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複数拠点対応の勤怠管理システムおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026年03月05日
複数拠点で勤怠管理システムを導入する際、拠点ごとの就業ルールや打刻方法の違いにどこまで対応できるかは製品によって大きく異なります。勤怠管理に特化した製品、給与・労務まで一体化した製品、グループ全体を統制管理する大企業向け製品と、実は3つのタイプに分かれており、自社の拠点規模やバックオフィス体制によって最適解が変わります。FitGapでは、拠点別の権限設定やヘルプ勤務管理など複数拠点ならではの要件を軸に、タイプの見極め方から製品の絞り込み手順までを体系的にまとめました。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
勤怠管理特化で拠点ごとの柔軟運用ができるタイプ 🏢
KING OF TIME 勤怠管理
/ Touch On Time
/ ジョブカン勤怠管理
バックオフィス一体型で拠点管理も効率化するタイプ 🔗
マネーフォワード クラウド勤怠
/ 楽楽勤怠
/ ジンジャー勤怠
大企業・グループ全体を統制管理するタイプ 🏛️
COMPANY 勤怠管理システム
/ TimePro-VG
/ OBIC7 就業情報システム
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
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タイプ別お勧め製品

勤怠管理特化で拠点ごとの柔軟運用ができるタイプ 🏢

このタイプが合う企業:

店舗・営業所・工場など10〜50拠点を運営する中小〜中堅企業の人事・労務担当者で、まず勤怠管理のクラウド化を優先したい方

どんなタイプか:

勤怠管理を専門領域として長年開発されてきた製品群です。複数拠点それぞれの打刻方法や就業ルールを細かく設定でき、拠点ごとに異なるシフト体制や雇用形態にも対応します。FitGapとしては、店舗・営業所が10〜50拠点ほどに分散している中小〜中堅企業で、まず勤怠管理だけを確実にクラウド化したいというケースに最もフィットするタイプだと考えています。打刻手段の豊富さ(ICカード・生体認証・GPS打刻など)が他タイプより際立っており、現場ごとに最適な打刻方法を選べる点が複数拠点運用で大きな強みになります。

このタイプで重視すべき機能:

📊拠点別リアルタイム集計
各拠点の出退勤・残業状況をリアルタイムに本社から一覧で把握できます。拠点ごとの勤怠データを自動集計し、月末の締め作業を大幅に短縮してくれます。
🖐️多様な打刻手段の拠点別選択
ICカード・指紋認証・顔認証・GPS打刻など豊富な打刻方法を拠点の業務特性に合わせて選択・組み合わせできます。オフィスではICカード、外勤先ではスマホGPSといった使い分けが可能です。

おすすめ製品3選

KING OF TIME 勤怠管理
おすすめの理由
勤怠管理クラウド市場シェアNo.1で、打刻手段の豊富さとヘルプ勤務管理機能が複数拠点運用に特に強みを持ちます。全機能を1人月額300円で利用でき、拠点数が多い企業でもコストを抑えやすい製品です。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
累計導入社数が多く、打刻デバイスの多彩さとシンプルな管理画面で、ITリテラシーが高くない現場拠点でも定着しやすい製品です。初期費用無料で拠点追加のハードルが低い点も魅力です。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ジョブカン勤怠管理
おすすめの理由
シリーズ累計導入実績が豊富で、必要な機能だけを選んで契約できるため拠点ごとに異なる運用ニーズに対応しやすいです。ジョブカンシリーズ内で労務・給与と段階的に連携を広げられます。
価格
0円~
ユーザー/月
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

バックオフィス一体型で拠点管理も効率化するタイプ 🔗

このタイプが合う企業:

拠点増加に伴いバックオフィス全体の効率化を目指す中小〜中堅企業で、勤怠・給与・労務をまとめてクラウド化したい管理部門の方

どんなタイプか:

勤怠管理だけでなく、給与計算・経費精算・人事労務など一連のバックオフィス業務をワンプラットフォームで完結できる製品群です。複数拠点の勤怠データがそのまま給与計算に自動連携されるため、拠点間でのデータ転記や手作業の突合が不要になります。FitGapでは、勤怠だけでなく給与・経理まわりもまとめてクラウド化したい成長中の企業に特におすすめしています。拠点が増えるたびに管理負荷が比例して増えるバックオフィス業務を、一つのIDで横断管理できる点がこのタイプ最大のメリットです。

このタイプで重視すべき機能:

給与・労務とのワンクリック連携
勤怠で確定したデータをワンクリックで給与計算へ自動連携できます。拠点ごとにCSVを出力・取り込みする手間がなくなり、給与計算のミスと工数を同時に削減できます。
🔔拠点別集計とアラートの一元管理
複数拠点の36協定超過や有休取得不足をダッシュボードで一括監視し、自動アラートで本人・上長に通知します。拠点が離れていても本社から労務リスクを見落とさない仕組みです。

おすすめ製品3選

マネーフォワード クラウド勤怠
おすすめの理由
マネーフォワードクラウドシリーズの給与・会計・経費と連携でき、拠点別集計機能で打刻時に拠点を選択して集計が可能です。シンプルなUIで現場スタッフにも定着しやすいと評判です。
価格
2,980円
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
楽楽シリーズで経費精算や請求書管理と連携でき、バックオフィス全体を効率化できます。シンプルな操作性で管理者・従業員双方の負担を抑えた拠点展開が可能です。
価格
30,000円
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ジンジャー勤怠
おすすめの理由
ジンジャーシリーズの人事・給与・労務・経費と統合管理でき、従業員データベースを一元化した複数拠点管理が強みです。入社から退職までの人事データを勤怠と紐づけて運用できます。
価格
要問合せ
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

大企業・グループ全体を統制管理するタイプ 🏛️

このタイプが合う企業:

従業員数1,000名以上でグループ会社・全国拠点を持つ大企業の人事部門・情報システム部門で、勤怠と人事給与の一体管理やガバナンス強化を求める方

どんなタイプか:

従業員数が数千〜数万人規模で、グループ会社や全国拠点ごとに異なる就業規則・勤務形態が混在する大企業向けの製品群です。変形労働時間制・フレックス・裁量労働・交代勤務など複雑な勤務体系を一つのシステムで包括的に管理でき、人事・給与基幹システムとの高度な連携が標準で備わっています。FitGapとしては、50拠点を超えるような大規模展開や、グループ横断でのガバナンス強化を重視する企業にはこのタイプが不可欠だと考えています。導入には専門コンサルタントの支援が入るケースが多いですが、その分だけ自社の業務ルールを忠実にシステム化できます。

このタイプで重視すべき機能:

🌐グループ会社横断の就業ルール統合管理
グループ会社ごとに異なる就業規則・勤務形態をノーカスタマイズで1つのシステムに集約できます。拠点や法人をまたいだ異動・兼務にも対応し、全社統一の労務ガバナンスを実現します。
⚠️労務リスクの自動検知・予測アラート
36協定の上限超過や有休取得義務違反などの労務リスクを、未確定の見込みデータも含めて自動検知し予測アラートを発信します。拠点・部門単位の傾向分析でコンプライアンス違反を未然に防ぎます。

おすすめ製品3選

COMPANY 勤怠管理システム
おすすめの理由
大手法人約1,200グループに導入実績があり、大企業特有の複雑な勤務体系をノーカスタマイズの標準機能でカバーします。人事・給与と一体の統合人事システムとしてグループ全体を一元管理できます。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
タイムレコーダーのパイオニアであるアマノ社の大企業向けハイエンドモデルで、ハードウェア連携による正確な打刻管理と、きめ細かな勤務集計機能が強みです。オンプレミス運用にも対応します。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
OBIC7 就業情報システム
おすすめの理由
OBIC7 ERPの一機能として人事・給与・会計と密接に連携し、大企業の基幹システムに組み込んだ運用が可能です。拠点・部門ごとのきめ細かな権限設定とセキュリティ管理に優れています。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

🔐拠点別の権限・閲覧制御
各拠点の管理者が自拠点のデータのみ操作・閲覧できるよう、組織階層に沿ったアクセス権限を細かく設定できる機能です。拠点数が多いほど設定の柔軟さが選定の決め手になります。
📋拠点ごとの就業ルール設定
店舗・工場・オフィスなど拠点によって異なる勤務形態や残業ルール、休日カレンダーを個別に設定できる機能です。FitGapでは、拠点ごとに変形労働やシフトパターンをどこまで分けられるかが最大の差別化ポイントだと考えています。
📊拠点横断のダッシュボード・レポート
全拠点の勤怠データを一画面でリアルタイムに比較・集計できるダッシュボード機能です。残業時間や有休取得率を拠点間で並べて確認できるかどうかで、本部の管理効率が大きく変わります。
🔗給与計算ソフトとのデータ連携
勤怠データをCSVやAPIで給与計算ソフトへスムーズに渡せる機能です。拠点ごとに集計したデータを手作業で変換する手間がなくなるため、FitGapでは連携先の対応範囲を必ず確認するよう推奨しています。
📱打刻方法の多様さ
ICカード・スマホGPS・PC・生体認証など、拠点の業態に合わせて打刻方法を選べる機能です。オフィスはICカード、現場はスマホGPSといった混在運用ができるかが複数拠点では重要になります。
🔄拠点間の異動・ヘルプ勤務の管理
従業員が他拠点へ応援・出張した際に、勤務先拠点を切り替えて正しく勤怠を記録できる機能です。複数拠点ならではの要件であり、対応の有無で製品が大きく絞られます。

一部の企業で必須

🗓️シフト作成・共有
店舗や工場など、シフト制の拠点が多い企業で必須となる機能です。従業員の希望収集から自動作成・公開までをシステム上で完結でき、拠点ごとのシフト管理を効率化します。
⚠️36協定・残業上限アラート
拠点単位や部署単位で36協定の上限値を設定し、超過しそうな従業員を事前にアラートで知らせる機能です。労基署対応が厳しい業種や、拠点ごとに労使協定が異なる企業では必ず確認してください。
🌐多言語対応
外国人従業員が多い製造業や飲食業の拠点で必要になる機能です。英語・ベトナム語・中国語などの画面表示に対応していると、打刻ミスや申請漏れの防止につながります。
⏱️工数・プロジェクト管理
IT企業やコンサル業など、プロジェクト単位で工数を記録したい企業に必要な機能です。勤怠データと紐づけて拠点別・案件別の人件費を可視化できます。
ワークフロー(申請・承認)
残業申請や休暇申請を拠点の上長がオンラインで承認できる機能です。承認ルートを拠点の組織階層に合わせて柔軟に設定できるかがポイントになります。

ほぼ全製品が対応

出退勤の打刻記録
PCやスマホ、ICカードなどで出退勤時刻を正確に記録する、勤怠管理システムの最も基本的な機能です。ほぼすべての製品が標準で備えています。
🧮労働時間の自動集計
日次・月次の労働時間や残業時間、深夜勤務時間などを自動で集計する機能です。手計算の手間とミスを防ぐ基本機能として、どの製品にも搭載されています。
🏖️有給休暇の付与・残日数管理
年次有給休暇の自動付与や取得日数・残日数の管理を行う機能です。年5日の取得義務化への対応もあり、ほぼ全製品が標準で対応しています。
⚖️法改正への自動アップデート
労働基準法などの法改正に合わせてシステムが自動でアップデートされる機能です。クラウド型であればベンダー側で対応してくれるため、ほとんどの製品で標準対応しています。

優先度が低い

🚪入退室管理システム連携
セキュリティゲートや入退室管理と勤怠打刻を連動させる機能です。大規模オフィスや研究施設でない限り優先度は低く、必要になった段階で検討すれば十分です。
🤖AI予測による人員最適化
AIが過去データから人員不足や残業超過を予測する先進的な機能です。FitGapとしては将来的な付加価値として注目していますが、現時点では導入の決め手にはなりにくいと考えています。

複数拠点の勤怠管理システムの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

複数拠点対応の勤怠管理システムを導入する際、どのような点に注意すべきですか?
複数拠点対応の勤怠管理システムの導入を検討しているなら、まず「拠点間での運用ルールの統一化」と「ネットワーク環境とセキュリティ対策」を事前に確認しておくことをおすすめします。拠点間での運用ルールの統一化については、各拠点で異なる勤怠管理の慣行や独自ルールが存在する場合、システム導入時に運用方法を統一することが大切です。また、ネットワーク環境とセキュリティ対策については、複数拠点からのアクセスが集中するため、サーバーの処理能力やネットワーク回線の容量が十分か事前に確認することが大切です。このほか「拠点別の法令や労働条件への対応」「データの整合性と正確性の確保」「導入時の移行作業とスケジュール管理」なども、事前に確認しておくことをおすすめします。

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