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工数管理対応の勤怠管理システムおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2025年11月02日
勤怠管理システムの中には、打刻や残業集計だけでなく、プロジェクトごとの作業時間(工数)を記録・集計できる製品があります。ただし「工数管理対応」と一口に言っても、勤怠のついでに工数をざっくり記録できるものから、勤務時間をプロジェクトに按分して原価管理まで行えるもの、大企業のグループ統制に対応するものまで幅広く、自社に合わないタイプを選ぶと現場に定着しません。本ガイドでは、工数管理の目的別に3タイプへ分類した上で、要件の優先度整理から製品の絞り込み手順までを順を追って解説します。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
勤怠管理メインで工数入力もできる汎用タイプ 🕐
KING OF TIME 勤怠管理
/ ジョブカン勤怠管理
/ 楽楽勤怠
勤怠と工数を一画面で一体管理するプロジェクト特化タイプ 📊
チームスピリット
/ マネーフォワード クラウドERP
/ freee勤怠管理Plus
大企業の複雑な就業規則と工数管理を両立するエンタープライズタイプ 🏢
COMPANY 勤怠管理システム
/ TimePro-VG
/ リシテア/就業管理クラウドサービス
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
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タイプ別お勧め製品

勤怠管理メインで工数入力もできる汎用タイプ 🕐

このタイプが合う企業:

勤怠管理の効率化を最優先としつつ、プロジェクト別の労働時間もざっくり把握したい中小〜中堅企業の管理部門の方

どんなタイプか:

勤怠管理システムとしての基本機能(打刻・残業集計・休暇管理など)が充実しており、追加機能として工数管理にも対応しているタイプです。工数管理は補助項目としてプロジェクト名や作業時間を日次で登録する形式が多く、勤怠の延長線上で手軽にプロジェクト別の作業時間を把握できます。FitGapでは、まず勤怠管理をしっかり整えたい企業が、将来的に工数も可視化したいというニーズで選ばれるケースが多いと見ています。

このタイプで重視すべき機能:

📝補助項目による工数記録
日次の勤怠データにプロジェクト名や作業区分を紐づけて工数を記録できます。特別なツールを増やさず、打刻と同じ画面で工数入力が完結するため、従業員の入力負荷が低いのがメリットです。
⏱️多様な打刻方法と勤務形態対応
ICカード・GPS・顔認証・スマホアプリなど複数の打刻手段を備え、変形労働時間制やフレックスタイム制にも柔軟に対応します。拠点が多い企業や在宅勤務が混在する職場でも正確に勤怠データを取得できます。

おすすめ製品3選

KING OF TIME 勤怠管理
おすすめの理由
利用者数420万人超のクラウド勤怠管理シェアNo.1製品です。月額300円/人のワンプライスで工数管理機能も標準搭載されており、補助項目を使ったプロジェクト別の工数記録が手軽に行えます。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ジョブカン勤怠管理
おすすめの理由
シリーズ累計25万社超の導入実績を誇る勤怠管理システムです。出勤管理・シフト管理・休暇管理・工数管理の4機能を自由に組み合わせでき、工数管理だけを追加しても月額が抑えられるのが強みです。
価格
0円~
ユーザー/月
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
楽楽シリーズでおなじみのラクスが提供する勤怠管理システムです。シンプルで直感的なUIが特長で、ITリテラシーを問わず全従業員が使いやすい設計になっています。工数管理機能も搭載しており、導入のハードルが低い製品です。
価格
30,000円
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

勤怠と工数を一画面で一体管理するプロジェクト特化タイプ 📊

このタイプが合う企業:

プロジェクト単位の原価管理・収支管理が経営上必須となるIT開発、広告制作、コンサルティング、建設業などの企業

どんなタイプか:

勤怠データと工数データが同一画面・同一データベースで完全に連動しており、1日の勤務時間をプロジェクトごとに按分入力できるのが最大の特長です。FitGapとしては、IT・広告・コンサル・士業など労務費がプロジェクト原価の大部分を占める「プロジェクト型ビジネス」の企業に最もフィットするタイプだと考えています。勤怠の締め作業と同時にプロジェクト別の労務費が自動算出されるため、月末の突合作業が大幅に削減されます。

このタイプで重視すべき機能:

🔀勤怠時間のプロジェクト按分入力
1日の勤務時間を複数のプロジェクトやタスクに割合・時間で按分入力できます。勤怠時間と工数の合計が必ず一致するため、労務費の二重計上や計上漏れを防ぎ、精度の高い原価計算が実現します。
💹プロジェクト損益のリアルタイム可視化
登録された工数データをもとに、プロジェクトごとの労務費や進捗をリアルタイムにダッシュボードで確認できます。予算超過のアラートや赤字案件の早期発見など、経営判断を支える機能が備わっています。

おすすめ製品3選

チームスピリット
おすすめの理由
勤怠管理・工数管理・経費精算を一体化したワークフォース管理システムです。勤怠と工数を同一画面で入力でき、プロジェクト原価のリアルタイム可視化に強みがあります。Salesforce基盤で大企業のセキュリティ要件にも対応します。
価格
400円
月/ユーザー
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
マネーフォワード クラウドERP
おすすめの理由
勤怠管理を含むバックオフィス業務全般をカバーするERPシリーズです。給与計算・会計とシームレスに連携でき、工数データから算出した労務費をそのまま会計データに反映できるため、経理部門の負荷も大きく軽減されます。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
freee勤怠管理Plus
おすすめの理由
freeeシリーズの勤怠管理製品で、freee工数管理やfreee会計との連携が前提に設計されています。工数データを自動で取り込み、プロジェクト別の収支管理まで一気通貫で行える点が、プロジェクト型ビジネスの企業に支持されています。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

大企業の複雑な就業規則と工数管理を両立するエンタープライズタイプ 🏢

このタイプが合う企業:

従業員数1,000名以上のグループ企業や、複雑な勤務体系・多段階承認・基幹システム連携が必須となる大企業の人事・情報システム部門

どんなタイプか:

数千〜数万人規模の大企業やグループ企業向けに設計されたタイプです。複数法人・複数拠点の異なる就業規則を一元管理しながら、プロジェクト別・部門別の工数管理を同時に行えます。FitGapでは、単に工数が記録できるだけでなく、承認ワークフローの多段階設定やグループ間の人事異動への対応、既存の基幹システム(ERP・給与・人事)との柔軟な連携力がこのタイプ選定の決め手になると考えています。

このタイプで重視すべき機能:

🏗️マルチカンパニー対応・就業規則の個社設定
グループ会社ごとに異なる就業規則・勤務形態・承認フローを個別に設定しつつ、本社から全体を横断的に管理できます。M&Aや組織再編が多い企業でも、柔軟に対応可能です。
🔗基幹システムとの高度な連携
ERPや人事給与システム、会計システムとAPI・CSV等で双方向にデータ連携できます。工数データを原価管理や管理会計にそのまま活用でき、大企業に求められる精緻な経営データ基盤を構築できます。

おすすめ製品3選

COMPANY 勤怠管理システム
おすすめの理由
国内大手企業の約3社に1社が利用する統合人事システムCOMPANYの勤怠管理モジュールです。入社から退職まで人事業務を一気通貫で管理でき、工数管理やマルチカンパニー対応など大規模組織に必要な機能を網羅しています。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
タイムレコーダー大手のアマノが提供するエンタープライズ向け勤怠管理システムです。製造業・医療など多様な業種で実績があり、複雑なシフトや変形労働にも対応しながら工数管理機能を搭載しています。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
リシテア/就業管理クラウドサービス
おすすめの理由
日立ソリューションズが提供する大企業向け就業管理システムです。高度なワークフローや多様な勤務形態への対応力に加え、工数管理やプロジェクト管理機能も備えており、大規模グループでの導入実績が豊富です。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

🔗勤怠と工数の一元入力
打刻と同時にプロジェクトやタスクへの工数入力ができるかどうかは、製品選定で最も差がつくポイントです。一体型の製品であれば、勤務時間の範囲内で各作業に使った時間を割り振れるため、二重入力の手間がなくなり、データの正確性も大幅に向上します。FitGapでは、この機能の有無で日々の運用負担がまったく変わると考えています。
📊プロジェクト別の工数集計・レポート
プロジェクト・タスク・担当者ごとに工数実績を自動集計し、レポートやCSVで出力できる機能です。集計の粒度や切り口は製品によって大きく異なります。日次・月次の自動集計に加え、グラフやダッシュボードで可視化できる製品を選ぶと、経営判断に活かしやすくなります。
⚖️勤怠時間と工数時間の整合チェック
1日の勤務時間と、入力された工数の合計が一致しているかを自動でチェックする機能です。差分がある場合にアラートを出せる製品であれば、サービス残業の検知や工数入力漏れの防止に直結します。FitGapとしては、この突合機能こそが工数管理付き勤怠管理システムの真価だと考えています。
💰労務費・人件費の自動算出
工数データに従業員の単価(想定時給)を掛け合わせて、プロジェクトごとの人件費を自動計算する機能です。原価管理が重要なIT・広告・建設業などでは、この機能があるかないかで月末の締め作業の負荷が大きく変わります。
🔄多様な勤務形態への対応
フレックスタイム制・裁量労働制・変形労働時間制・在宅勤務など、自社の就業ルールに合わせて柔軟に設定できるかどうかです。工数管理を行う企業はIT・制作系が多く、多様な働き方を採用しているケースが大半のため、ここが合わないとそもそも運用に乗りません。
📱工数入力のしやすさ(UI・モバイル対応)
工数管理は全従業員が毎日入力する作業なので、入力画面のわかりやすさやモバイル対応が運用定着を大きく左右します。ドラッグ操作やスマホでのワンタップ入力に対応している製品を選ぶと、入力率が格段に上がります。

一部の企業で必須

📈プロジェクト原価のリアルタイム可視化
工数データと経費データを組み合わせて、プロジェクト単位の原価・損益をリアルタイムで確認できる機能です。月次締めを待たずに赤字案件を早期発見したい場合に必要になりますが、すべての企業に必要なわけではありません。
🚨36協定・残業上限のアラート
法定の残業上限や36協定で定めた時間に近づいた際に、本人や上長に自動で警告を送る機能です。長時間労働が発生しやすいプロジェクト型ビジネスでは特に重要ですが、残業がほぼ発生しない業態では優先度が下がります。
🔁給与計算システムとの連携
勤怠データや工数データをCSVやAPI経由で給与計算ソフトに連携する機能です。既存の給与システムと異なるベンダーの勤怠システムを導入する場合は、連携可否を事前に確認しておく必要があります。
🏢ERP・会計システムとの連携
工数から算出した労務費を会計システムやERPに自動連携し、原価計算や管理会計に活用する機能です。プロジェクト別の損益を全社の会計データと突合したい企業にとっては必須ですが、小規模企業では不要なケースも多いです。
📅カレンダー連携による工数入力の自動化
GoogleカレンダーやOutlookの予定情報を取り込み、工数入力の下書きを自動生成する機能です。会議や打ち合わせが多い企業では入力工数を大幅に削減できますが、対応している製品はまだ限られています。

ほぼ全製品が対応

出退勤の打刻・記録
ICカード・PC・スマホなど複数の打刻手段で出退勤を記録する基本機能です。工数管理対応の製品であっても、ほぼすべてが標準で複数の打刻方法をサポートしています。
🗓️休暇・申請管理
有給休暇の残日数管理や、残業・休暇などの各種申請・承認ワークフローに対応する機能です。法改正により年5日の有休取得義務化が進んでいるため、ほぼ全製品が標準搭載しています。
📂勤怠データの自動集計・CSV出力
労働時間・残業時間・深夜時間などを自動集計し、CSVやExcelで出力する機能です。給与計算の元データとしてほぼすべての製品が対応しています。

優先度が低い

🗂️シフト作成・管理
シフト表の自動作成やスタッフの希望シフト収集などの機能です。工数管理を重視する企業の多くはIT・制作・士業などの固定勤務に近い業種であり、シフト管理の必要性が低いケースが大半です。FitGapでは、工数管理の要件を満たした上で余裕があれば検討する程度で十分と考えています。
🌐多言語対応
画面表示を英語や中国語などに切り替えられる機能です。外国人従業員が多い企業以外では優先度は低いため、必要になった段階で検討すれば問題ありません。

工数管理対応の勤怠管理システムの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

工数管理対応の勤怠管理システムを導入する際、どのような点に注意すべきですか?
工数管理対応の勤怠管理システムの導入で特に押さえておきたいのは「従業員の入力負担と操作の複雑化」と「初期設定とマスタデータ整備の複雑さ」の2点です。従業員の入力負担と操作の複雑化の面では、工数管理システムでは、従来の出退勤記録に加えて、プロジェクト別や作業別の時間入力が必要になります。初期設定とマスタデータ整備の複雑さについては、工数管理システムを効果的に運用するためには、プロジェクトコードや作業区分などのマスタデータを詳細に設定することが大切です。このほか「データ入力の正確性とモニタリングの課題」「システム運用コストと保守の負担」「既存業務プロセスとの整合性」なども、事前に確認しておくことをおすすめします。

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