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官公庁向け勤怠管理システムおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026年02月27日
官公庁の勤怠管理システムは、民間向け製品をそのまま導入すれば済むものではありません。会計年度任用職員の管理、LGWAN環境への対応、条例ベースの勤務制度など、公務員特有の要件を満たせるかどうかで選択肢が大きく変わります。さらに、職員数が数百人の市町村と数万人規模の省庁では、求められるカスタマイズ性やシステム連携の深さもまったく異なります。本ガイドでは「官公庁特化か汎用か」「組織規模と既存システムとの連携要件」という2つの軸で製品を3タイプに分類し、タイプ別のおすすめ製品から要件定義・選定ステップまでを一括でご案内します。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
官公庁特化・庶務事務一体タイプ 🏛️
One人事【Public勤怠管理】
/ COMPANY on LGWAN
/ POSITIVE
汎用クラウド勤怠・官公庁導入実績ありタイプ ☁️
ジンジャー勤怠
/ セコムあんしん勤怠管理サービス
/ 勤革時
大規模組織向けカスタマイズ対応タイプ 🏗️
TimePro-VG
/ リシテア/就業管理クラウドサービス
/ CYBER XEED 就業
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
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タイプ別お勧め製品

官公庁特化・庶務事務一体タイプ 🏛️

このタイプが合う企業:

自治体・省庁・公共機関の総務人事部門で、公務員制度に完全準拠した勤怠・庶務管理を一括で実現したい組織

どんなタイプか:

官公庁や自治体の勤務制度に最初から最適化された専用設計の勤怠管理システムです。会計年度任用職員や交替制勤務、振替・代休の独自ルールなど、公務員特有の勤務体系を標準機能でカバーしているのが最大の強みです。LGWAN(総合行政ネットワーク)への対応や、人事院勧告・法改正への追随が利用料金内で提供されるため、セキュリティと運用コストの両面で安心感があります。FitGapでは、庶務事務や人事給与まで一体で管理したい自治体・省庁に最もおすすめしています。

このタイプで重視すべき機能:

👥会計年度任用職員・交替制勤務の標準対応
フルタイム・パートタイムの会計年度任用職員や交替制勤務、振替出勤・代休の自治体独自ルールをシステム設定だけで再現できます。民間向け製品ではカスタマイズが必要になりがちな公務員固有の勤務制度を、追加開発なしで利用できる点が大きなメリットです。
🔒LGWAN-ASP対応によるセキュアな運用
行政専用の閉域ネットワークであるLGWAN上でクラウド利用できるため、インターネットに接続せずにセキュリティを確保できます。庁内のLGWAN端末とICカードリーダーがあれば導入が完了し、サーバー設置やインストール作業が不要なので、IT人材が限られる自治体でもスムーズに運用を開始できます。

おすすめ製品3選

One人事【Public勤怠管理】
おすすめの理由
LGWAN-ASP登録済みの自治体専用システムで、人事給与・庶務事務・勤怠管理・タレントマネジメントまでワンストップで対応できます。人事院勧告や法改正への追随が利用料金内に含まれ、多くの公共機関で導入実績があります。
価格
要問合せ
無料トライアルあり
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
COMPANY on LGWAN
おすすめの理由
大手企業向け統合人事システムCOMPANYシリーズのLGWAN対応版で、人事給与から庶務事務までシームレスに連携します。25年以上のノウハウが標準機能に反映されており、大規模自治体や省庁の複雑な勤務体系にも対応できます。
価格
要問合せ
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
電通総研が提供する大規模組織向けの統合人事システムで、官公庁への導入実績を持ちます。勤怠管理に加え人事・給与・就業を一体で運用でき、公務員制度に対応した柔軟な設定が可能です。
価格
要問合せ
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

汎用クラウド勤怠・官公庁導入実績ありタイプ ☁️

このタイプが合う企業:

紙やExcelでの勤怠管理から脱却したい中小規模の自治体・出先機関で、低コスト・短期間で導入を進めたい組織

どんなタイプか:

民間企業向けに広く普及しているクラウド型勤怠管理システムのうち、官公庁への導入実績が豊富な製品群です。勤怠管理に特化したシンプルな設計で、初期費用を抑えながら短期間で導入できるのが特徴です。多彩な打刻方法やワークフロー機能を標準搭載し、スマホ・PC・ICカードなど現場に合った運用が選べます。FitGapとしては、まず勤怠のデジタル化を手軽に始めたい小〜中規模の自治体や出先機関での利用に向いていると考えます。

このタイプで重視すべき機能:

📱多彩な打刻手段(ICカード・スマホ・生体認証)
ICカード・スマートフォンアプリ・PC打刻・生体認証など複数の打刻方法に対応しており、庁舎勤務から出先機関・テレワークまで柔軟にカバーできます。マイナンバーカードを活用した打刻に対応する製品もあり、自治体が進めるマイナンバーカード利活用と親和性が高い点も魅力です。
残業上限アラート・36協定遵守の自動チェック
時間外労働の累計時間をリアルタイムで集計し、上限に近づくと管理者・職員双方にアラートを自動通知します。官公庁でも長時間労働の是正が課題となっており、システムが自動で超過リスクを検知してくれることで、労務管理の属人化を防ぎ、コンプライアンス違反を未然に抑止できます。

おすすめ製品3選

ジンジャー勤怠
おすすめの理由
官公庁セグメントでシェア上位のクラウド勤怠管理システムです。直感的なUIとスマホ打刻対応で現場への定着がしやすく、人事労務・給与・経費などジンジャーシリーズとの連携で業務範囲を段階的に拡張できます。
価格
要問合せ
無料トライアルあり
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
セコムあんしん勤怠管理サービス
おすすめの理由
セキュリティ大手セコムが提供する勤怠管理サービスで、官公庁での導入実績が豊富です。セコムならではの高いセキュリティ基盤の上で運用できる安心感があり、ICカードや入退室管理との連動もスムーズに行えます。
価格
330円
ID/月
無料トライアルあり
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
日本電気(NEC)が提供するクラウド勤怠管理システムで、官公庁におけるシェアが高い製品です。NECの堅牢なクラウド基盤上で稼働し、多様な勤務形態への対応力と大規模運用に耐えるスケーラビリティが評価されています。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

大規模組織向けカスタマイズ対応タイプ 🏗️

このタイプが合う企業:

職員数が数千人以上の大規模省庁・都道府県・政令指定都市で、既存の人事給与基幹システムと密に連携しながら高度な勤怠管理を実現したい組織

どんなタイプか:

数千〜数万人規模の省庁・大規模自治体向けに、複雑な就業規則や独自の承認フローをきめ細かくカスタマイズできる勤怠管理システムです。オンプレミス環境での運用にも対応する製品が多く、既存の人事給与システムや基幹ERPとのデータ連携を重視する組織に適しています。FitGapでは、複数の勤務体系が混在する大規模組織や、既存システムとの統合要件が厳しい場合にこのタイプを推奨しています。

このタイプで重視すべき機能:

⚙️就業規則・承認フローの柔軟なカスタマイズ
部署・職種・雇用区分ごとに異なる就業規則や複数階層の承認フローを、画面上の設定やアドオン開発で自在に構築できます。一般行政職・技術職・医療職・教育職など多様な職種が混在する大規模官公庁でも、一つのシステムで全職員の勤務体系を統合管理できる点が強みです。
🔗基幹人事給与・ERPとのシームレス連携
既存の人事給与システムやERPとAPI・CSV連携でデータをやり取りし、二重入力や転記ミスを排除します。勤怠データを給与計算や人件費分析に直結させることで、月次の給与処理や予算管理の大幅な効率化を実現できます。

おすすめ製品3選

おすすめの理由
打刻機器で国内トップシェアのアマノが提供する大規模向け勤怠管理システムです。教育委員会や自治体への導入実績が豊富で、ICカード・指紋認証端末などハードウェア連携の強みと複雑なシフト勤務への対応力が高く評価されています。
価格
要問合せ
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
リシテア/就業管理クラウドサービス
おすすめの理由
日立ソリューションズが提供する大規模組織向けの就業管理システムで、官公庁を含む1,400社以上の導入実績があります。複雑な勤務制度やコンプライアンス管理機能が充実しており、基幹システムとの連携にも柔軟に対応します。
価格
要問合せ
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
CYBER XEED 就業
おすすめの理由
アマノビジネスソリューションズが提供するクラウド型の大規模向け就業管理システムです。アマノグループの打刻機器ノウハウを活かしつつ、クラウドでの大量データ処理と高度な就業ルール設定を両立しており、官公庁での利用実績があります。
価格
330円
人/月
無料トライアルあり
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

🏛️公務員の勤務制度への対応力
官公庁の勤怠管理では、地方公務員法や各自治体の条例に基づく独自の勤務制度を正確にシステムで再現できるかが最大の選定ポイントになります。民間企業と異なり、労働基準法ではなく自治体ごとの条例が適用されるため、振替休日の取得期限や超過勤務命令の上限ルールなど、自治体固有の規定をパラメータ設定で柔軟に反映できる製品を選ぶ必要があります。FitGapでは、デモの段階で自団体の条例ルールを設定し、正しく集計されるかを必ず検証することをおすすめしています。
🔒LGWAN対応の有無
自治体のネットワーク環境はインターネットから分離されたLGWAN接続系で運用されるケースが大半です。そのため、勤怠管理システムがLGWAN-ASPとして提供されているか、あるいはオンプレミスでLGWAN環境内に構築できるかは、製品を絞り込むうえで最初に確認すべき要件です。インターネット接続系のみで動作するクラウド製品を選んでしまうと、庁内端末から利用できないという致命的な問題が生じます。
👥会計年度任用職員の一元管理
2020年度から本格運用が始まった会計年度任用職員制度により、正規職員とは異なる報酬体系・勤務形態の職員が大幅に増えています。短時間勤務や多様な契約形態を持つ会計年度任用職員と正規職員を同一システムで一元管理できるかどうかは、運用負荷に直結します。FitGapとしては、職員区分ごとに勤務パターンや休暇付与ルールを個別設定できる製品を強くおすすめします。
🔗人事給与システムとのデータ連携
官公庁では既存の人事給与システム(庶務事務システム)がすでに稼働しているケースがほとんどです。勤怠データをCSVやAPI連携で人事給与システムへスムーズに受け渡せるかは、導入後の業務効率を左右する最重要ポイントの一つです。連携フォーマットの互換性や、超過勤務手当の自動算出に必要な項目がそろっているかを事前に確認してください。
超過勤務の自動集計とアラート
官公庁でも長時間労働の是正が強く求められており、超過勤務時間をリアルタイムで自動集計し、上限に近づいた段階で管理者・本人にアラートを出せる機能は選定の決め手になります。月単位だけでなく、年間の累計時間や複数月平均での管理に対応しているかも重要です。FitGapでは、単なる集計だけでなく超過勤務命令との突合が可能な製品を高く評価しています。
📋承認ワークフローの柔軟性
官公庁では時間外勤務命令や休暇申請に対して、所属長・課長・部長といった複数段階の決裁フローが必要です。組織改編や人事異動が毎年度発生するため、承認ルートを管理者側で柔軟に変更できるかどうかが実運用のカギになります。紙の回議をそのまま電子化できるレベルの柔軟さを持つ製品を選ぶと、現場の混乱を最小限に抑えられます。

一部の企業で必須

🔄交替制勤務・変則シフトへの対応
消防・病院・水道など24時間体制の部署を抱える官公庁では、3交替や変則シフトの勤務パターンを正確に管理できるかが必須要件になります。深夜勤務の割増計算や、シフト間の休息時間チェック機能があるかを確認してください。
💳マイナンバーカードによる打刻
自治体ではマイナンバーカードの利活用推進が求められており、職員証としてのマイナンバーカードで出退勤打刻を行いたいというニーズが増えています。対応しているかどうかは、ICカード打刻の対応規格(FeliCa / MIFARE等)と合わせて確認が必要です。
🚨災害時・緊急時の勤務管理
自然災害の対応が頻繁に発生する自治体では、災害対策本部設置時の緊急参集や特殊勤務の記録をシステム上で管理できることが重要です。通常の勤務体系とは異なるイレギュラーな勤務を事後登録・承認できる柔軟さが求められます。
🏫教育委員会・学校現場への展開
教職員の勤務時間管理を強化する動きが全国で広がっています。学校ごとに異なる勤務時間帯の設定や、校務システムとの連携が必要な場合は、教育委員会向けの導入実績がある製品を選ぶことが近道です。
🏢複数拠点・出先機関の一括管理
本庁だけでなく出先機関や出張所など複数拠点の勤怠データを一括管理できるかは、規模の大きな自治体ほど重要です。拠点ごとに管理者権限を分けつつ、全体の集計は本庁で一元的に確認できる仕組みがあると運用がスムーズです。

ほぼ全製品が対応

⏱️出退勤の打刻機能
ICカードやPC・スマートフォンからの打刻は、現在ほぼすべての勤怠管理システムが標準で備えています。打刻手段の有無そのものよりも、庁内のネットワーク環境で利用できる打刻方式があるかどうかを確認する程度で問題ありません。
🌴年次有給休暇の管理
有給休暇の付与・残日数管理・取得状況の可視化は、勤怠管理システムの基本機能としてほぼ全製品が対応しています。繰越計算の自動化も一般的に備わっていますので、製品間の差がつきにくい領域です。
📊勤務実績のCSV出力
勤怠データをCSV形式で出力する機能はほぼすべての製品に備わっています。出力項目のカスタマイズ性に若干の差はありますが、基本的な集計データの出力で困ることはほとんどありません。
🧮残業時間の月次集計
月ごとの残業時間を自動集計する機能は、現在の勤怠管理システムでは標準的に搭載されています。集計結果の確認画面やレポート出力も含め、基本機能として整備されている製品がほとんどです。

優先度が低い

📍GPS打刻・位置情報記録
営業職が多い民間企業では重宝されるGPS打刻ですが、官公庁の職員は基本的に庁舎内で勤務するため、位置情報による打刻の優先度は高くありません。テレワーク対応が主目的であれば別の手段でも代替可能です。
🤖AIによるシフト自動生成
AI技術を活用したシフトの自動最適化は注目されていますが、官公庁の勤務体系はシフト制よりも定時勤務が中心であり、導入効果が限定的なケースが多いです。交替制部署がある場合でもシフトパターンが固定的なことが多く、現時点では優先すべき要件とは言いにくいです。

官公庁の勤怠管理システムの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

官公庁において勤怠管理システムを導入する際、どのような点に注意すべきですか?
官公庁において勤怠管理システムの導入で特に押さえておきたいのは「情報セキュリティ基準への適合」と「既存システムとの連携確認」の2点です。情報セキュリティ基準への適合の面では、官公庁でシステムを導入する際は、政府や自治体が定める情報セキュリティ基準を満たすことが大切です。既存システムとの連携確認については、官公庁では給与システムや人事システムなど、既に多数の基幹システムが稼働しています。このほか「予算確保と費用対効果の検証」「職員への周知と研修の実施」「段階的な導入計画の策定」なども、事前に確認しておくことをおすすめします。
官公庁向けの勤怠管理システムは、生成AIやAIエージェントの登場でどのように変化していますか?
生成AIの普及とAIエージェントの台頭により、官公庁向けの勤怠管理システムは新たな段階に入っています。AIを活用した自動入力・認証機能で勤怠管理が進化しています。AIチャットボットが出退勤時間や欠勤理由を自動記録し、管理者の手作業を大幅削減。また、指紋や顔認証などのバイオメトリクス技術が導入され、不正な打刻やなりすましを防止します。AI分析と異常検知によって精度が高まっています。AIモデルが勤怠パターンを解析し欠勤リスクを予測。さらに、繰り返し遅刻や不審な打刻をAIが自動検知し、不正を早期に防ぎます。また、労働法違反の可能性もAIがアラート通知し、監査対応を支援します。AIチャットボットやエージェントは24時間体制で勤怠関連の問い合わせ対応を可能にします。米国事例では、AIチャットボットを導入して24時間セルフサービスを実現し、対応時間を大幅に短縮しました。

サービスカテゴリ

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