時差出勤対応の勤怠管理システムおすすめ9選｜タイプ別の選び方ガイド

更新：2026/5/29

時差出勤の勤怠管理システムは、早番・遅番など複数の出退勤パターンを正しく記録・集計し、遅刻判定や残業計算まで自動化するためのツールです。近年はテレワークとの併用やフレックスとの掛け合わせが増え、製品ごとの対応力の差が広がっています。FitGapでは、製品を「勤怠管理特化」「バックオフィス一体」「大企業・複雑制度対応」の3タイプに分類し、それぞれの代表製品を紹介します。さらに、要件の優先度整理から製品選定の具体的な手順まで、自社に合った一台を迷わず選ぶためのガイドをお届けします。

レビュー担当 加藤杏奈

業務システムベンダーでCOMPANY・リシテア等の人事・給与・勤怠システムの導入支援に5年間従事。要件確認・設定・テスト・保守対応まで一連の工程を経験し、制度と運用の両面を踏まえた評価を行っている。

FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

時差出勤対応の勤怠管理システムのおすすめ製品を製品ごとにタイプ、料金、企業規模、評価ポイントで比較する表
製品名	タイプ	料金	企業規模	評価ポイント
KING OF TIME 勤怠管理	勤怠管理特化タイプ 🕐	300円ユーザー/月	中小中堅大企業	勤怠から人事・給与まで一元管理できる。全体シェアトップでサポートも手厚い。
ジョブカン勤怠管理	勤怠管理特化タイプ 🕐バックオフィス一体タイプ 🔗	0円~ユーザー/月	中小中堅大企業	必要な勤怠機能だけ選び、低コストで運用。中小・中堅企業での利用も多い。
Touch On Time	勤怠管理特化タイプ 🕐	300円ユーザー/月	中小中堅大企業	専用端末を使う現場打刻に強い。製造・小売でシェアが上位。
マネーフォワードクラウド勤怠	バックオフィス一体タイプ 🔗	2,980円月	中小中堅大企業	勤怠データを給与・会計へつなげやすい。中小企業シェアがトップ。
TimePro-VG	バックオフィス一体タイプ 🔗大企業・複雑制度対応タイプ 🏢	要問合せ	中小中堅大企業	クラウド版とオンプレ版を選択できる。複雑な勤務制度と労務リスク管理に強い。
COMPANY 勤怠管理システム	大企業・複雑制度対応タイプ 🏢	要問合せ	中小中堅大企業	人事・給与まで統合した大企業向け基盤。複雑な制度対応の範囲が広い。
リシテア/就業管理	大企業・複雑制度対応タイプ 🏢	要問合せ	中小中堅大企業	勤務場所や時間が分かれる大規模組織に対応。使いやすさも重視できる。

タイプ別おすすめ製品

勤怠管理特化タイプ 🕐

このタイプが合う企業：

既存の給与計算ソフトを活かしつつ、時差出勤を含む多様な勤務パターンの打刻・集計を正確に効率化したい中小〜中堅企業の人事労務担当者

どんなタイプか：

勤務パターン登録、スケジュール設定、打刻集計を勤怠管理システム内で扱うタイプです。給与・労務は外部連携に任せ、時差出勤の勤怠処理に機能を集中させる点が特徴です。

このタイプで重視すべき機能：

📋複数スケジュールパターン登録

早番・遅番などの勤務パターンを登録し、従業員別・日別に割り当てて集計できます。

📱豊富な打刻方式への対応

PC、スマホ、ICカードなどの打刻を使い分け、勤務場所に応じた記録を残せます。