36協定対応の勤怠管理システムおすすめ9選｜タイプ別の選び方ガイド

更新：2026/5/13

36協定対応の勤怠管理システムは、単なる出退勤の記録ツールではなく、残業上限の超過アラートや特別条項の適用回数カウント、複数月平均80時間チェックといった法令遵守機能を備えた労務リスク管理の要です。ただし、製品によって対応できる協定パターンの複雑さや、給与・労務との連携範囲には大きな差があります。FitGapでは、自社の規模・就業規則の複雑さ・バックオフィス連携の必要性という3つの軸から製品を3タイプに分類し、要件定義から最終選定までを段階的にガイドします。

レビュー担当 加藤杏奈

業務システムベンダーでCOMPANY・リシテア等の人事・給与・勤怠システムの導入支援に5年間従事。要件確認・設定・テスト・保守対応まで一連の工程を経験し、制度と運用の両面を踏まえた評価を行っている。

FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

経費精算システムのおすすめ製品を製品ごとにタイプ、料金、企業規模、評価ポイントで比較する表
製品名	タイプ	料金	企業規模	評価ポイント
KING OF TIME 勤怠管理	中小企業向けのコスパ重視タイプ 💰	300円ユーザー/月	中小中堅大企業	勤怠から人事・給与まで一元管理。機能範囲が広くサポートも手厚い。
ジョブカン勤怠管理	中小企業向けのコスパ重視タイプ 💰	0円~ユーザー/月	中小中堅大企業	必要な勤怠機能だけを選べる。現場・シフト勤務も低コストで始めやすい。
Touch On Time	中小企業向けのコスパ重視タイプ 💰	300円ユーザー/月	中小中堅大企業	現場の打刻を確実に集めやすい。製造・小売での利用傾向も強い。
マネーフォワードクラウド勤怠	バックオフィス一体運用タイプ 🔗	2,980円月	中小中堅大企業	勤怠データを給与・会計へつなげられる。中小企業シェアもトップ。
SmartHR 労務管理	バックオフィス一体運用タイプ 🔗	0円~	中小中堅大企業	労務手続きと従業員情報を一元管理。全社員が使いやすい設計も強み。
ジンジャー勤怠	バックオフィス一体運用タイプ 🔗	要問合せ	中小中堅大企業	人事・給与・経費とつながる多機能な勤怠管理。特殊な打刻や派遣管理にも対応。
COMPANY 勤怠管理システム	大企業・複雑な就業規則対応タイプ 🏢	要問合せ	中小中堅大企業	人事・給与と統合できる大企業向け基盤。複雑な勤務制度にも対応。
TimePro-VG	大企業・複雑な就業規則対応タイプ 🏢	要問合せ	中小中堅大企業	クラウド版とオンプレ版を選べる。連携とセキュリティにも強い。
リシテア/就業管理	大企業・複雑な就業規則対応タイプ 🏢	要問合せ	中小中堅大企業	多様な勤務制度を細かく設定できる。大規模組織での利用傾向も明確。

タイプ別おすすめ製品

中小企業向けのコスパ重視タイプ 💰

このタイプが合う企業：

従業員数が数十〜300名程度の中小企業で、低コストかつスピーディーに36協定対応の勤怠管理を始めたい人事・総務担当者の方

どんなタイプか：

月額を抑えて導入できる勤怠管理システム群です。36協定の残業上限アラートや超過チェックを備え、紙・Excel運用から移りやすい手軽さが特徴です。

このタイプで重視すべき機能：

🔔36協定の超過アラート・残業上限チェック

残業上限に近づいた従業員を検知し、管理者と本人へ通知して36協定違反を防ぎます。

📱多彩な打刻方法とGPS対応

PC、スマホ、ICカードなどの打刻とGPS記録で、勤務場所を問わず客観的な勤怠を残せます。