FitGap | 36協定対応の勤怠管理システムのおすすめ製品を徹底比較！

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36協定対応の勤怠管理システムおすすめ9選｜タイプ別の選び方ガイド

更新：2026年03月05日

36協定対応の勤怠管理システムは、単なる出退勤の記録ツールではなく、残業上限の超過アラートや特別条項の適用回数カウント、複数月平均80時間チェックといった法令遵守機能を備えた労務リスク管理の要です。ただし、製品によって対応できる協定パターンの複雑さや、給与・労務との連携範囲には大きな差があります。FitGapでは、自社の規模・就業規則の複雑さ・バックオフィス連携の必要性という3つの軸から製品を3タイプに分類し、要件定義から最終選定までを段階的にガイドします。

レビュー担当 加藤杏奈

業務システムベンダーでCOMPANY・リシテア等の人事・給与・勤怠システムの導入支援に5年間従事。要件確認・設定・テスト・保守対応まで一連の工程を経験し、制度と運用の両面を踏まえた評価を行っている。

FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

タイプ別お勧め製品

中小企業向けのコスパ重視タイプ 💰

このタイプが合う企業：

従業員数が数十〜300名程度の中小企業で、低コストかつスピーディーに36協定対応の勤怠管理を始めたい人事・総務担当者の方

どんなタイプか：

従業員数が数十〜数百名規模の中小企業に最適な、月額数百円／人から導入できるコストパフォーマンスの高い勤怠管理システムです。36協定の残業上限アラートや超過チェックといった法令対応機能を標準搭載しつつ、初期費用ゼロ・最短即日で運用開始できる手軽さが特長です。FitGapとしては、初めて勤怠管理システムを導入する企業や、紙・Excelからの移行を検討している企業にまずおすすめしたいグループです。

このタイプで重視すべき機能：

🔔36協定の超過アラート・残業上限チェック

月45時間・年360時間などの残業上限に近づいた従業員をリアルタイムで検知し、管理者と本人にアラート通知します。特別条項の年6回制限や複数月平均80時間のチェックにも対応しており、うっかり違反を未然に防ぐことができます。

📱多彩な打刻方法とGPS対応

PC・スマホ・ICカード・生体認証など複数の打刻手段を備えており、オフィス勤務から直行直帰・テレワークまで柔軟にカバーできます。GPS打刻により外出先での打刻位置も記録できるため、客観的な労働時間把握の要件を満たせます。