テレワークや在宅勤務を中心とした働き方を採用している企業にとって、スマートフォン対応の入退室管理システムは大きな利点があります。従業員が不定期にオフィスに出社する環境では、専用のICカード（社員証などの磁気カード）の管理が困難になりがちです。スマートフォンを使った入退室管理なら、従業員は常に携帯している端末で入退室が可能になります。管理者も誰がいつオフィスにいるかをリアルタイムで把握でき、会議室の予約状況なども確認できます。

営業職や外回りの業務が中心の企業では、従業員がオフィスにいる時間が限られています。このような企業では、スマートフォン対応のシステムが特に有効です。営業担当者は顧客訪問の合間にオフィスに立ち寄る際、スマートフォンで素早く入退室できます。また、外出先から会議室の空き状況を確認したり、オフィスの滞在時間を正確に記録したりすることも可能です。管理者は各営業担当者のオフィス利用状況を把握し、適切な勤怠管理を実現できます。

専用のアプリケーションをスマートフォンにインストールして利用するタイプです。アプリケーション内で認証情報を管理し、Bluetooth（近距離無線通信）やNFC（近接無線通信）を使って扉の開閉を行います。オフラインでも一部機能が利用できるため、ネットワーク環境に左右されにくい特徴があります。ただし、アプリケーションのインストールや更新作業が必要になるため、従業員への導入説明が重要になります。セキュリティレベルも高く、生体認証（指紋や顔認証）と組み合わせた利用も可能です。

スマートフォンのWebブラウザ（インターネット閲覧ソフト）を使って入退室管理を行うタイプです。専用アプリケーションのインストールが不要で、URLにアクセスするだけで利用開始できます。システムの更新や機能追加もサーバー側で実施されるため、従業員側での作業は発生しません。しかしながら、常にインターネット接続が必要になるため、通信環境が不安定な場所では利用に支障が出る可能性があります。また、ブラウザの設定によっては動作が制限される場合もあります。