携
固定/モバイルPOSと在庫同期できるか
オムニ在庫対応
チャネル横断で在庫を共有・引当できるか
セット販売対応
セット/バンドルの在庫を管理できるか

一部の企業で必須

食品・製造・取扱点数の多い販売など、扱う商品や運用が少し複雑な個人事業主だけが重点的に見るべき項目です。
弥生販売
freee販売
販売王
ロジクラ
在庫らくだプロ
LOGILESS
商蔵奉行クラウド
アラジンオフィス
GEN PRODUCTS
ロット管理対応
ロット単位で入出庫・在庫管理ができるか
期限管理対応
賞味/使用期限の属性で出荷制御できるか
発注点自動補充
発注点に基づき自動補充できるか
製造形態(離散)
離散組立型の在庫/製造に対応できるか
委託在庫管理
委託元/先別に在庫と精算を管理できるか

ほぼ全製品が対応

多くの候補製品が対応しているため、個人事業主向けの在庫管理では基本確認として見ておきたい項目です。
弥生販売
freee販売
販売王
ロジクラ
在庫らくだプロ
LOGILESS
商蔵奉行クラウド
アラジンオフィス
GEN PRODUCTS
リアルタイム在庫更新
在庫がリアルタイムに更新・同期できるか
バックオーダ管理
欠品分を受注に残し自動繰越できるか
返品・不良在庫管理
返品/不良在庫を区分管理し在庫へ反映できるか

優先度が低い

個人事業主の通常の在庫管理では必要になる場面が限られるため、特殊な物流規格や高度な倉庫運用がある場合だけ確認すれば十分です。
弥生販売
freee販売
販売王
ロジクラ
在庫らくだプロ
LOGILESS
商蔵奉行クラウド
アラジンオフィス
GEN PRODUCTS
SSCC発行(GS1‑128)
SSCCラベルを発行し在庫/出荷に紐付けできるか
入荷予約(ドックアポ)
搬入時間枠を事前予約し入荷負荷を平準化できるか
梱包最適化(カートナイゼーション)
注文内容から最適箱種・同梱を自動判定できるか

個人事業主の在庫管理・倉庫管理システムの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

すべての在庫管理・倉庫管理システムを閲覧

よくある質問

個人事業主でも在庫管理システムを導入できますか?

導入できます。ロジクラやZAICOは無料から使え、スマホやPCで在庫の見える化を手軽に始められます。物販や卸売で売上・仕入もまとめたいなら、freee販売や弥生販売が向きます。扱う商品点数や販売チャネル、使っている会計ソフトとの相性で向く製品が変わります。

売上や仕入もまとめて管理できますか?

まとめて管理できます。freee販売や弥生販売、商蔵奉行クラウドは、売上・仕入・在庫を一つのソフトで管理でき、帳票作成や会計連携まで行えます。物販や卸売を営む個人事業主に向きます。在庫の見える化だけで十分か、販売管理まで含めるかで、選ぶ製品が変わります。

使っている会計ソフトと連携できますか?

連携できます。freee販売は同じfreeeの会計と自動でつながり、売上や仕入のデータを二重入力なく引き継げます。弥生販売も弥生の会計と連携します。すでに使っている会計ソフトに合わせて在庫・販売の製品を選ぶと、確定申告や経理の手間を抑えられます。

個人事業主向けの在庫管理システムの料金はどのくらいですか?

無料から月数千円で始められます。ロジクラやZAICOは無料枠があり、freee販売は月3,980円、商蔵奉行クラウドは月13,000円が目安です。弥生販売は年36,700円、販売王は44,000円の買い切りです。在庫の見える化だけなら無料、販売管理まで含めると月数千円からが目安です。

個人事業主が在庫管理システム選びで気をつけることは何ですか?

有名だからと多機能な製品を選ぶと、使わない機能が多くコストや操作の負担が増えがちです。在庫の見える化が目的か、販売・会計まで含めるかで適した製品が変わります。まず無料や試用で、扱う商品や販売チャネルに合うかを確かめ、無理なく続けられるものを選びましょう。

※掲載している機能・対応範囲・料金は一般的な目安です。製品・プラン・契約条件により異なる場合があるため、導入前に各製品の最新の公式情報や比較表でご確認ください。

サービスカテゴリ

AI・エージェント

汎用生成AI・エージェント
LLM・大規模言語モデル
エージェントフレームワーク
エージェントオートメーション基盤

ソフトウェア(Saas)

オフィス環境・総務・施設管理
開発・ITインフラ・セキュリティ
データ分析・連携