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公務員向け勤怠管理システムおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026年02月27日
勤怠管理システムと一口に言っても、公務員の世界では民間企業とは事情がまったく異なります。超過勤務や振替休日、会計年度任用職員など独自の制度に加え、LGWAN(行政専用ネットワーク)というセキュリティ要件が製品選定を大きく左右します。実際、紙の出勤簿やExcel管理が残る自治体はいまだ多く、DX化の第一歩として勤怠管理の見直しが急務です。FitGapでは、製品を「公務員専用設計」「大規模人事統合」「シンプル導入・コスト重視」の3タイプに分類し、要件定義から選定手順までを実務目線で解説します。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
公務員専用設計タイプ 🏛️
One人事【Public勤怠管理】
/ COMPANY on LGWAN
/ セコムあんしん勤怠管理サービス
大規模組織向け人事統合タイプ 🏢
POSITIVE
/ COMPANY 勤怠管理システム
/ リシテア/就業管理
シンプル導入・コスト重視タイプ 💰
ジンジャー勤怠
/ 勤革時
/ KING OF TIME 勤怠管理
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
すべて表示

タイプ別お勧め製品

公務員専用設計タイプ 🏛️

このタイプが合う企業:

地方自治体・官公庁で、公務員特有の勤務制度(超過勤務・振替・会計年度任用職員など)にそのまま対応できるシステムを求める人事・庶務担当者

どんなタイプか:

地方自治体や官公庁の勤務制度に特化して設計された勤怠管理システムです。公務員特有の「超過勤務手当」「振替休日」「会計年度任用職員」といった制度にあらかじめ対応しており、LGWAN(行政専用ネットワーク)環境下での利用を前提としています。民間向け製品をカスタマイズして使うのではなく、最初から公務員の就業ルールが組み込まれているため、導入後の設定負担が少ないのが最大の強みです。FitGapとしては、公務員制度への対応度を最重視する自治体にまずおすすめしたいタイプです。

このタイプで重視すべき機能:

📋公務員勤務制度プリセット
交替制勤務・変形労働時間制・夜勤・超過勤務60時間超え・振替休日・会計年度任用職員など、公務員特有の複雑な勤務パターンや手当計算ルールがあらかじめ設定されています。民間向け製品のように一からルールを作り込む手間がかかりません。
🔒LGWAN対応のセキュア接続
自治体のLGWAN(行政専用ネットワーク)環境上で動作するため、インターネットを経由しない閉域ネットワークで安全に利用できます。個人情報を扱う自治体のセキュリティポリシーに合致した運用が可能です。

おすすめ製品3選

One人事【Public勤怠管理】
おすすめの理由
公務員向けに設計された専用プロダクトで、会計年度任用職員や超過勤務の自動集計など自治体固有のニーズに幅広く対応しています。LGWAN連携にも対応済みです。
価格
要問合せ
無料トライアルあり
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
COMPANY on LGWAN
おすすめの理由
大規模自治体向けの総合人事給与・勤怠システムで、LGWAN-ASP上で人事・給与・勤怠を一元管理できます。法改正対応のアップデートも追加費用なしで提供されます。
価格
要問合せ
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
セコムあんしん勤怠管理サービス
おすすめの理由
セキュリティ大手セコムが提供する勤怠管理サービスで、官公庁・公共機関への導入実績が豊富です。堅牢なセキュリティ基盤を背景に、安心して利用できます。
価格
330円
ID/月
無料トライアルあり
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

大規模組織向け人事統合タイプ 🏢

このタイプが合う企業:

職員数が数千人以上の大規模自治体・省庁で、人事・給与・勤怠をまとめてDX化したい情報システム部門や人事部門の責任者

どんなタイプか:

勤怠管理だけでなく、人事情報・給与計算・人材配置までを一つのシステムで統合管理できるタイプです。都道府県庁や政令指定都市のように職員数が数千〜数万人規模の組織では、勤怠データを給与や人事評価と連動させる必要があります。FitGapでは、このタイプは「勤怠管理」を単独で考えるのではなく、人事DX全体の戦略として検討すべき製品群と位置づけています。導入コストは高めですが、将来の業務統合を見据えた場合に最も効率的な選択肢になります。

このタイプで重視すべき機能:

🔗人事・給与・勤怠のワンストップ管理
職員の採用から退職までのライフサイクルを一つのシステム上で管理できます。勤怠データが自動的に給与計算や人事評価に連動するため、部署間でのデータ転記や手動連携が不要になります。
⚙️大規模組織向けの柔軟なカスタマイズ
数万人規模の組織構造や複雑な階層承認フロー、独自の手当体系などに対応できる高いカスタマイズ性を備えています。組織改編や制度変更にも柔軟に追従できます。

おすすめ製品3選

おすすめの理由
大企業・大規模組織向けの統合人事システムで、人事・給与・就業・タレントマネジメントを一元管理できます。官公庁への導入実績も豊富です。
価格
要問合せ
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
COMPANY 勤怠管理システム
おすすめの理由
国内大手企業・大規模法人向けの統合人事ERPとして圧倒的なシェアを持ち、勤怠管理を含む人事業務全体をカバーします。標準機能の網羅性が高く、カスタマイズの余地も豊富です。
価格
要問合せ
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
リシテア/就業管理
おすすめの理由
日立ソリューションズが提供する大規模組織向けの就業管理システムで、複雑な勤務体系への対応力と堅牢なセキュリティが強みです。官公庁・公共セクターでの実績があります。
価格
要問合せ
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

シンプル導入・コスト重視タイプ 💰

このタイプが合う企業:

小〜中規模の自治体・独立行政法人・公的機関で、低コストかつ短期間で勤怠管理のデジタル化を実現したい担当者

どんなタイプか:

比較的小〜中規模の自治体や独立行政法人など、まずは紙やExcelからの脱却を最優先にしたい組織に向いたタイプです。初期費用を抑えて素早く導入でき、1ユーザーあたり月額数百円程度から利用できるのが特徴です。FitGapでは、「高機能よりもまず使い始めること」が大切な組織にはこのタイプを推奨しています。ただし、公務員特有の制度にどこまで対応できるかは製品ごとに差があるため、導入前に自組織の勤務ルールとの適合度を必ず確認してください。

このタイプで重視すべき機能:

🚀低コスト・短期間での導入
初期費用が無料〜少額で、1ユーザー月額200〜400円程度から始められます。クラウド型のためサーバー構築が不要で、申し込みから最短数週間で運用を開始できます。
📱直感的な操作性とモバイル対応
ITに詳しくない職員でも迷わず使えるシンプルな画面設計で、PCだけでなくスマートフォンやタブレットからも打刻・申請が可能です。出先機関や現場勤務の多い組織に適しています。

おすすめ製品3選

ジンジャー勤怠
おすすめの理由
公務員セグメントでのシェアが高く、シンプルな操作性と豊富な打刻方法が魅力です。人事労務・給与など同シリーズの他製品との連携で段階的に機能拡張もできます。
価格
要問合せ
無料トライアルあり
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
日本電気(NEC)が提供するクラウド勤怠管理サービスで、大手ベンダーならではの安定性とサポート体制が公的機関に評価されています。シンプルな料金体系でコストも明瞭です。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
KING OF TIME 勤怠管理
おすすめの理由
クラウド勤怠管理で国内トップクラスのシェアを持つ定番製品です。豊富な打刻方法と柔軟な設定、1人月額300円という低価格で、規模を問わず導入しやすい点が強みです。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
官公庁でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

🏛️公務員独自の勤務制度への対応
公務員には労働基準法ではなく地方公務員法や各自治体の条例が適用されます。変形労働時間制・交替制勤務・裁量労働など、自治体固有の勤務形態を正しく再現できるかが最大の分かれ目です。FitGapでは、ここが合わない製品を選ぶと後から手作業が増えるだけなので、最優先で確認すべきと考えています。
🔒LGWAN対応・閉域網での利用可否
自治体のネットワークはLGWAN(総合行政ネットワーク)が基本です。LGWAN-ASPとして利用できるか、あるいはLGWAN経由のアクセスに対応しているかは、製品を絞り込むうえで決定的な要件になります。インターネット接続のみの製品はそもそも候補から外れるケースが多いです。
👥会計年度任用職員の管理
2020年に施行された会計年度任用職員制度により、非常勤・臨時職員の勤怠管理が一気に複雑化しました。正規職員と会計年度任用職員を同一システムで一元管理でき、それぞれ異なる勤務条件や報酬体系に対応できるかが重要です。
⏱️超過勤務の自動集計と手当計算
公務員の超過勤務は、夜勤・休日出勤・月60時間超の割増など複雑なパターンがあります。これらを自動集計して給与連携用データとして出力できるかどうかで、毎月の庶務担当者の作業負荷が大きく変わります。FitGapとしては手作業をゼロに近づけられる製品を強くおすすめします。
🗓️自治体条例に合わせた休暇制度の設定
年次有給休暇の年度付与・繰越計算はもちろん、夏季休暇・特別休暇・介護休暇・超勤代休時間など、自治体独自の休暇種別をマスタ設定できるかが問われます。付与ルールや取得可能期間が団体ごとに異なるため、柔軟なパラメータ設定ができる製品を選ぶ必要があります。
🔗人事給与システムとのデータ連携
勤怠データの最終的なゴールは給与計算です。既存の人事給与システム(庁内開発やパッケージ)にCSVやAPIでスムーズに連携できるかを必ず確認してください。連携できないと、結局手入力が残り、システム導入の効果が半減します。
📝申請・承認ワークフローの柔軟性
時間外勤務の事前命令・事後報告、各種休暇申請など、公務員特有の厳格な決裁フローをシステム上で完結できるかが重要です。承認ルートを所属・役職に応じて柔軟に設定でき、紙の回議を完全に置き換えられる製品が理想です。

一部の企業で必須

🚨災害・緊急時の特別勤務管理
自治体職員は災害対応で急きょ出勤するケースがあります。通常の勤務体制とは別に、緊急時の人員配置や特別勤務の記録・集計に対応できる機能は、特に防災部門を抱える団体にとって必須です。
🏫教職員・交替制勤務への対応
学校教職員や消防・病院職員など、交替制や変則シフトで働く職員が多い団体では、複雑なシフトパターンの作成・管理機能が欠かせません。一般行政職とは勤務体系がまったく異なるため、混在管理できるかを確認しましょう。
💳マイナンバーカードによる打刻
自治体DXの一環として、職員証やマイナンバーカードをICカードリーダーにかざして打刻したいというニーズが増えています。Felica/Mifare対応のICカード打刻に対応しているか、また既存のカードリーダーとの互換性も確認ポイントです。
🏠テレワーク・在宅勤務の打刻対応
コロナ禍以降、自治体でもテレワークが定着しつつあります。LGWAN環境外からでもセキュアに打刻・申請ができる仕組み(インターネットオプションなど)があるかは、在宅勤務制度を導入済みの団体で特に重要になります。
🏢複数拠点・出先機関の一括管理
本庁だけでなく支所・出張所・学校など、多数の拠点を持つ自治体では、すべての拠点の勤怠データをリアルタイムに一括管理できるかが運用のカギです。拠点ごとに異なる勤務条件を設定しつつ、本庁で横断集計できる仕組みが求められます。

ほぼ全製品が対応

出退勤の打刻記録
Web打刻やICカード打刻など、何らかの方法で出退勤時刻を客観的に記録する機能は、勤怠管理システムの最も基本的な機能です。ほぼすべての製品が対応しています。
📊勤務時間の自動集計
日次・月次の勤務時間を自動で集計し、残業時間や深夜勤務時間を算出する機能です。手計算からの脱却が勤怠システム導入の第一の目的であり、対応していない製品はまずありません。
有給休暇の取得状況管理
年次有給休暇の残日数管理や取得状況の一覧表示は、ほぼ全製品が標準機能として備えています。年5日の取得義務への対応も含め、基本機能として搭載されています。
📁CSVデータの出力
勤怠データをCSV形式でエクスポートする機能は、給与システム連携やExcelでの二次加工のために標準的に備わっています。出力項目のカスタマイズ性には差がありますが、CSV出力自体はほぼ全製品が対応しています。

優先度が低い

📍GPS打刻・位置情報記録
営業職が多い民間企業では重視されるGPS打刻ですが、公務員の場合は庁舎内での勤務が大半のため、位置情報の記録機能の優先度は低めです。外勤が多い一部の部署を除き、選定時に重視する必要はありません。
📐プロジェクト別の工数管理
IT企業やコンサルティング業では必須となる工数管理機能ですが、公務員の勤怠管理では予算科目別の集計ができれば十分なケースがほとんどです。専用の工数管理機能まで求める必要性は低いでしょう。

公務員の勤怠管理システムの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

公務員において勤怠管理システムを導入する際、どのような点に注意すべきですか?
公務員において勤怠管理システムをスムーズに導入するカギは、「情報セキュリティの確保」と「既存システムとの整合性」を事前に把握しておくことです。情報セキュリティの確保については、公務員組織では、職員の個人情報を含む勤怠データを扱うため、情報セキュリティの確保が極めて重要です。既存システムとの整合性については、勤怠管理システムを導入する際には、既存の給与システムや人事管理システムとの整合性を確認することが大切です。このほか「職員への十分な説明と研修」「条例や規則との適合性」「導入後の運用体制の整備」なども、事前に確認しておくことをおすすめします。
公務員向けの勤怠管理システムは、生成AIやAIエージェントの登場でどのように変化していますか?
公務員向けの勤怠管理システムにおいても、生成AIやAIエージェントがもたらす変化は顕著です。世界的に職場での生成AI利用が急増するなか、海外の勤怠管理SaaSでは、生成AIアシスタントに「今月、超過勤務が多い部署は?」「どの課で打刻漏れが多い?」と自然文で聞き、即座にグラフや洞察を返す機能が一般化しつつあります。ADP AssistやLegionのTime and Attendance Assistant、SAPのAIアシスタントなどがその代表例です。今後は公務員向けシステムでも、職員や管理職がチャットで聞けば必要な勤怠情報と示唆が返ってくる世界が標準になっていくでしょう。人事部門で手作業になりがちな勤怠データのチェックも、生成AIとエージェントにより自動監査が進んでいます。

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