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農業・林業・漁業向け勤怠管理システムおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026年02月27日
勤怠管理システムというと、オフィスの入口に置いたタイムレコーダーで打刻するイメージが強いかもしれません。しかし近年は、スマホのGPS打刻やオフライン対応など、現場作業が中心の一次産業でも使える製品が急速に増えています。一方で、農業の労基法適用除外や漁業の断続的勤務、季節雇用の多さなど、一次産業ならではの就業ルールに対応できるかは製品ごとに大きな差があります。FitGapでは、この差を見極めるポイントとして「現場での打刻手段」「就業ルールの複雑度」「給与計算との連携範囲」の3つの軸に注目し、9製品を3タイプに分類しました。自社に合うタイプから選ぶことで、最短ルートで候補を絞り込めます。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
スマホ打刻・GPS特化タイプ 📍
KING OF TIME 勤怠管理
/ Touch On Time
/ ジョブカン勤怠管理
給与計算・労務一体タイプ 💰
マネーフォワード クラウド勤怠
/ マネーフォワード クラウドERP
/ freee勤怠管理Plus
複雑な就業ルール対応タイプ ⚙️
奉行Edge 勤怠管理クラウド
/ 楽楽勤怠
/ Universal勤次郎
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
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タイプ別お勧め製品

スマホ打刻・GPS特化タイプ 📍

このタイプが合う企業:

農地・漁港・山林など事務所外での打刻が中心となる小〜中規模の農業法人・漁業組合・林業事業体

どんなタイプか:

農地・山林・漁港など、オフィスから離れた現場で働くことが前提の一次産業では、スマートフォンのGPS機能を使って「いつ・どこで」打刻したかを記録できることが最も重要です。このタイプの製品は、スマホやタブレットだけで打刻が完結し、位置情報も同時に記録されるため、広域に分散する現場でも不正打刻を防ぎつつ正確な出退勤管理ができます。FitGapでは、事務所にタイムレコーダーを設置できない一次産業の方にまず検討していただきたいタイプと考えています。

このタイプで重視すべき機能:

📡GPS打刻による位置情報記録
スマホで打刻するだけで時刻と位置情報を自動記録します。農地や漁船など離れた現場でも、管理者が管理画面からリアルタイムで勤務場所を確認でき、代理打刻などの不正を防止できます。
📱モバイル対応のシンプル操作
スマホアプリからワンタップで出退勤を記録できるため、ITに不慣れな現場作業者でもすぐに使いこなせます。タイムカードや紙の出勤簿が不要になり、集計作業の手間も大幅に削減できます。

おすすめ製品3選

GPS打刻を含む多彩な打刻方法に対応し、一次産業でのシェアも高い定番製品です。スマホ・PC・ICカードなど現場環境に合わせて打刻方法を選べる柔軟性が強みです。
勤怠管理SaaS市場でトップクラスの利用実績を持ち、GPS打刻やモバイル打刻に対応しています。リアルタイム集計と超過アラート機能で、現場の労働時間を即座に把握できます。
月額200円/人〜の低コストで導入でき、GPS打刻にも対応しています。シフト管理や工数管理の機能も備えており、季節ごとに人員が変動する一次産業でも使いやすい製品です。
KING OF TIME 勤怠管理
Touch On Time
ジョブカン勤怠管理
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
価格
0円~
ユーザー/月
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
農業・林業・漁業でのシェア
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
メリットと注意点
メリットと注意点
仕様・機能
仕様・機能
仕様・機能

給与計算・労務一体タイプ 💰

このタイプが合う企業:

給与計算や労務手続きも含めて一括で効率化したい農業法人・林業会社・水産加工業者

どんなタイプか:

一次産業では、季節雇用・短期雇用・外国人技能実習生など雇用形態が多様で、農繁期の残業や休日出勤が頻繁に発生します。勤怠データを手作業で給与計算に転記していると、ミスや漏れの温床になりがちです。このタイプは勤怠管理から給与計算・労務手続きまでをワンストップで処理でき、勤怠データが自動的に給与計算へ連携される点が最大のメリットです。FitGapとしては、バックオフィス業務を少人数で回さなければならない一次産業の事業者にこそ効果が大きいタイプだと考えています。

このタイプで重視すべき機能:

🔄勤怠データの給与自動連携
打刻データや残業時間・休日出勤の集計結果が、そのまま給与計算モジュールに自動反映されます。農繁期の変動する労働時間も正確に給与へ反映でき、転記ミスや二重入力を防ぎます。
👥多様な雇用形態への対応
正社員・パート・季節雇用・技能実習生など、異なる就業ルールや賃金体系をシステム上で一元管理できます。雇用形態ごとに割増率や勤務パターンを柔軟に設定でき、複雑な給与計算にも対応します。

おすすめ製品3選

クラウド給与・人事労務とシームレスに連携し、勤怠から給与明細の発行までワンストップで対応できます。カスタム自動集計機能で農業特有の勤務項目にも柔軟に対応できる点が好評です。
勤怠・給与・会計・経費精算を統合したERPパッケージです。バックオフィス業務をまとめて効率化したい農業法人に適しており、一次産業でも導入実績があります。
freee人事労務との連携で勤怠から給与計算・年末調整まで一気通貫で処理できます。少人数の事業者でも手軽に導入でき、シンプルな操作画面で労務管理の負担を減らせます。
マネーフォワード クラウド勤怠
マネーフォワード クラウドERP
freee勤怠管理Plus
価格
2,980円
無料トライアルあり
価格
要問合せ
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
農業・林業・漁業でのシェア
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
メリットと注意点
メリットと注意点
仕様・機能
仕様・機能
仕様・機能

複雑な就業ルール対応タイプ ⚙️

このタイプが合う企業:

変形労働時間制や断続的勤務など複雑な就業規則を運用する中〜大規模の農業法人・森林組合・漁業協同組合

どんなタイプか:

一次産業には、農業の労働基準法適用除外や、変形労働時間制、1日に複数回出退勤する断続的勤務など、一般企業にはない独特の就業ルールが存在します。汎用的な勤怠管理システムではこうした特殊ルールに対応しきれないことがあります。このタイプの製品は、就業規則のカスタマイズ性が高く、複雑な勤務パターンや36協定管理にきめ細かく対応できるのが特徴です。FitGapでは、従業員数がある程度多く、勤務ルールの厳密な管理が求められる組織にフィットするタイプと位置づけています。

このタイプで重視すべき機能:

🔧柔軟な勤務パターン設定
変形労働時間制・断続的勤務・1日複数回出退勤など、一次産業特有の勤務形態をシステム上で細かく設定できます。農業の労基法適用除外と適用の両方を切り替えて運用することも可能です。
36協定・残業上限アラート
時間外労働の上限値を任意に設定し、超過が近づくとリアルタイムでアラートを発します。収穫期や伐採期に特定の従業員へ負荷が偏らないよう、管理者が早期に対処できます。

おすすめ製品3選

一次産業でシェアトップクラスの実績を持ち、複雑な就業規則にもきめ細かく対応できます。変形労働時間制や多様な割増設定に強く、奉行シリーズとの連携で給与・人事管理も万全です。
シンプルな操作画面ながら、就業ルールの柔軟な設定に対応しています。導入時は専任担当者がサポートするため、複雑な勤務ルールのシステム化に不安がある事業者でも安心して導入できます。
複雑な勤務体系や多様なシフトパターンへの対応力に定評があります。変形労働時間制や様々な手当計算ルールを細かくカスタマイズでき、大規模組織の厳密な就業管理にも対応できます。
奉行Edge 勤怠管理クラウド
楽楽勤怠
Universal勤次郎
価格
11,800円
無料トライアルあり
価格
30,000円
価格
要問合せ
農業・林業・漁業でのシェア
農業・林業・漁業でのシェア
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
メリットと注意点
メリットと注意点
仕様・機能
仕様・機能
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

📍GPS・モバイル打刻への対応
農場・山林・漁港など、固定のオフィスを持たない現場で働く従業員が多い一次産業では、スマートフォンのGPS機能を使った打刻が事実上の必須要件です。FitGapとしては、位置情報の記録精度や通信が不安定な場所での動作をしっかり確認することをおすすめします。
🔄変形労働時間制・シフトの柔軟設定
農繁期・漁期など季節によって労働時間が大きく変動する一次産業では、1年単位や1ヶ月単位の変形労働時間制を採用するケースが非常に多いです。この設定を管理画面から柔軟に変更できるかどうかが、製品間の差がもっとも出やすいポイントになります。
⚖️労基法の適用除外ルールへの対応
農業・畜産業は労働基準法上、労働時間・休憩・休日の規定が適用除外になる場合があります。これに対応できず一般企業向けの割増計算しかできない製品も多いため、自社の雇用形態ごとに適用除外の設定ができるかを必ず確認してください。
💰給与計算ソフトとのデータ連携
勤怠データを給与計算に取り込む際、手作業によるCSV加工が必要になると農繁期の事務負担が一気に膨れ上がります。FitGapでは、自社で利用中の給与計算ソフトとAPI連携できるか、少なくとも自動エクスポートに対応しているかを重視すべきと考えています。
🔀1日複数回の出退勤(中抜け)打刻
酪農の朝夕作業や漁業の水揚げタイミングなど、1日に複数回出退勤が発生する働き方は一次産業の特徴的なパターンです。通常の1回打刻しか想定していない製品では正確な実労働時間を把握できないため、中抜け打刻に標準対応しているかが決め手になります。
🪙従業員あたり月額コスト
小規模な農業法人や漁業組合では、従業員数が10名以下のケースも多いです。1人あたり月額300〜500円が相場ですが、最低利用料金が設定されている製品もあるため、少人数でも割高にならないかを事前にシミュレーションしましょう。
👥スマホを持たない従業員への打刻手段
外国人技能実習生や高齢のパート従業員など、個人のスマートフォンを持っていない方が一定数いるのが一次産業の実情です。共有タブレットでのグループ打刻やICカード打刻など、スマホ以外の打刻手段が用意されているかを必ずチェックしてください。

一部の企業で必須

🌏多言語(外国語)対応
外国人技能実習生や特定技能外国人を受け入れている農業法人・水産加工会社では、打刻画面や申請画面が英語・ベトナム語・中国語などに対応しているかが重要です。日本語のみの製品では現場で混乱が生じやすいため、対象言語を事前に確認しましょう。
📋シフト作成・管理機能
大規模な農業法人や養殖場など、複数チームを組んでシフト勤務を回している場合には、シフトの作成・共有・変更管理が勤怠システム上で完結できると大幅に効率が上がります。少人数の家族経営では不要なことも多いため、一部の企業で必須の位置づけです。
📝作業日報・工数管理との連動
GAP認証や森林認証を取得している事業者では、どの作業にどれだけの時間を投入したかの記録が求められます。勤怠データと作業日報を紐付けて管理できると、認証監査への対応が格段に楽になります。
📡オフライン打刻(電波が届かない環境への対応)
山林作業や沖合での漁業など、携帯電話の電波が届かない環境で作業する場合、オフライン状態でも打刻データを端末に保存し、通信復帰時に自動同期できる仕組みが必要です。対応していない製品を選ぶと打刻漏れが頻発する原因になります。
🌾季節雇用者の一括登録・削除
農繁期だけ大量に短期雇用するパターンでは、従業員マスタの一括登録・一括削除がスムーズにできるかが業務効率に直結します。FitGapとしては、CSVインポートによる一括操作に対応しているかを確認することを推奨します。

ほぼ全製品が対応

⏱️残業時間の自動集計
打刻データから日次・月次の残業時間を自動で集計する機能は、現在の勤怠管理システムではほぼ標準装備です。手計算の手間を省けるのはもちろん、集計ミスの防止にもつながりますので、基本機能として期待して問題ありません。
🏖️有給休暇の残日数管理
年次有給休暇の自動付与と残日数管理は、ほぼすべての製品で対応しています。年5日の取得義務化への対応アラートも多くの製品に搭載されていますので、製品間で大きな差が出にくい領域です。
各種申請・承認ワークフロー
休暇申請・残業申請・打刻修正申請といった基本的なワークフロー機能は、ほぼ全製品が備えています。承認ルートの階層設定など細かな差異はありますが、基本的な申請・承認フローはどの製品でもカバーできます。
🔔36協定の超過アラート
時間外労働が36協定の上限に近づいた際に管理者へ自動通知するアラート機能も、現在ではほぼ標準的に搭載されています。一次産業でも法人化が進み、労務コンプライアンスの重要性が高まっているため安心材料のひとつです。

優先度が低い

🏠テレワーク・在宅勤務の管理機能
リモートワーク用のログ取得や在席確認機能は、オフィスワーク中心の業種では重要ですが、現場作業が基本となる農業・林業・漁業ではほとんど使う場面がありません。将来的に事務部門で活用する可能性はあるものの、選定時の優先度は低いです。
📊プロジェクト別の工数按分
コンサルティングやIT企業で重宝されるプロジェクト単位の工数按分機能は、一次産業の現場ではオーバースペックになることがほとんどです。作業日報レベルの記録で十分なケースが大半ですので、この機能のために高額な製品を選ぶ必要はありません。

農業、林業、漁業の勤怠管理システムの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

農業、林業、漁業において勤怠管理システムを導入する際、どのような点に注意すべきですか?
農業、林業、漁業において勤怠管理システムの導入後に「想定外だった」という声が多いのが、「作業場所の通信環境の確認」と「従業員のIT習熟度への配慮」の問題です。作業場所の通信環境の確認については、勤怠管理システムを導入する前に、作業場所でインターネット接続が可能かを確認することが大切です。従業員のIT習熟度への配慮については、農業、林業、漁業では高齢の従業員や、スマートフォンの操作に慣れていない従業員が働いていることがあります。このほか「既存の業務フローとの整合性」「システムの費用対効果の見極め」「データセキュリティとプライバシー保護」なども、事前に確認しておくことをおすすめします。
農業、林業、漁業向けの勤怠管理システムは、生成AIやAIエージェントの登場でどのように変化していますか?
生成AIの普及とAIエージェントの台頭により、農業、林業、漁業向けの勤怠管理システムは新たな段階に入っています。AIエージェントにより勤怠管理のライフサイクルが自動化されつつあります。出退勤データの収集・分析・レポート生成をAIが一手に引き受けることで、人手ミスを削減しリアルタイム監視を実現します。実際、農業現場ではAIが出退勤を監視し不正欠勤を検出することで給与計算エラーを大幅に削減した事例も報告されています。生成AIチャットボットは勤怠関連の問い合わせ対応にも活躍しています。Oracle社によれば、AIチャットボットが新入社員からのよくある質問に即時回答し、まるでパーソナルアシスタントのようにサポートする例が紹介されています。また、勤怠に関わる法改定情報をAIが解析して人事部に通知する取り組みも進められており、規則遵守の自動支援が期待されています。

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