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有給管理対応の勤怠管理システムおすすめ9選｜タイプ別の選び方ガイド

更新：2026年02月27日

有給管理機能を備えた勤怠管理システムは、単に有給残日数を記録するだけのツールではありません。2019年の年5日取得義務化以降、自動付与・取得アラート・管理簿出力といった法令対応機能の重要性が急速に高まり、製品ごとの対応力に大きな差が生まれています。さらに、時間単位有給への対応や給与計算ソフトとの連携、独自休暇の登録自由度など、企業の就業規則や規模によって求められる要件は実にさまざまです。FitGapでは、こうした製品間の違いを「中小企業向け勤怠特化」「バックオフィス統合」「大企業・複雑な就業規則対応」の3タイプに整理し、要件定義から製品選定までを一気通貫でガイドします。

FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

タイプ別お勧め製品

中小企業向け勤怠特化タイプ 🏢

このタイプが合う企業：

従業員数が数十名〜数百名規模で、有給管理を含む勤怠業務をまとめてシステム化したい中小企業の人事・労務担当者の方

どんなタイプか：

従業員数が数十名〜数百名規模の企業を中心に、勤怠管理と有給管理をワンストップで効率化することに特化したタイプです。有給の自動付与・残日数計算・年5日取得チェックといった法令対応の基本機能がしっかり備わっていながら、月額数百円/人という手頃な価格帯で導入できます。FitGapとしては、まだExcelや紙のタイムカードで有給を管理している企業が最初に検討すべきグループだと考えています。

このタイプで重視すべき機能：

📊有給自動付与・残日数リアルタイム管理

入社日や勤続年数に応じて有給休暇日数を自動で付与し、取得のたびに残日数をリアルタイムで更新します。年5日取得義務のチェックやアラート通知にも対応しており、Excelでの手計算から解放されます。

🔔年5日未取得アラート・取得促進通知

有給の年5日取得義務を満たしていない従業員を自動で検出し、本人と管理者に通知します。取得期限が迫ると段階的にアラートが届くため、うっかり見落としによる法令違反リスクを大幅に軽減できます。