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農業・林業・漁業向け勤怠管理システムおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/4/9
勤怠管理システムというと、オフィスの入口に置いたタイムレコーダーで打刻するイメージが強いかもしれません。しかし近年は、スマホのGPS打刻やオフライン対応など、現場作業が中心の一次産業でも使える製品が急速に増えています。一方で、農業の労基法適用除外や漁業の断続的勤務、季節雇用の多さなど、一次産業ならではの就業ルールに対応できるかは製品ごとに大きな差があります。FitGapでは、この差を見極めるポイントとして「現場での打刻手段」「就業ルールの複雑度」「給与計算との連携範囲」の3つの軸に注目し、9製品を3タイプに分類しました。自社に合うタイプから選ぶことで、最短ルートで候補を絞り込めます。
レビュー担当 加藤 杏奈
業務システムベンダーでCOMPANY・リシテア等の人事・給与・勤怠システムの導入支援に5年間従事。要件確認・設定・テスト・保守対応まで一連の工程を経験し、制度と運用の両面を踏まえた評価を行っている。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
スマホ打刻・GPS特化タイプ 📍
KING OF TIME 勤怠管理
/ Touch On Time
/ ジョブカン勤怠管理
給与計算・労務一体タイプ 💰
マネーフォワード クラウド勤怠
/ マネーフォワード クラウドERP
/ freee勤怠管理Plus
複雑な就業ルール対応タイプ ⚙️
奉行Edge 勤怠管理クラウド
/ 楽楽勤怠
/ Universal勤次郎
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
すべて表示

タイプ別お勧め製品

スマホ打刻・GPS特化タイプ 📍

このタイプが合う企業:

農地・漁港・山林など事務所外での打刻が中心となる小〜中規模の農業法人・漁業組合・林業事業体

どんなタイプか:

農地・山林・漁港など、オフィスから離れた現場で働くことが前提の一次産業では、スマートフォンのGPS機能を使って「いつ・どこで」打刻したかを記録できることが最も重要です。このタイプの製品は、スマホやタブレットだけで打刻が完結し、位置情報も同時に記録されるため、広域に分散する現場でも不正打刻を防ぎつつ正確な出退勤管理ができます。FitGapでは、事務所にタイムレコーダーを設置できない一次産業の方にまず検討していただきたいタイプと考えています。

このタイプで重視すべき機能:

📡GPS打刻による位置情報記録
スマホで打刻するだけで時刻と位置情報を自動記録します。農地や漁船など離れた現場でも、管理者が管理画面からリアルタイムで勤務場所を確認でき、代理打刻などの不正を防止できます。
📱モバイル対応のシンプル操作
スマホアプリからワンタップで出退勤を記録できるため、ITに不慣れな現場作業者でもすぐに使いこなせます。タイムカードや紙の出勤簿が不要になり、集計作業の手間も大幅に削減できます。

おすすめ製品3選

KING OF TIME 勤怠管理
おすすめの理由
農地や山林に点在する従業員のスマホ打刻を、打刻エリア制限と通信不安定対策までまとめて運用したい農林漁業事業体で第一候補になる製品です。ジオフェンス打刻制限・オフライン打刻・打刻端末連携の3要件をすべて○(対応)しており、電波の届きにくい山間部や漁港でも後からのデータ同期が可能で、事務所に戻った作業員はPCログオンログオフ打刻・チャット打刻も○(対応)と打刻手段を使い分けられます。FitGapの要件対応率はおすすめ9製品中1位(36項目中31件対応)、農業、林業、漁業シェアもおすすめ9製品中2位で、現場の多様な打刻ニーズを1本化したい中〜中規模の農業法人や漁業組合に向きます。一方で料金評価はおすすめ9製品中やや下位寄りのため、従業員が10名前後までの小規模事業体では、より低コストのタイプ内他製品と比較する余地があります。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
スマホ打刻と位置情報記録は押さえつつ、打刻・集計の基本運用を確実に回したい農林漁業事業体で候補になる製品です。オフライン打刻・変形労働時間制対応・現場単位勤怠集計に○(対応)しており、電波が不安定な山林や漁港の現場でも打刻を取りこぼさず、作業場所ごとに労働時間を集計できます。一方でジオフェンス打刻制限・自動シフト生成・打刻端末連携・チャット打刻は×(非対応)のため、打刻エリアを限定して不正防止を徹底したい事業体や、スマホを持たない季節雇用者にタイムレコーダーを併設したい事業体では運用要件を満たしにくい構成です。FitGapの要件対応率はおすすめ9製品中5位タイ(36項目中27件対応)で、GPS打刻を中心にシンプルに使いたい小〜中規模の農業法人向けで、打刻手段の多様化を重視する場合はタイプ内他製品の検討が必要です。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ジョブカン勤怠管理
おすすめの理由
季節雇用が多く人員が入れ替わる農林漁業事業体で、GPS打刻とシフト管理を1人あたり月額を抑えて回したい場合に候補になる製品です。ジオフェンス打刻制限・オフライン打刻・シフトパターン登録・自動シフト生成に○(対応)しており、繁忙期に臨時採用した作業員をシフトに組み込みつつ、打刻エリアを限定して現場打刻させる運用が組めます。FitGapの料金評価はおすすめ9製品中4位タイで、タイプ内3製品の中では導入ハードルの低い料金帯に位置します。一方でシフト希望提出・タスク別打刻は追加オプションでの対応となり、作業員自身に希望を出させたい事業体や、作業種別ごとに工数を取りたい場合は費用上乗せが前提です。PCログオンログオフ打刻は×(非対応)のため、事務所常駐の管理職まで含めた一体運用には他の打刻手段の併用が必要になります。
価格
0円~
ユーザー/月
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

給与計算・労務一体タイプ 💰

このタイプが合う企業:

給与計算や労務手続きも含めて一括で効率化したい農業法人・林業会社・水産加工業者

どんなタイプか:

一次産業では、季節雇用・短期雇用・外国人技能実習生など雇用形態が多様で、農繁期の残業や休日出勤が頻繁に発生します。勤怠データを手作業で給与計算に転記していると、ミスや漏れの温床になりがちです。このタイプは勤怠管理から給与計算・労務手続きまでをワンストップで処理でき、勤怠データが自動的に給与計算へ連携される点が最大のメリットです。FitGapとしては、バックオフィス業務を少人数で回さなければならない一次産業の事業者にこそ効果が大きいタイプだと考えています。

このタイプで重視すべき機能:

🔄勤怠データの給与自動連携
打刻データや残業時間・休日出勤の集計結果が、そのまま給与計算モジュールに自動反映されます。農繁期の変動する労働時間も正確に給与へ反映でき、転記ミスや二重入力を防ぎます。
👥多様な雇用形態への対応
正社員・パート・季節雇用・技能実習生など、異なる就業ルールや賃金体系をシステム上で一元管理できます。雇用形態ごとに割増率や勤務パターンを柔軟に設定でき、複雑な給与計算にも対応します。

おすすめ製品3選

マネーフォワード クラウド勤怠
おすすめの理由
勤怠単体をマネーフォワード クラウドの給与・人事労務とセット運用し、農業法人のバックオフィスを少人数で回したい企業で候補になる製品です。FitGapの操作性評価と料金評価、導入しやすさ評価がいずれもタイプ3製品中で最上位にあたり、経理・労務の専任者を置きにくい中小農業法人でも定着を見込みやすい構成です。中小企業シェアは9製品中で上位に位置し、中堅以下の法人での採用実績が判断材料になります。一方で要件対応数は9製品中8位(36項目中24件対応)と範囲は狭く、オフライン打刻・ジオフェンス打刻制限・セルフィー打刻はいずれも×(非対応)、タイムゾーン対応も×(非対応)のため、電波の届かない山林・沿岸での打刻や外国人技能実習生の異タイムゾーン運用が必要な現場では、GPS特化タイプとの併用検討が必要です。
価格
2,980円
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
マネーフォワード クラウドERP
おすすめの理由
勤怠に加えて給与・会計・経費精算まで同一ベンダーで一気通貫させ、農業法人のバックオフィスをERPパッケージで統合したい企業で候補になる製品です。導入しやすさ評価と料金評価はタイプ3製品中で上位に位置し、勤怠から会計までを個別に調達するより契約・運用窓口を絞り込める点が差別化ポイントです。ただしFitGapの要件対応数は9製品中7位(36項目中25件対応)で、ライン別シフト割当が×(非対応)、オフライン打刻・ジオフェンス打刻制限・セルフィー打刻・タイムゾーン対応もすべて×(非対応)となるため、選果ライン別のシフト編成や電波不安定な圃場での打刻が必要な現場には不向きです。またFitGapのセキュリティ評価はタイプ内で下位のため、監査対応が重い大規模法人では別製品との比較が必要になります。
価格
要問合せ
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
freee勤怠管理Plus
おすすめの理由
勤怠データを給与計算・年末調整までfreee人事労務に流し込み、農業現場の多様な勤務形態を月300円/人台の低コストで回したい小規模事業者で候補になる製品です。FitGapの要件対応数は9製品中3位タイ(36項目中29件対応)で、このタイプ3製品の中では対応範囲が最も広く、オフライン打刻・タスク別打刻・タイムゾーン対応がいずれも○(対応)している点が他2製品との差別化ポイントです。電波が不安定な圃場や、外国人技能実習生を含む多言語現場、作業種別ごとの工数把握を残したい場合に効きます。一方で農業、林業、漁業シェアは9製品中9位と同タイプ内では採用実績が薄く、自動シフト生成は追加オプション、ジオフェンス打刻制限とセルフィー打刻は×(非対応)のため、広域農場でGPS不正打刻対策を重視する体制にはスマホ打刻・GPS特化タイプの比較が必要です。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

複雑な就業ルール対応タイプ ⚙️

このタイプが合う企業:

変形労働時間制や断続的勤務など複雑な就業規則を運用する中〜大規模の農業法人・森林組合・漁業協同組合

どんなタイプか:

一次産業には、農業の労働基準法適用除外や、変形労働時間制、1日に複数回出退勤する断続的勤務など、一般企業にはない独特の就業ルールが存在します。汎用的な勤怠管理システムではこうした特殊ルールに対応しきれないことがあります。このタイプの製品は、就業規則のカスタマイズ性が高く、複雑な勤務パターンや36協定管理にきめ細かく対応できるのが特徴です。FitGapでは、従業員数がある程度多く、勤務ルールの厳密な管理が求められる組織にフィットするタイプと位置づけています。

このタイプで重視すべき機能:

🔧柔軟な勤務パターン設定
変形労働時間制・断続的勤務・1日複数回出退勤など、一次産業特有の勤務形態をシステム上で細かく設定できます。農業の労基法適用除外と適用の両方を切り替えて運用することも可能です。
36協定・残業上限アラート
時間外労働の上限値を任意に設定し、超過が近づくとリアルタイムでアラートを発します。収穫期や伐採期に特定の従業員へ負荷が偏らないよう、管理者が早期に対処できます。

おすすめ製品3選

奉行Edge 勤怠管理クラウド
おすすめの理由
一次産業での採用実績を重視し、給与計算まで同系列で固めたい農業法人・漁協で候補になる製品です。農業・林業・漁業シェアはおすすめ9製品中1位で、同タイプ他製品を大きく引き離しています。変形労働時間制・フレックスタイム制・短時間労働契約管理・派遣労働者管理は○(対応)で、複雑な就業区分の運用自体は問題なく回せます。FitGapのサポート評価・セキュリティ評価はいずれもおすすめ9製品中1位タイで、初期設計が難しい36協定や割増運用を伴走してもらいたい組織に向きます。一方、要件対応率はおすすめ9製品中9位(36項目中23件対応)で、代休・振替休日自動付与とオフライン打刻は×(非対応)、ジオフェンス打刻制限・タイムゾーン対応も×(非対応)です。現場単位勤怠集計・タスク別打刻・シフト管理ソフト連携は追加オプションでの対応となるため、電波が届かない山林や漁場でのオフライン打刻やGPS制限を必須条件とする事業者は同タイプ他製品との比較が必要です。
価格
11,800円
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
複雑な就業ルールを幅広くカバーしつつ、導入コストを抑えて早く立ち上げたい農業法人・組合で候補になる製品です。FitGapの要件対応率はおすすめ9製品中2位(36項目中30件対応)で、このタイプ3製品の中では最も対応範囲が広く、変形労働時間制・時間単位有休・代休振替自動付与・自動シフト生成・ジオフェンス打刻制限・セルフィー打刻・タスク別打刻まで○(対応)しています。FitGapの料金評価と導入しやすさ評価はいずれもおすすめ9製品中1位タイで、複雑な就業規則のシステム化に不安があっても短期間で運用開始しやすい構成です。一方、オフライン打刻は×(非対応)で、看護師夜勤回数管理・介護加算勤務チェック・PCログオンログオフ打刻・予算工数比較も×(非対応)です。電波が届かない山間部や沿岸での打刻を絶対条件にする現場や、組合員の日別工数で予算比較まで管理したい組織では運用上の制約が残ります。
価格
30,000円
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
Universal勤次郎
おすすめの理由
大規模な森林組合・漁協のように勤務区分が多岐にわたり、就業と健康管理を一本化したい組織で候補になる製品です。FitGapの機能性評価はおすすめ9製品中1位タイで、変形労働時間制・ジオフェンス打刻制限・現場単位勤怠集計・タスク別打刻・ライン別シフト割当・派遣労働者管理・看護師夜勤回数管理をいずれも○(対応)しており、複雑な勤務パターンを1製品内で設定しきれる幅があります。医療・福祉シェアはおすすめ9製品中で9(最上位)のため、夜勤・交代制を含む多様な勤務体系を運用してきた実装知見を一次産業の24時間体制にも流用しやすい点が判断材料になります。一方、FitGapの料金評価はおすすめ9製品中9位で、農業・林業・漁業シェアも8位と同タイプ内で下位です。オフライン打刻・PCログオンログオフ打刻は追加オプション、チャット打刻とタイムゾーン対応は×(非対応)のため、小規模な家族経営や、スマホアプリとチャットツールで手軽に打刻運用を回したい事業者には同タイプ他製品のほうが合います。
価格
要問合せ
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

📍GPS・モバイル打刻への対応
農場・山林・漁港など、固定のオフィスを持たない現場で働く従業員が多い一次産業では、スマートフォンのGPS機能を使った打刻が事実上の必須要件です。FitGapとしては、位置情報の記録精度や通信が不安定な場所での動作をしっかり確認することをおすすめします。
🔄変形労働時間制・シフトの柔軟設定
農繁期・漁期など季節によって労働時間が大きく変動する一次産業では、1年単位や1ヶ月単位の変形労働時間制を採用するケースが非常に多いです。この設定を管理画面から柔軟に変更できるかどうかが、製品間の差がもっとも出やすいポイントになります。
⚖️労基法の適用除外ルールへの対応
農業・畜産業は労働基準法上、労働時間・休憩・休日の規定が適用除外になる場合があります。これに対応できず一般企業向けの割増計算しかできない製品も多いため、自社の雇用形態ごとに適用除外の設定ができるかを必ず確認してください。
💰給与計算ソフトとのデータ連携
勤怠データを給与計算に取り込む際、手作業によるCSV加工が必要になると農繁期の事務負担が一気に膨れ上がります。FitGapでは、自社で利用中の給与計算ソフトとAPI連携できるか、少なくとも自動エクスポートに対応しているかを重視すべきと考えています。
🔀1日複数回の出退勤(中抜け)打刻
酪農の朝夕作業や漁業の水揚げタイミングなど、1日に複数回出退勤が発生する働き方は一次産業の特徴的なパターンです。通常の1回打刻しか想定していない製品では正確な実労働時間を把握できないため、中抜け打刻に標準対応しているかが決め手になります。
🪙従業員あたり月額コスト
小規模な農業法人や漁業組合では、従業員数が10名以下のケースも多いです。1人あたり月額300〜500円が相場ですが、最低利用料金が設定されている製品もあるため、少人数でも割高にならないかを事前にシミュレーションしましょう。
👥スマホを持たない従業員への打刻手段
外国人技能実習生や高齢のパート従業員など、個人のスマートフォンを持っていない方が一定数いるのが一次産業の実情です。共有タブレットでのグループ打刻やICカード打刻など、スマホ以外の打刻手段が用意されているかを必ずチェックしてください。

一部の企業で必須

🌏多言語(外国語)対応
外国人技能実習生や特定技能外国人を受け入れている農業法人・水産加工会社では、打刻画面や申請画面が英語・ベトナム語・中国語などに対応しているかが重要です。日本語のみの製品では現場で混乱が生じやすいため、対象言語を事前に確認しましょう。
📋シフト作成・管理機能
大規模な農業法人や養殖場など、複数チームを組んでシフト勤務を回している場合には、シフトの作成・共有・変更管理が勤怠システム上で完結できると大幅に効率が上がります。少人数の家族経営では不要なことも多いため、一部の企業で必須の位置づけです。
📝作業日報・工数管理との連動
GAP認証や森林認証を取得している事業者では、どの作業にどれだけの時間を投入したかの記録が求められます。勤怠データと作業日報を紐付けて管理できると、認証監査への対応が格段に楽になります。
📡オフライン打刻(電波が届かない環境への対応)
山林作業や沖合での漁業など、携帯電話の電波が届かない環境で作業する場合、オフライン状態でも打刻データを端末に保存し、通信復帰時に自動同期できる仕組みが必要です。対応していない製品を選ぶと打刻漏れが頻発する原因になります。
🌾季節雇用者の一括登録・削除
農繁期だけ大量に短期雇用するパターンでは、従業員マスタの一括登録・一括削除がスムーズにできるかが業務効率に直結します。FitGapとしては、CSVインポートによる一括操作に対応しているかを確認することを推奨します。

ほぼ全製品が対応

⏱️残業時間の自動集計
打刻データから日次・月次の残業時間を自動で集計する機能は、現在の勤怠管理システムではほぼ標準装備です。手計算の手間を省けるのはもちろん、集計ミスの防止にもつながりますので、基本機能として期待して問題ありません。
🏖️有給休暇の残日数管理
年次有給休暇の自動付与と残日数管理は、ほぼすべての製品で対応しています。年5日の取得義務化への対応アラートも多くの製品に搭載されていますので、製品間で大きな差が出にくい領域です。
各種申請・承認ワークフロー
休暇申請・残業申請・打刻修正申請といった基本的なワークフロー機能は、ほぼ全製品が備えています。承認ルートの階層設定など細かな差異はありますが、基本的な申請・承認フローはどの製品でもカバーできます。
🔔36協定の超過アラート
時間外労働が36協定の上限に近づいた際に管理者へ自動通知するアラート機能も、現在ではほぼ標準的に搭載されています。一次産業でも法人化が進み、労務コンプライアンスの重要性が高まっているため安心材料のひとつです。

優先度が低い

🏠テレワーク・在宅勤務の管理機能
リモートワーク用のログ取得や在席確認機能は、オフィスワーク中心の業種では重要ですが、現場作業が基本となる農業・林業・漁業ではほとんど使う場面がありません。将来的に事務部門で活用する可能性はあるものの、選定時の優先度は低いです。
📊プロジェクト別の工数按分
コンサルティングやIT企業で重宝されるプロジェクト単位の工数按分機能は、一次産業の現場ではオーバースペックになることがほとんどです。作業日報レベルの記録で十分なケースが大半ですので、この機能のために高額な製品を選ぶ必要はありません。

農業、林業、漁業の勤怠管理システムの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

農業、林業、漁業において勤怠管理システムを導入する際、どのような点に注意すべきですか?
農業、林業、漁業において勤怠管理システムの導入後に「想定外だった」という声が多いのが、「作業場所の通信環境の確認」と「従業員のIT習熟度への配慮」の問題です。作業場所の通信環境の確認については、勤怠管理システムを導入する前に、作業場所でインターネット接続が可能かを確認することが大切です。従業員のIT習熟度への配慮については、農業、林業、漁業では高齢の従業員や、スマートフォンの操作に慣れていない従業員が働いていることがあります。このほか「既存の業務フローとの整合性」「システムの費用対効果の見極め」「データセキュリティとプライバシー保護」なども、事前に確認しておくことをおすすめします。
農業、林業、漁業向けの勤怠管理システムは、生成AIやAIエージェントの登場でどのように変化していますか?
生成AIの普及とAIエージェントの台頭により、農業、林業、漁業向けの勤怠管理システムは新たな段階に入っています。AIエージェントにより勤怠管理のライフサイクルが自動化されつつあります。出退勤データの収集・分析・レポート生成をAIが一手に引き受けることで、人手ミスを削減しリアルタイム監視を実現します。実際、農業現場ではAIが出退勤を監視し不正欠勤を検出することで給与計算エラーを大幅に削減した事例も報告されています。生成AIチャットボットは勤怠関連の問い合わせ対応にも活躍しています。Oracle社によれば、AIチャットボットが新入社員からのよくある質問に即時回答し、まるでパーソナルアシスタントのようにサポートする例が紹介されています。また、勤怠に関わる法改定情報をAIが解析して人事部に通知する取り組みも進められており、規則遵守の自動支援が期待されています。

サービスカテゴリ

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