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病院の勤怠管理システムおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026年02月27日
病院の勤怠管理システムは、夜勤・当直・宿日直への対応や様式9の自動作成、2024年に始まった医師の働き方改革における水準別の時間外上限管理など、一般企業向け製品にはない機能が求められます。しかし、すべての病院に高機能な専用システムが必要なわけではありません。FitGapでは、製品を「医療業界特化」「大規模組織の統合管理」「汎用クラウド型」の3タイプに分類し、自院の規模や必要な法令対応のレベルに合わせた選び方を解説します。要件定義のポイントから具体的な選定ステップまで、初めてシステムを導入する方にも分かりやすくご案内します。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
医療業界特化タイプ 🏥
キンタイミライ
/ Universal勤次郎
/ TimePro-VG
大規模組織の統合管理タイプ 🏢
COMPANY 勤怠管理システム
/ リシテア/就業管理
/ OBIC7 就業情報システム
汎用クラウド型で手軽に始めるタイプ ☁️
KING OF TIME 勤怠管理
/ ジョブカン勤怠管理
/ Touch On Time
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
すべて表示

タイプ別お勧め製品

医療業界特化タイプ 🏥

このタイプが合う企業:

200床以上の中〜大規模病院で、様式9対応や医師の働き方改革への法令対応を重視する人事・総務部門

どんなタイプか:

病院や医療機関が抱える独自の課題に正面から応える製品グループです。夜勤・当直・宿日直といった複雑な勤務パターンへの対応はもちろん、様式9(入院基本料の届出書)の自動作成や、医師の働き方改革で求められるA水準・B水準・C水準ごとの時間外上限管理など、医療業界ならではの機能が最初から組み込まれています。FitGapでは、200床以上の中〜大規模病院で複数職種を一括管理したい場合に、まず検討すべきタイプだと考えています。設定の自由度が高い反面、導入時の初期設定にはベンダーの支援が不可欠ですので、医療機関への導入実績が豊富かどうかもあわせて確認してください。

このタイプで重視すべき機能:

📋様式9自動作成
勤怠データから看護師の勤務実績を自動反映し、入院基本料の届出に必要な様式9を正確かつ迅速に出力できます。Excelでの手修正が不要になり、診療報酬請求に関わる事務作業を大幅に削減します。
医師の時間外労働上限管理
2024年開始の医師の働き方改革に対応し、A水準(年960時間)やB・C水準(年1,860時間)など施設水準に応じた残業上限をシステムに設定できます。上限超過前にアラートが自動通知されるため、違反リスクを未然に防げます。

おすすめ製品3選

キンタイミライ
おすすめの理由
大規模病院での導入実績が豊富で、月間変形労働時間制や夜勤パターンへの対応力が高く、残業予測機能など医療現場に特化した機能を備えています。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
Universal勤次郎
おすすめの理由
医療機関向けのシフト管理・様式9対応・残業アラートの3機能をすべて標準搭載しており、病院の複雑な就業ルールにきめ細かく対応できます。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
アマノ製の大規模病院向けシステムで、医師の研鑽時間・待機時間の区別管理や宿日直の労働時間自動計算など、医師の働き方改革対応に強みがあります。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

大規模組織の統合管理タイプ 🏢

このタイプが合う企業:

職員500名以上の大規模病院・医療法人グループで、人事・給与・勤怠を一元管理したい経営企画・情報システム部門

どんなタイプか:

数百〜数千名規模の職員を抱える病院グループや、複数拠点を持つ医療法人に向いた製品グループです。勤怠管理だけでなく人事・給与・労務まで一つのプラットフォームで統合管理できるのが最大の特徴で、職種ごとに異なる給与体系や深夜割増・休日手当の自動計算もカバーします。FitGapとしては、既存の人事給与システムとの二重入力をなくしたい、あるいは将来的にグループ全体でシステムを統一したいという病院に最適だと考えます。ただし、導入期間が長めで初期コストも高くなる傾向がありますので、3〜5年のトータルコストで比較検討することをおすすめします。

このタイプで重視すべき機能:

🔗人事・給与・勤怠の一元管理
職員情報・勤怠データ・給与計算を一つのシステムで完結でき、夜勤手当や深夜割増などの複雑な給与計算を自動化します。部門間のデータ連携が不要になり、転記ミスや二重入力の手間をなくせます。
🌐複数拠点・グループ横断管理
本院・分院・訪問看護ステーションなど複数拠点の勤怠情報をリアルタイムに一画面で把握できます。拠点ごとに異なる就業規則やシフトルールを個別設定しながら、グループ全体の労務状況を統合的にモニタリングできます。

おすすめ製品3選

COMPANY 勤怠管理システム
おすすめの理由
大規模法人向けの統合人事システムとして、勤怠・人事・給与をワンプラットフォームで管理でき、数千名規模の病院グループでの導入実績が豊富です。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
リシテア/就業管理
おすすめの理由
日立製の就業管理システムで、大規模組織の複雑な勤務体系と給与連携に強く、病院の変形労働時間制やシフトパターンに柔軟に対応します。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
OBIC7 就業情報システム
おすすめの理由
OBIC7 ERPの一モジュールとして、会計・人事給与とシームレスに連携でき、大規模病院の統合基幹システムとして高い導入シェアを持ちます。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

汎用クラウド型で手軽に始めるタイプ ☁️

このタイプが合う企業:

職員数が数十〜300名程度の中小病院・クリニックで、低コストかつスピーディーに勤怠管理をデジタル化したい管理者

どんなタイプか:

初期費用を抑えて短期間で導入したい、中小規模の病院やクリニックに向いた製品グループです。1名あたり月額200〜400円程度の低コストで始められ、ICカード・スマホ・生体認証など多様な打刻方法が標準搭載されています。夜勤や変形労働時間制にも対応する製品が増えており、基本的な病院の勤怠管理であれば十分カバーできます。FitGapでは、まずは紙やExcelでの管理から脱却したいという病院の第一歩として、このタイプをおすすめしています。ただし、様式9の自動作成や医師の水準別上限管理など、病院特化の高度な機能は非対応の製品もあるため、必要な要件を事前に洗い出してから選定してください。

このタイプで重視すべき機能:

📱多様な打刻方法
ICカード・スマホアプリ・PC・顔認証・指紋認証など豊富な打刻手段が標準で利用でき、忙しい看護師や外回りの多い訪問スタッフでも手軽に正確な打刻ができます。
📅変形労働時間制・シフト管理
1ヶ月単位の変形労働時間制や2交代・3交代のシフトパターンに対応し、シフト表の作成から希望収集・共有までをシステム上で完結できます。人員の過不足もリアルタイムに把握できます。

おすすめ製品3選

KING OF TIME 勤怠管理
おすすめの理由
導入5万5,000社超・利用者330万人超の国内最大級クラウド勤怠で、20種以上の打刻方法と変形労働時間制対応を月額330円/人で利用でき、医療機関の導入実績も豊富です。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ジョブカン勤怠管理
おすすめの理由
医療機関向けの専用機能やセットプランを用意しており、夜勤・宿直対応のシフト作成と36協定アラートを低価格で利用できます。
価格
0円~
ユーザー/月
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
初期費用0円・月額330円/人で全機能が使え、生体認証・ICカード・パスワードの3種打刻を1台のレコーダーで対応できる手軽さが中小病院に支持されています。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

🌙夜勤・当直・宿直のシフト対応力
病院の勤怠管理で最も差が出るのが、2交代制・3交代制や当直・宿直といった医療現場特有の複雑な勤務パターンへの対応力です。FitGapでは、シフトパターンの登録数や日跨ぎ勤務の処理精度を重点的にチェックすることをおすすめしています。製品によって対応できるシフトパターン数が数十〜数万通りまで大きく異なるため、自院の勤務形態を棚卸しした上で比較してください。
📋様式9の出力対応
入院基本料の届出に必要な「様式9」の作成は、病院の勤怠管理で避けて通れない業務です。勤怠データから看護師の勤務実績を自動で反映し、様式9を出力できる製品は一部に限られます。FitGapとしては、この機能の有無が病院向け製品を選ぶうえで最大の分かれ目のひとつだと考えています。
⏱️医師の働き方改革への対応
2024年4月から施行された医師の時間外労働の上限規制(A水準960時間、B・C水準1,860時間)に対応できるかは極めて重要です。水準別の上限設定、勤務間インターバルのアラート、面接指導の記録管理など、法令遵守に直結する機能の有無で製品の適性が大きく変わります。
🔄変形労働時間制への対応
多くの病院が採用している1か月単位の変形労働時間制に正しく対応できるかどうかは選定の決め手になります。日ごと・週ごとの法定労働時間の自動判定や、所定労働時間の柔軟な設定ができない製品を選んでしまうと、残業計算が正しく行えず運用が破綻するリスクがあります。
👩‍⚕️職種別・部署別の勤務ルール設定
医師・看護師・薬剤師・技師・事務職など、病院には職種ごとに異なる勤務ルールが存在します。職種や部署単位で就業規則・シフトパターン・手当計算のルールを個別設定できる柔軟性があるかどうかは、FitGapが特に重視しているポイントです。
💰給与計算システムとの連携
夜勤手当・当直手当・深夜割増など、病院特有の複雑な手当計算を正確に行うためには、勤怠データと給与計算システムのスムーズな連携が欠かせません。API連携やCSV出力の対応範囲、既存の給与ソフトとの相性を事前に確認することが重要です。

一部の企業で必須

🤖自動シフト作成機能
スタッフの希望・スキル・資格・72時間ルールなどの制約条件を考慮して、AIや自動ロジックでシフト表を生成する機能です。看護師数が多い大規模病院ではシフト作成に膨大な時間がかかるため、FitGapでは200床以上の病院には特に重視していただきたい要件だと考えています。
🏥複数拠点の一元管理
分院やサテライト施設、訪問看護ステーションなど複数の拠点を持つ医療法人では、拠点をまたいだ勤怠データの一元管理が必須です。拠点ごとに管理者権限を分けつつ、本部で全体を俯瞰できる仕組みがあるかを確認してください。
🔗電子カルテ・医事システムとの連携
勤怠データを電子カルテや医事会計システムと連携させることで、診療報酬の人員配置基準の充足状況をリアルタイムに把握できます。すべての病院に必須ではありませんが、大規模病院や施設基準の管理が複雑な病院では大きなメリットがあります。
📱オンコール・呼び出し待機の管理
外科系や産科など、オンコール体制を敷いている診療科では、待機時間と実働時間を分けて記録できる機能が必要です。FitGapでは、オンコール対応が多い病院ではこの機能の有無を必ず確認していただくことを推奨しています。
📚自己研鑽・副業時間の区分管理
医師の働き方改革により、労働時間と自己研鑽時間の区分記録が求められるケースが増えています。特にB水準・C水準の指定を受けている病院や、大学病院との人事交流がある病院では、この区分管理への対応が不可欠です。

ほぼ全製品が対応

残業時間の自動集計
打刻データをもとに日次・月次の残業時間を自動で集計する機能は、現在流通しているほぼすべての勤怠管理システムに標準搭載されています。製品間で大きな差はないため、この機能単体を選定基準にする必要はありません。
🏖️有給休暇の取得管理
年次有給休暇の付与日数・取得日数・残日数を自動管理し、年5日の取得義務への対応をサポートする機能です。法令対応として必須ですが、ほぼ全製品が対応しているため差別化要因にはなりにくい領域です。
🔔36協定の超過アラート
設定した時間外労働の上限に近づいた際にアラート通知を出す機能は、多くの製品に搭載されています。ただし、医師の水準別上限に対応したアラートを出せるかどうかは製品によって異なるため、その点は別途確認が必要です。
📲モバイル打刻対応
スマートフォンやタブレットからの打刻に対応する機能は、現在のクラウド型勤怠管理システムではほぼ標準です。訪問診療や在宅医療を行っている場合にはGPS打刻との組み合わせも検討してください。

優先度が低い

🌐多言語対応
外国人スタッフが多い一部の病院では必要になりますが、大半の病院では日本語のみで運用が完結するため、選定時の優先度は低めです。
📊工数・プロジェクト管理機能
研究プロジェクトや治験業務の工数を管理したい大学病院などでは活用の余地がありますが、一般的な病院の勤怠管理においては優先度が低い機能です。

病院の勤怠管理システムの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

病院において勤怠管理システムを導入する際、どのような点に注意すべきですか?
注意点はいくつかありますが、なかでも「既存システムとの連携可否の確認」「複雑な勤務形態への対応可能性」「セキュリティとプライバシー保護」が特に重要です。とりわけ既存システムとの連携可否の確認については、病院では電子カルテや給与システム、人事システムなど既に複数のシステムが稼働しており、新たに導入する勤怠管理システムがこれらと連携できるかを事前に確認することが大切です。また複雑な勤務形態への対応可能性については、病院特有の複雑な勤務形態に対応できるシステムかどうかを慎重に見極めることが大切です。このほか「セキュリティとプライバシー保護」「職員への教育と浸透の必要性」「運用ルールの見直しと統一」なども、事前に確認しておくことをおすすめします。
病院向けの勤怠管理システムは、生成AIやAIエージェントの登場でどのように変化していますか?
病院向けの勤怠管理システムは、生成AIとAIエージェントの登場で急速に進化しています。AI技術の進歩で、従来は手作業だった病院シフト編成が自動化されています。生成AIは膨大な条件を同時に考慮し、スタッフの希望や業務量、労働基準を満たす最適なシフトを瞬時に作成します。これにより看護師や医師の多様な勤務形態に対応可能な柔軟スケジュールが実現し、業務効率や働き手の満足度が向上します。さらに最新のAIスケジューラは利用者のフィードバックを学習する仕組みが備わっており、継続的に出力の精度が改善されることが期待されています。AIエージェントは勤怠管理を自律的に遂行するデジタル・パートナーです。例えば、AIが勤怠データをリアルタイム監視し、未打刻や過剰残業などの異常を即座に検知して担当者に通知する仕組みが登場しています。

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