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病院の勤怠管理システムおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/4/9
病院の勤怠管理システムは、夜勤・当直・宿日直への対応や様式9の自動作成、2024年に始まった医師の働き方改革における水準別の時間外上限管理など、一般企業向け製品にはない機能が求められます。しかし、すべての病院に高機能な専用システムが必要なわけではありません。FitGapでは、製品を「医療業界特化」「大規模組織の統合管理」「汎用クラウド型」の3タイプに分類し、自院の規模や必要な法令対応のレベルに合わせた選び方を解説します。要件定義のポイントから具体的な選定ステップまで、初めてシステムを導入する方にも分かりやすくご案内します。
レビュー担当 加藤 杏奈
業務システムベンダーでCOMPANY・リシテア等の人事・給与・勤怠システムの導入支援に5年間従事。要件確認・設定・テスト・保守対応まで一連の工程を経験し、制度と運用の両面を踏まえた評価を行っている。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
医療業界特化タイプ 🏥
キンタイミライ
/ Universal勤次郎
/ TimePro-VG
大規模組織の統合管理タイプ 🏢
COMPANY 勤怠管理システム
/ リシテア/就業管理
/ OBIC7 就業情報システム
汎用クラウド型で手軽に始めるタイプ ☁️
KING OF TIME 勤怠管理
/ ジョブカン勤怠管理
/ Touch On Time
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
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タイプ別お勧め製品

医療業界特化タイプ 🏥

このタイプが合う企業:

200床以上の中〜大規模病院で、様式9対応や医師の働き方改革への法令対応を重視する人事・総務部門

どんなタイプか:

病院や医療機関が抱える独自の課題に正面から応える製品グループです。夜勤・当直・宿日直といった複雑な勤務パターンへの対応はもちろん、様式9(入院基本料の届出書)の自動作成や、医師の働き方改革で求められるA水準・B水準・C水準ごとの時間外上限管理など、医療業界ならではの機能が最初から組み込まれています。FitGapでは、200床以上の中〜大規模病院で複数職種を一括管理したい場合に、まず検討すべきタイプだと考えています。設定の自由度が高い反面、導入時の初期設定にはベンダーの支援が不可欠ですので、医療機関への導入実績が豊富かどうかもあわせて確認してください。

このタイプで重視すべき機能:

📋様式9自動作成
勤怠データから看護師の勤務実績を自動反映し、入院基本料の届出に必要な様式9を正確かつ迅速に出力できます。Excelでの手修正が不要になり、診療報酬請求に関わる事務作業を大幅に削減します。
医師の時間外労働上限管理
2024年開始の医師の働き方改革に対応し、A水準(年960時間)やB・C水準(年1,860時間)など施設水準に応じた残業上限をシステムに設定できます。上限超過前にアラートが自動通知されるため、違反リスクを未然に防げます。

おすすめ製品3選

キンタイミライ
おすすめの理由
看護師・医師・コメディカルなど職種別の勤務ルールを1基盤で運用しつつ、部署ごとの工数配分まで把握したい病院で候補になる製品です。医療・介護向け勤怠システムは○(推奨)で、看護師夜勤回数管理・介護加算勤務チェック・変形労働時間制対応をすべて○(対応)しています。FitGapの要件対応率はおすすめ9製品中2位(36項目中32件対応)で、医療業界特化タイプ内では予算工数比較・ライン別シフト割当・現場単位勤怠集計も○(対応)のため、病棟別原価や診療科別の人件費可視化まで1つの仕組みで回せます。医療・福祉業界のシェアは同ページで最上位で、自動シフト生成は×(非対応)ですので、シフト作成を自動化したい施設はシフト生成に○(対応)のタイプを併検討してください。導入容易性の評価はおすすめ9製品中9位のため、初期設定を短期で済ませたい病院では負担が残る点に留意が必要です。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
Universal勤次郎
おすすめの理由
病院の個人情報統制と夜勤回数管理を同じ基盤で整えたい医療機関で候補になる製品です。医療・介護向け勤怠システムは○(推奨)で、看護師夜勤回数管理・変形労働時間制対応・36協定関連の労基法帳票出力を○(対応)しています。FitGapのセキュリティ・統制評価はおすすめ9製品中1位タイで、院内の個人情報アクセス管理と勤怠統制を1つの基盤で整理しやすい構成です。一方、介護加算勤務チェック・セルフィー打刻・PCログオンログオフ打刻は追加オプションでの対応で、オフライン打刻と予算工数比較は×(非対応)です。FitGapの要件対応率はおすすめ9製品中6位タイ(36項目中27件対応)のため、必要機能を絞って段階的に拡張したい中規模病院には向きますが、ネットワーク障害時の打刻や診療科別工数分析まで標準で完結させたい大規模病院では不足が出やすく、別タイプ製品との比較が必要になります。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
医師の宿日直・研鑽時間の区分管理を、給与計算や医事システムとの連携まで1本化したい病院で候補になる製品です。医療・介護向け勤怠システムは○(推奨)で、看護師夜勤回数管理・介護加算勤務チェック・変形労働時間制対応・タスク別打刻・予算工数比較をすべて○(対応)しており、医師の時間外上限管理と診療科別工数把握を同時に進められます。FitGapの連携・拡張性評価はおすすめ9製品中1位で、給与・人事・医事との接続を重視する200床以上の病院に向きます。医療業界特化タイプ内ではシェアが最上位で、導入容易性と料金評価もおすすめ9製品中1位タイのため、初期構築の負担を抑えたい場合の選択肢になります。一方、ジオフェンス打刻制限は×(非対応)、自動シフト生成は追加オプションでの対応ですので、訪問診療の位置把握やシフト自動作成を初期から必要とする施設は要件ごとの見積確認が必要です。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

大規模組織の統合管理タイプ 🏢

このタイプが合う企業:

職員500名以上の大規模病院・医療法人グループで、人事・給与・勤怠を一元管理したい経営企画・情報システム部門

どんなタイプか:

数百〜数千名規模の職員を抱える病院グループや、複数拠点を持つ医療法人に向いた製品グループです。勤怠管理だけでなく人事・給与・労務まで一つのプラットフォームで統合管理できるのが最大の特徴で、職種ごとに異なる給与体系や深夜割増・休日手当の自動計算もカバーします。FitGapとしては、既存の人事給与システムとの二重入力をなくしたい、あるいは将来的にグループ全体でシステムを統一したいという病院に最適だと考えます。ただし、導入期間が長めで初期コストも高くなる傾向がありますので、3〜5年のトータルコストで比較検討することをおすすめします。

このタイプで重視すべき機能:

🔗人事・給与・勤怠の一元管理
職員情報・勤怠データ・給与計算を一つのシステムで完結でき、夜勤手当や深夜割増などの複雑な給与計算を自動化します。部門間のデータ連携が不要になり、転記ミスや二重入力の手間をなくせます。
🌐複数拠点・グループ横断管理
本院・分院・訪問看護ステーションなど複数拠点の勤怠情報をリアルタイムに一画面で把握できます。拠点ごとに異なる就業規則やシフトルールを個別設定しながら、グループ全体の労務状況を統合的にモニタリングできます。

おすすめ製品3選

COMPANY 勤怠管理システム
おすすめの理由
数千名規模の病院グループで、勤怠・人事・給与を1基盤にまとめつつ、シフトの自動組成まで内製化したい経営企画部門で候補になる製品です。このタイプ3製品の中で自動シフト生成が○(対応)しているのはこの製品だけで、看護師夜勤回数管理・介護加算勤務チェック・変形労働時間制対応・オフライン打刻・予算工数比較もすべて○(対応)しています。FitGapの要件対応率ではおすすめ9製品中1位(36項目中33件対応)、大企業シェアも同タイプ2製品と並び最上位で、複数拠点の医療法人でシステムを統一する際の基盤として採用しやすい構成です。一方、セルフィー打刻とチャット打刻は×(非対応)のため、スマホ中心で個人認証を厳格に運用したい現場ではType3の汎用クラウド型を併用する判断が必要です。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
リシテア/就業管理
おすすめの理由
病院の変形労働時間制や部署別の複雑な勤務ルールを、大企業向けの人事給与基盤と接続して運用したい医療法人で候補になる製品です。変形労働時間制対応・看護師夜勤回数管理・介護加算勤務チェック・オフライン打刻に○(対応)しており、大企業シェアは同タイプ他製品と並びおすすめ9製品中最上位タイで、製造・金融・情報通信など大規模法人での採用実績が医療以外の業種にも広がっている点は、本部主導で全社標準化する際の判断材料になります。ただしFitGapの要件対応率はおすすめ9製品中8位(36項目中26件対応)で、現場単位勤怠集計・タスク別打刻・予算工数比較・勤怠ダッシュボード・PCログオンログオフ打刻・AI勤怠分析は追加オプション扱い、自動シフト生成・ジオフェンス打刻制限・セルフィー打刻は×(非対応)です。必要機能が多い病院では追加オプションの積み上げで費用が膨らむため、同タイプのType1-1と要件単位で見積比較することをおすすめします。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
OBIC7 就業情報システム
おすすめの理由
会計・人事給与を含む基幹システム全体を1ベンダーに寄せたい大規模病院で、勤怠もその延長として位置づけたい場合に検討対象となる製品です。大企業シェア・金融シェアは同タイプ他製品と並びおすすめ9製品中上位で、全社統制を重視する医療法人本部での採用実績がうかがえます。一方、FitGapの要件対応率はおすすめ9製品中9位(36項目中25件対応)で、介護加算勤務チェック・タスク別打刻・オフライン打刻・ジオフェンス打刻制限・PCログオンログオフ打刻・セルフィー打刻が×(非対応)、シフト希望提出と予算工数比較は追加オプションです。FitGapの料金評価はおすすめ9製品中9位で、導入SIを前提とした費用感になります。介護加算算定を要する療養型病院や、スマホ・PC起点の多様な打刻手段を現場で使い分けたい病院には同タイプのType1-1の方が適合しやすく、基幹ERPとの一元管理を最優先する本部主導の案件で真価を発揮しやすい製品です。
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

汎用クラウド型で手軽に始めるタイプ ☁️

このタイプが合う企業:

職員数が数十〜300名程度の中小病院・クリニックで、低コストかつスピーディーに勤怠管理をデジタル化したい管理者

どんなタイプか:

初期費用を抑えて短期間で導入したい、中小規模の病院やクリニックに向いた製品グループです。1名あたり月額200〜400円程度の低コストで始められ、ICカード・スマホ・生体認証など多様な打刻方法が標準搭載されています。夜勤や変形労働時間制にも対応する製品が増えており、基本的な病院の勤怠管理であれば十分カバーできます。FitGapでは、まずは紙やExcelでの管理から脱却したいという病院の第一歩として、このタイプをおすすめしています。ただし、様式9の自動作成や医師の水準別上限管理など、病院特化の高度な機能は非対応の製品もあるため、必要な要件を事前に洗い出してから選定してください。

このタイプで重視すべき機能:

📱多様な打刻方法
ICカード・スマホアプリ・PC・顔認証・指紋認証など豊富な打刻手段が標準で利用でき、忙しい看護師や外回りの多い訪問スタッフでも手軽に正確な打刻ができます。
📅変形労働時間制・シフト管理
1ヶ月単位の変形労働時間制や2交代・3交代のシフトパターンに対応し、シフト表の作成から希望収集・共有までをシステム上で完結できます。人員の過不足もリアルタイムに把握できます。

おすすめ製品3選

KING OF TIME 勤怠管理
おすすめの理由
職員数が増えた中小病院で、紙やExcelからの脱却と同時に夜勤シフト作成まで1本で回したい場合に候補になる製品です。自動シフト生成が○(対応)、チャット打刻・PCログオンログオフ打刻も○(対応)で、病棟単位の複雑なシフト編成と院内PCでの打刻運用を同じ基盤にまとめられます。FitGapのシェアはおすすめ9製品中1位、要件対応数も3位(36項目中31件対応)で、院内で使える機能の幅では同タイプ3製品の中で最も広くなっています。一方で介護加算勤務チェック、予算工数比較、タスク別打刻は×(非対応)のため、介護医療院を併設して加算要件を厳密に管理したい病院や、部署別の工数分析まで求める場合は同カテゴリの医療業界特化タイプとの比較をおすすめします。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ジョブカン勤怠管理
おすすめの理由
月額コストを抑えつつ変形労働時間制と夜勤シフト作成まで一通り揃えたいクリニックや中小病院に向いた製品です。FitGapの料金評価はおすすめ9製品中1位タイで、同じ汎用クラウドタイプ3製品の中では最も価格面の評価が高い位置にあります。自動シフト生成・ジオフェンス打刻制限・チャット打刻が○(対応)、変形労働時間制・看護師夜勤回数管理も○(対応)で、夜勤シフトを作りながら常勤・非常勤の打刻を院外のスマホからも回収しやすい設計です。ただしPCログオンログオフ打刻は×(非対応)、セルフィー打刻・シフト希望提出・タスク別打刻は追加オプションでの対応となり、院内PCのログから勤務実績を裏付けたい病院や、現場からのシフト希望収集までを標準機能で完結させたい場合には機能の切り出しを確認してから導入してください。介護加算勤務チェックが×(非対応)である点も、併設施設がある病院では注意が必要です。
価格
0円~
ユーザー/月
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
低コストで打刻の選択肢だけを広げたい中小病院やクリニックで候補になる製品です。医療現場では、手袋着用時でも反応しやすい指静脈などの生体認証とICカードを1台で使い分けたいという要望が出やすく、同タイプ3製品の中では打刻方式の運用自由度を重視する病院向けの選択肢です。FitGapのシェアはおすすめ9製品中2位で、中堅・中小規模での採用が同タイプ内では幅広い位置にあります。一方で、自動シフト生成・ジオフェンス打刻制限・打刻端末連携・介護加算勤務チェック・タスク別打刻はすべて×(非対応)で、FitGapの連携評価とサポート評価はおすすめ9製品中で最下位となっています。そのため、夜勤シフトの自動組立や外部の人事・給与・電子カルテ連携を同じ基盤で広げていきたい病院、介護加算要件まで管理したい病院には、同カテゴリの医療業界特化タイプの検討をおすすめします。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

🌙夜勤・当直・宿直のシフト対応力
病院の勤怠管理で最も差が出るのが、2交代制・3交代制や当直・宿直といった医療現場特有の複雑な勤務パターンへの対応力です。FitGapでは、シフトパターンの登録数や日跨ぎ勤務の処理精度を重点的にチェックすることをおすすめしています。製品によって対応できるシフトパターン数が数十〜数万通りまで大きく異なるため、自院の勤務形態を棚卸しした上で比較してください。
📋様式9の出力対応
入院基本料の届出に必要な「様式9」の作成は、病院の勤怠管理で避けて通れない業務です。勤怠データから看護師の勤務実績を自動で反映し、様式9を出力できる製品は一部に限られます。FitGapとしては、この機能の有無が病院向け製品を選ぶうえで最大の分かれ目のひとつだと考えています。
⏱️医師の働き方改革への対応
2024年4月から施行された医師の時間外労働の上限規制(A水準960時間、B・C水準1,860時間)に対応できるかは極めて重要です。水準別の上限設定、勤務間インターバルのアラート、面接指導の記録管理など、法令遵守に直結する機能の有無で製品の適性が大きく変わります。
🔄変形労働時間制への対応
多くの病院が採用している1か月単位の変形労働時間制に正しく対応できるかどうかは選定の決め手になります。日ごと・週ごとの法定労働時間の自動判定や、所定労働時間の柔軟な設定ができない製品を選んでしまうと、残業計算が正しく行えず運用が破綻するリスクがあります。
👩‍⚕️職種別・部署別の勤務ルール設定
医師・看護師・薬剤師・技師・事務職など、病院には職種ごとに異なる勤務ルールが存在します。職種や部署単位で就業規則・シフトパターン・手当計算のルールを個別設定できる柔軟性があるかどうかは、FitGapが特に重視しているポイントです。
💰給与計算システムとの連携
夜勤手当・当直手当・深夜割増など、病院特有の複雑な手当計算を正確に行うためには、勤怠データと給与計算システムのスムーズな連携が欠かせません。API連携やCSV出力の対応範囲、既存の給与ソフトとの相性を事前に確認することが重要です。

一部の企業で必須

🤖自動シフト作成機能
スタッフの希望・スキル・資格・72時間ルールなどの制約条件を考慮して、AIや自動ロジックでシフト表を生成する機能です。看護師数が多い大規模病院ではシフト作成に膨大な時間がかかるため、FitGapでは200床以上の病院には特に重視していただきたい要件だと考えています。
🏥複数拠点の一元管理
分院やサテライト施設、訪問看護ステーションなど複数の拠点を持つ医療法人では、拠点をまたいだ勤怠データの一元管理が必須です。拠点ごとに管理者権限を分けつつ、本部で全体を俯瞰できる仕組みがあるかを確認してください。
🔗電子カルテ・医事システムとの連携
勤怠データを電子カルテや医事会計システムと連携させることで、診療報酬の人員配置基準の充足状況をリアルタイムに把握できます。すべての病院に必須ではありませんが、大規模病院や施設基準の管理が複雑な病院では大きなメリットがあります。
📱オンコール・呼び出し待機の管理
外科系や産科など、オンコール体制を敷いている診療科では、待機時間と実働時間を分けて記録できる機能が必要です。FitGapでは、オンコール対応が多い病院ではこの機能の有無を必ず確認していただくことを推奨しています。
📚自己研鑽・副業時間の区分管理
医師の働き方改革により、労働時間と自己研鑽時間の区分記録が求められるケースが増えています。特にB水準・C水準の指定を受けている病院や、大学病院との人事交流がある病院では、この区分管理への対応が不可欠です。

ほぼ全製品が対応

残業時間の自動集計
打刻データをもとに日次・月次の残業時間を自動で集計する機能は、現在流通しているほぼすべての勤怠管理システムに標準搭載されています。製品間で大きな差はないため、この機能単体を選定基準にする必要はありません。
🏖️有給休暇の取得管理
年次有給休暇の付与日数・取得日数・残日数を自動管理し、年5日の取得義務への対応をサポートする機能です。法令対応として必須ですが、ほぼ全製品が対応しているため差別化要因にはなりにくい領域です。
🔔36協定の超過アラート
設定した時間外労働の上限に近づいた際にアラート通知を出す機能は、多くの製品に搭載されています。ただし、医師の水準別上限に対応したアラートを出せるかどうかは製品によって異なるため、その点は別途確認が必要です。
📲モバイル打刻対応
スマートフォンやタブレットからの打刻に対応する機能は、現在のクラウド型勤怠管理システムではほぼ標準です。訪問診療や在宅医療を行っている場合にはGPS打刻との組み合わせも検討してください。

優先度が低い

🌐多言語対応
外国人スタッフが多い一部の病院では必要になりますが、大半の病院では日本語のみで運用が完結するため、選定時の優先度は低めです。
📊工数・プロジェクト管理機能
研究プロジェクトや治験業務の工数を管理したい大学病院などでは活用の余地がありますが、一般的な病院の勤怠管理においては優先度が低い機能です。

病院の勤怠管理システムの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

病院において勤怠管理システムを導入する際、どのような点に注意すべきですか?
注意点はいくつかありますが、なかでも「既存システムとの連携可否の確認」「複雑な勤務形態への対応可能性」「セキュリティとプライバシー保護」が特に重要です。とりわけ既存システムとの連携可否の確認については、病院では電子カルテや給与システム、人事システムなど既に複数のシステムが稼働しており、新たに導入する勤怠管理システムがこれらと連携できるかを事前に確認することが大切です。また複雑な勤務形態への対応可能性については、病院特有の複雑な勤務形態に対応できるシステムかどうかを慎重に見極めることが大切です。このほか「セキュリティとプライバシー保護」「職員への教育と浸透の必要性」「運用ルールの見直しと統一」なども、事前に確認しておくことをおすすめします。
病院向けの勤怠管理システムは、生成AIやAIエージェントの登場でどのように変化していますか?
病院向けの勤怠管理システムは、生成AIとAIエージェントの登場で急速に進化しています。AI技術の進歩で、従来は手作業だった病院シフト編成が自動化されています。生成AIは膨大な条件を同時に考慮し、スタッフの希望や業務量、労働基準を満たす最適なシフトを瞬時に作成します。これにより看護師や医師の多様な勤務形態に対応可能な柔軟スケジュールが実現し、業務効率や働き手の満足度が向上します。さらに最新のAIスケジューラは利用者のフィードバックを学習する仕組みが備わっており、継続的に出力の精度が改善されることが期待されています。AIエージェントは勤怠管理を自律的に遂行するデジタル・パートナーです。例えば、AIが勤怠データをリアルタイム監視し、未打刻や過剰残業などの異常を即座に検知して担当者に通知する仕組みが登場しています。

サービスカテゴリ

AI・エージェント

汎用生成AI・エージェント
LLM・大規模言語モデル
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エージェントオートメーション基盤

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