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夜勤対応の勤怠管理システムおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026年03月05日
夜勤の勤怠管理システムは、深夜0時をまたぐ打刻処理や深夜割増賃金の自動計算など、日勤中心のシステムでは対応しきれない機能が求められます。近年はAIによるシフト自動生成や勤務間インターバルの自動チェックなど、夜勤スタッフの労務リスクを未然に防ぐ機能も進化しています。しかし、1人月額200円台の勤怠特化型から、給与・労務まで一体管理できるタイプ、三交代制や宿日直に対応する大企業向けまで製品の幅は広く、自社に合った1本を選ぶのは簡単ではありません。FitGapでは製品を3つのタイプに分類し、要件定義から選定手順までを独自の視点で解説します。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
中小企業向け・勤怠特化タイプ 🏢
KING OF TIME 勤怠管理
/ Touch On Time
/ ジョブカン勤怠管理
バックオフィス一体型タイプ 🔗
マネーフォワード クラウド勤怠
/ 楽楽勤怠
/ ジンジャー勤怠
大企業・複雑シフト特化タイプ 🏭
COMPANY 勤怠管理システム
/ TimePro-VG
/ リシテア/就業管理
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
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タイプ別お勧め製品

中小企業向け・勤怠特化タイプ 🏢

このタイプが合う企業:

夜勤を含む勤怠管理を効率化したい中小〜中堅企業の人事・労務担当者

どんなタイプか:

夜勤の勤怠管理をはじめて導入する中小〜中堅企業におすすめのタイプです。日またぎ打刻や深夜割増の自動計算といった夜勤必須機能を標準搭載しつつ、1人あたり月額200〜300円台というリーズナブルな価格帯が特徴です。FitGapでは、まず勤怠管理だけをしっかり整えたい企業にはこのタイプを最初の候補として推奨しています。導入実績が非常に豊富な製品が揃っているため、夜勤運用のノウハウやサポート体制が充実しており、はじめてのシステム導入でも安心して進められます。

このタイプで重視すべき機能:

🌙日またぎ勤務の自動判定
夜勤で日付をまたぐ打刻を1勤務として自動認識し、出勤日数や労働時間を正しくカウントします。打刻日付の切替時刻を自由に設定できるため、二交代制・三交代制いずれの運用にも対応できます。
💰深夜割増賃金の自動計算
22時〜翌5時の深夜労働時間を自動集計し、25%以上の割増賃金を正確に算出します。給与計算ソフトへのデータ連携もスムーズで、毎月の締め作業にかかる時間を大幅に短縮できます。

おすすめ製品3選

KING OF TIME 勤怠管理
おすすめの理由
夜勤対応の勤怠管理システムとして国内シェアトップクラスです。豊富な打刻方法と柔軟なシフト設定に加え、1人月額300円で全機能を利用でき、コストパフォーマンスに優れています。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
導入企業数67,000社超の実績を誇り、夜勤を含む多様な勤務形態に対応します。1社1人の専属サポートが付くため、夜勤シフトの初期設定もスムーズに進められます。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ジョブカン勤怠管理
おすすめの理由
シリーズ累計30万社超の導入実績があり、シフト管理・休暇管理・工数管理などの機能を自由に組み合わせて利用できます。夜勤と日勤が混在する職場でも柔軟に運用設計が行えます。
価格
0円~
ユーザー/月
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

バックオフィス一体型タイプ 🔗

このタイプが合う企業:

勤怠データを給与計算・労務管理まで一気通貫で連携させたい企業の管理部門

どんなタイプか:

勤怠管理だけでなく、給与計算・労務管理・経費精算などのバックオフィス業務をまとめて効率化したい企業向けのタイプです。同一シリーズの製品間でデータがシームレスに連携するため、夜勤の深夜割増データをそのまま給与計算に反映でき、転記ミスや二重入力の手間を根本からなくせます。FitGapとしては、現在バラバラのツールで管理している企業や、給与計算のたびに集計作業が発生している企業に特に効果が大きいタイプだと考えています。

このタイプで重視すべき機能:

🔄給与計算へのワンクリック連携
夜勤の深夜割増・残業代を含む勤怠データを、同一シリーズの給与計算システムにワンクリックで反映できます。手作業での転記が不要になり、毎月の給与締め作業を大幅にスピードアップします。
⚠️労務アラート・36協定管理
残業時間や夜勤回数が上限に近づいた際に自動でアラートを発信し、36協定違反を未然に防止します。管理者はダッシュボードで全従業員の労働状況をリアルタイムに把握できます。

おすすめ製品3選

マネーフォワード クラウド勤怠
おすすめの理由
マネーフォワード クラウドシリーズの一つで、給与・社会保険・年末調整まで一気通貫で管理できます。夜勤の変形労働時間制にも対応しており、バックオフィス全体の効率化に貢献します。
価格
2,980円
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
シフト作成時の人件費シミュレーション機能が特徴的で、夜勤の割増コストを事前に把握できます。直感的なUIで管理者・従業員ともに使いやすく、導入定着率が高い製品です。
価格
30,000円
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ジンジャー勤怠
おすすめの理由
人事・労務・給与・経費など幅広い領域をカバーするジンジャーシリーズの勤怠モジュールです。日付をまたいだ打刻の課題を解決した導入事例が多く、夜勤現場からの評価が高い製品です。
価格
要問合せ
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

大企業・複雑シフト特化タイプ 🏭

このタイプが合う企業:

複雑なシフト体制や独自の就業規則を持つ大企業・大規模事業所の人事部門

どんなタイプか:

数百〜数万人規模の従業員を抱え、二交代制・三交代制・変形労働時間制など複雑な勤務パターンが混在する大企業・大規模事業所向けのタイプです。就業規則のきめ細かいカスタマイズや、工場・病院・介護施設など業界特有の勤務ルールへの対応力が大きな強みです。FitGapでは、汎用型では対応しきれない独自の就業ルールや、複数拠点をまたぐ勤怠管理が求められる企業にはこのタイプ一択と考えています。導入時に専任コンサルタントが付くケースが多く、自社の運用に合わせた設定支援を受けられます。

このタイプで重視すべき機能:

📋多層シフトパターンの柔軟設定
二交代・三交代はもちろん、準夜勤・当直・宿直・オンコールなど細かい勤務区分を自由に定義できます。拠点・部署ごとに異なる就業ルールも一元管理でき、複雑な勤務体系をシステム上で正確に再現します。
🛠️就業規則カスタマイズ・専任導入支援
自社固有の就業規則や賃金ルールに合わせて、集計ロジックや承認フローを細かくカスタマイズできます。専任コンサルタントが要件定義から本稼働後の運用調整まで長期的にサポートする体制が整っています。

おすすめ製品3選

COMPANY 勤怠管理システム
おすすめの理由
大手企業を中心に豊富な導入実績を持つエンタープライズ向け勤怠管理システムです。複雑な交代制勤務や独自の就業規則にも柔軟に対応でき、人事・給与システムとの統合運用が可能です。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
アマノが提供する大規模向け就業管理システムで、工場や病院など24時間稼働の現場で多くの採用実績があります。複雑な勤務パターンの自動判定と正確な割増計算に定評があります。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
リシテア/就業管理
おすすめの理由
日立ソリューションズが提供する大企業向け就業管理システムで、数万人規模の運用実績があります。業種別テンプレートが豊富で、夜勤を含む複雑なシフト管理の導入負荷を軽減できます。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

🌙日またぎ勤務の自動処理
22時〜翌7時のように深夜0時をまたぐ勤務を「1勤務」として正しく認識し、労働時間を自動計算する機能です。夜勤の勤怠管理で最も重要なポイントで、製品によって処理精度や設定の柔軟さに大きな差があります。
💰深夜割増賃金の自動計算
22時〜翌5時の深夜時間帯を自動判定し、25%以上の深夜割増・時間外割増・休日割増が重なるケースも正確に計算する機能です。割増率の重複計算を間違えると法令違反になるため、製品ごとの対応力を必ず確認しましょう。
🔄変形労働時間制への対応
1ヶ月単位や1年単位の変形労働時間制を設定でき、夜勤が多い週と少ない週を平均して法定内に収まるよう管理できる機能です。夜勤がある現場では導入率が非常に高く、対応の深さが製品選定の分かれ目になります。
📋シフトパターンの柔軟な登録
二交代制・三交代制など複数の夜勤パターンを事前登録し、従業員ごとに割り当てられる機能です。日勤・準夜勤・夜勤といった複雑なローテーションに対応できるかどうかで、運用のしやすさが大きく変わります。
🔗給与計算ソフトとのデータ連携
集計した夜勤の労働時間・割増賃金データをCSVやAPI経由で給与計算ソフトに渡せる機能です。夜勤は深夜・時間外・休日の割増が複雑に絡むため、手入力によるミスを防ぐにはスムーズな連携が不可欠です。
⚠️36協定の残業アラート
月・年単位の時間外労働が36協定の上限に近づいたときに自動で警告を出す機能です。夜勤を含む職場は残業が見えづらいため、リアルタイムのアラートがないと上限超過に気づけないリスクがあります。
勤務間インターバルの管理
前の勤務の終了から次の勤務の開始まで一定時間(例:11時間)の休息を確保しているかチェックする機能です。夜勤明けから日勤への切り替え時に休息不足になりやすく、従業員の健康管理と法令対応の両面で重要度が増しています。

一部の企業で必須

🛏️夜勤明けの休日・代休管理
夜勤明けの代休や振替休日を日単位・時間単位で柔軟に管理する機能です。法定休日は暦日(0時〜24時)で付与する必要があり、夜勤明けの日は休日にカウントできないため、正確な管理が求められる業種で必須になります。
🏥業種別の法令対応(医療・介護・警備など)
看護師の様式9対応や、宿日直の取り扱い、警備業の変則勤務など業種固有のルールに対応できる機能です。一般企業では不要ですが、医療・介護・警備業界では導入の前提条件になります。
📍GPS・生体認証などの不正打刻防止
GPS位置情報や顔認証・指静脈認証などで本人確認を行う打刻機能です。夜勤は管理者の目が届きにくく不正が発生しやすいため、複数拠点や現場出勤が多い企業ではとくに重視されます。
🏢複数拠点の一括管理
工場や店舗など複数拠点の夜勤シフトと勤怠データを本社で一元管理できる機能です。拠点数が多い企業では集計作業の効率に直結しますが、単一拠点の企業には優先度が下がります。
🌐多言語対応
画面表示を英語やベトナム語など複数言語に切り替えられる機能です。外国人労働者が多い工場や介護施設の夜勤現場では必須ですが、日本人スタッフのみの職場では不要です。

ほぼ全製品が対応

📱多様な打刻方法(Web・ICカード・スマホ)
PC・スマートフォン・ICカードなど複数の打刻手段に対応する機能です。夜勤対応を謳う製品であればほぼ全製品が備えており、差がつきにくいポイントです。
🗓️有給休暇の自動付与・残日数管理
入社日や勤続年数に応じて有給休暇を自動付与し、取得状況をリアルタイムで確認できる機能です。夜勤の有無にかかわらず、ほぼすべての勤怠管理システムに標準搭載されています。
申請・承認ワークフロー
残業申請や休暇申請をオンラインで行い、上長が承認する一連の流れをシステム上で完結させる機能です。基本機能として大半の製品に搭載されています。
📊勤怠データのCSV出力・レポート
勤怠の集計データをCSVやPDFで出力し、部門別・拠点別などのレポートを作成する機能です。標準機能としてほぼ全製品が対応しています。

優先度が低い

📝日報・プロジェクト工数管理
勤怠管理と合わせて日報やプロジェクトごとの工数を記録・集計する機能です。夜勤の勤怠管理という目的においては直接関係が薄く、必要であれば別ツールで対応できます。
🧾経費精算の一体管理
交通費や経費精算を勤怠管理と同じシステムで行う機能です。バックオフィス業務の統合には便利ですが、夜勤管理の要件としては優先度が低いポイントです。

夜勤の勤怠管理システムの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

夜勤対応の勤怠管理システムを導入する際、どのような点に注意すべきですか?
夜勤対応の勤怠管理システムの導入で特に押さえておきたいのは「既存システムとの連携複雑性」と「従業員の操作習得に要する時間」の2点です。既存システムとの連携複雑性の面では、給与計算システムや人事システムとの連携において、夜勤特有のデータ形式や計算ロジックの違いが問題となる場合があります。従業員の操作習得に要する時間については、夜勤従業員は日勤従業員と比べて研修機会が限られるため、システム操作の習得に時間がかかる場合があります。このほか「24時間サポート体制の必要性」「セキュリティ対策の重要性増大」「初期設定の複雑さと時間」なども、事前に確認しておくことをおすすめします。

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