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勤怠管理システムおすすめ12選｜タイプ別の選び方ガイド

更新：2026/5/29

勤怠管理システムは「打刻と残業集計のためのシンプルなツール」と見られがちですが、実際の製品群を比べると、その設計思想は企業の規模・就業形態・打刻環境・バックオフィス全体の管理方針によって大きく分かれます。たとえば、シフトのないオフィス勤務中心の企業であれば汎用クラウド製品で十分に対応できます。しかし、工場や倉庫で据え置き端末の打刻を安定させたい現場、入社手続きから勤怠・給与計算まで一気通貫で管理したい会社、海外拠点の勤怠をグローバルERPと統合したい大企業では、必要とする機能の方向性がまったく異なります。自社に合わない設計思想の製品を選ぶと、導入後に設定の作り直しや乗り換えが発生しかねません。FitGapでは90以上の勤怠管理システムを実際に検証し、就業ルールの複雑さ・打刻方式の幅・バックオフィス連携の深さ・導入コストという4つの軸で分類した結果、4タイプ・12製品に厳選しました。

レビュー担当 加藤杏奈

業務システムベンダーでCOMPANY・リシテア等の人事・給与・勤怠システムの導入支援に5年間従事。要件確認・設定・テスト・保守対応まで一連の工程を経験し、制度と運用の両面を踏まえた評価を行っている。

FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

経費精算システムのおすすめ製品を製品ごとにタイプ、料金、企業規模、評価ポイントで比較する表
製品名	タイプ	料金	企業規模	評価ポイント
COMPANY 勤怠管理システム	大企業・複雑な就業ルール対応タイプ🏭	要問合せ	中小中堅大企業	複数法人の就業ルールを細かく分割管理。大企業でのシェアもトップ。
TimePro-VG	大企業・複雑な就業ルール対応タイプ🏭	要問合せ	中小中堅大企業	アマノ製打刻端末と連携し、現場打刻を安定運用。2万社超で稼働。
リシテア/就業管理	大企業・複雑な就業ルール対応タイプ🏭	要問合せ	中小中堅大企業	勤怠データから長時間労働やストレス兆候まで把握できる。大企業での利用も多い。
Workday	大企業・複雑な就業ルール対応タイプ🏭	要問合せ	中小中堅大企業	海外拠点の勤怠・人事・給与を同じ基盤で管理。世界的な導入実績も豊富。
KING OF TIME 勤怠管理	汎用クラウド勤怠管理タイプ☁️	300円ユーザー/月	中小中堅大企業	多様な打刻方法と全機能込みの料金で多拠点を管理。幅広い企業規模で使える。
Touch On Time	汎用クラウド勤怠管理タイプ☁️	300円ユーザー/月	中小中堅大企業	専用端末で生体認証とICカード打刻を使い分け。製造業での利用も上位。
就業奉行	汎用クラウド勤怠管理タイプ☁️	390円ユーザー/月	中小中堅大企業	奉行シリーズで勤怠から給与・人事まで連携可能。80万社超の導入実績がある。
kincone	中小・手軽な勤怠管理タイプ📱	200円ユーザー/月	中小中堅大企業	交通系IC打刻と交通費精算を一括管理。低コストで導入しやすい。
ジョブカン勤怠管理	中小・手軽な勤怠管理タイプ📱	0円~ユーザー/月	中小中堅大企業	シフト作成方式を選べ、必要な機能だけ追加可能。中小・中堅でのシェアも上位。
SmartHR 労務管理	人事労務一体管理タイプ👥	0円~	中小中堅大企業	入退社手続きから従業員情報を一元管理。使いやすく労務でのシェアも上位。
ジンジャー勤怠	人事労務一体管理タイプ👥	要問合せ	中小中堅大企業	スマホで勤務種別打刻まで完結。人事労務・給与・経費にも広げられる。
マネーフォワードクラウド勤怠	人事労務一体管理タイプ👥	2,980円月	中小中堅大企業	勤怠データを会計・給与・経費へ連携。中小・中堅企業でのシェアが高い。

タイプ別おすすめ製品

大企業・複雑な就業ルール対応タイプ🏭

このタイプが合う企業：

複数法人・グループ会社を抱える大企業、工場や複数拠点で据え置き打刻を安定運用したい企業、グローバル拠点の勤怠も統合管理したい企業

どんなタイプか：

変形労働・裁量労働・フレックスなど複数の就業ルールを1基盤で管理し、法令チェックや工数管理まで扱うタイプです。

このタイプで重視すべき機能：

⚙️複数就業ルールの並行管理

所属・職種・拠点ごとの就業ルールを並行管理し、法人や雇用形態別の差分設定を保てます。

⚠️月中アラートと法令チェック

残業・勤務間インターバル・有休取得を月中に検知し、36協定超過や過重労働を早めに把握できます。

検証比較ノート

シフト自動作成と法令アラートの厚さに注目

勤怠管理システムを大企業・複雑な就業ルール対応タイプの文脈で選ぶ際は、就業ルールの複雑さ・打刻運用の現場性・人事給与連携の深さが判断軸になります。COMPANY 勤怠管理システムは、FitGapの実機検証で複数法人・グループ会社の就業ルールを統合管理でき、予実分離・遡及計算と人事給与連携が強みを確認できました。TimePro-VGは、FitGapの実機検証でアマノ製タイムレコーダー連携で据え置き打刻が安定し、複合的な法令アラートで現場運用に向くを確認できました。リシテア/就業管理は、FitGapの実機検証で長時間労働の自動抽出と勤怠AI分析、工数管理連動を備え、日立ソリューションズの就業管理基盤として大企業向きを確認できました。Workdayは、FitGapの実機検証でSlack・AIアシスタント連携と独自拡張機能Extendで、グローバル人事の中に勤怠を組み込めるHCMスイートを確認できました。