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個人事業主におすすめ人事システム9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026年02月27日
人事システムと聞くと大企業向けのイメージがありますが、近年はクラウド型の普及により、個人事業主でも月額数百円から導入できる製品が増えています。ただし、ひと口に人事システムといっても、給与計算から届出までワンストップで完結する製品、届出のペーパーレス化に特化した製品、会計・経費精算まで含めてバックオフィスを丸ごと一本化する製品と、カバー範囲は大きく異なります。FitGapでは「自分が一番効率化したい業務はどこか」を軸に製品タイプを見極めることが、失敗しない選定の第一歩だと考えています。本ガイドでは3つのタイプ別におすすめ製品を紹介したうえで、要件定義から最終選定までのステップを解説します。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
給与計算・労務手続き一体タイプ 💰
freee人事労務
/ ジョブカン労務HR
/ マネーフォワード クラウド人事管理
労務手続き特化タイプ 📋
SmartHR 労務管理
/ オフィスステーション 労務
/ 奉行Edge 労務管理電子化クラウド
バックオフィス統合タイプ 🏢
マネーフォワード クラウドERP
/ ジンジャー人事労務
/ チームスピリット
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
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タイプ別お勧め製品

給与計算・労務手続き一体タイプ 💰

このタイプが合う企業:

従業員を1〜10名程度雇用しており、給与計算や社会保険手続きを自力でこなす必要がある個人事業主の方

どんなタイプか:

給与計算、社会保険手続き、年末調整といった日々の労務実務を一つのシステムで完結させることを目的としたタイプです。個人事業主がアルバイトやパートを数名雇用したとき、最も手間がかかるのが毎月の給与計算と社会保険関連の届出です。このタイプの製品は、勤怠データの取り込みから給与明細の発行、社会保険の電子申請までをワンストップでカバーしてくれます。FitGapでは、スタッフを雇い始めたばかりの個人事業主にとって最初に検討すべき王道タイプだと考えています。

このタイプで重視すべき機能:

🧮給与自動計算・Web明細発行
勤怠データをもとに残業代や各種控除を自動計算し、Web上で給与明細を従業員に配信できます。手作業の転記ミスがなくなるだけでなく、紙の印刷・配布も不要になります。
📨社会保険・雇用保険の電子申請
入退社時の社会保険届出や雇用保険手続きをシステム上から電子申請できます。役所へ出向く手間が省けるうえ、申請漏れや記載ミスのリスクも大幅に下がります。

おすすめ製品3選

freee人事労務
おすすめの理由
個人事業主から中小企業まで幅広く導入され、freee会計との連携で給与仕訳の自動記帳まで一気通貫で行える点が最大の強みです。
価格
2,000円
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ジョブカン労務HR
おすすめの理由
シリーズ累計25万社以上の導入実績があり、勤怠管理・給与計算などジョブカンシリーズとの組み合わせで低コストにバックオフィスを統合できます。
価格
0円~
ユーザー
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
マネーフォワード クラウド人事管理
おすすめの理由
マネーフォワードクラウド会計・給与との連携がスムーズで、すでにマネーフォワードで経理を行っている個人事業主にとって追加導入のハードルが非常に低い製品です。
価格
900円
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

労務手続き特化タイプ 📋

このタイプが合う企業:

給与計算は別ソフトで運用中だが、入退社手続き・年末調整・マイナンバー管理などの届出業務を効率化したい個人事業主の方

どんなタイプか:

入退社手続きや年末調整など、定型的な労務書類の作成・届出をペーパーレス化することに特化したタイプです。給与計算は既存のソフトやExcelで対応できているものの、社会保険届出や雇用契約書の作成といった紙仕事に追われている方に向いています。FitGapとしては、すでに給与計算ソフトを導入済みで『届出まわりだけ効率化したい』という個人事業主に特におすすめしています。

このタイプで重視すべき機能:

📝入退社手続きのペーパーレス化
雇用契約書や身元保証書などをオンラインで作成・締結でき、従業員が自分のスマホから必要情報を入力するだけで手続きが完了します。紙の郵送や押印のやり取りが不要になります。
🗓️年末調整のオンライン回収
従業員にアンケート形式で保険料控除や扶養情報を入力してもらい、必要書類を自動生成します。紙の控除証明書を集めて転記する手間がなくなり、年末の繁忙期を大幅に軽減できます。

おすすめ製品3選

SmartHR 労務管理
おすすめの理由
労務手続きのペーパーレス化で圧倒的なシェアを持ち、直感的なUIと豊富な外部連携が評価されています。導入社数3万社以上の実績も安心材料です。
価格
0円~
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
オフィスステーション 労務
おすすめの理由
対応帳票数が118種類と非常に多く、社労士事務所でも採用されるほどの届出業務カバー力が強みです。必要な機能だけを選んで導入できるモジュール型も個人事業主にフィットします。
価格
4,400円
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
奉行Edge 労務管理電子化クラウド
おすすめの理由
奉行シリーズとの連携で総務・人事・労務業務をまとめてデジタル化でき、セキュリティ面でもSOC報告書取得など信頼性の高い製品です。
価格
15,000円
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

バックオフィス統合タイプ 🏢

このタイプが合う企業:

人事労務・会計・経費精算などバックオフィス業務を一人で担っており、複数ソフトの使い分けや手作業連携に限界を感じている個人事業主の方

どんなタイプか:

人事・労務だけでなく、会計・経費精算・請求書管理など経営管理全般を一つのプラットフォームでまとめて運用するタイプです。個人事業主は経理も人事も自分で兼務するケースが大半ですので、データの二重入力やソフト間の連携に悩む方が少なくありません。このタイプなら、給与計算の結果がそのまま会計仕訳に反映されるなど、バックオフィス全体の業務フローを一本化できます。FitGapでは、『ソフトの数をとにかく減らして管理を楽にしたい』という方に最もフィットするタイプだと評価しています。

このタイプで重視すべき機能:

🔗会計・給与・経費の自動データ連携
給与計算の結果が会計ソフトへ自動で仕訳連携され、経費精算データも自動取り込みされます。ソフト間の手作業転記が不要になり、データ不整合のリスクもなくなります。
📊経営ダッシュボードでの一元可視化
人件費・経費・売上などの経営数値をひとつの画面でリアルタイムに確認できます。複数ソフトを行き来せずに事業全体の状況を把握でき、素早い意思決定につながります。

おすすめ製品3選

マネーフォワード クラウドERP
おすすめの理由
会計・給与・勤怠・経費・請求書など幅広いバックオフィス機能をシリーズで提供し、個人事業主でも必要な機能だけを組み合わせてスモールスタートできる柔軟性が魅力です。
価格
要問合せ
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ジンジャー人事労務
おすすめの理由
人事労務・勤怠・給与・経費をジンジャーシリーズで統合管理でき、1ユーザーあたり月額数百円からという高いコストパフォーマンスが個人事業主に適しています。
価格
300円
月/ユーザー
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
チームスピリット
おすすめの理由
勤怠・工数・経費精算を一つのプラットフォームに集約し、Salesforce基盤の高い拡張性を備えています。将来的な業務拡大を見据えた個人事業主にも選ばれています。
価格
400円
月/ユーザー
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

💰給与計算の自動化範囲
個人事業主が人事システムを選ぶうえで最も差が出るポイントです。残業代・社会保険料・所得税の自動計算に加え、賞与計算や振込データの作成まで一気通貫で対応できるかは製品ごとに大きく異なります。FitGapでは、計算だけでなく明細発行・振込連携まで完結する製品を優先的におすすめしています。
🔗会計ソフトとのデータ連携
個人事業主は人事と経理を兼務するケースがほとんどです。そのため、給与データや社会保険料を会計ソフトへ自動仕訳できるかどうかが業務負担を大きく左右します。freee会計やマネーフォワード クラウド会計など、自社の会計ソフトとワンクリックで連携できる製品を選ぶと二重入力がなくなります。
📋年末調整のオンライン完結
個人事業主にとって年末調整は年に一度の大仕事です。従業員へのアンケート配布から控除申告書の自動作成、電子申請による提出まで、すべてオンラインで完結できるかは製品によって対応度が異なります。紙のやり取りが残る製品だと結局手間が減らないため、FitGapではここを必ずチェックするよう推奨しています。
📱従業員セルフサービス(本人入力)
従業員が自分のスマホやPCから個人情報・扶養情報・マイナンバーなどを直接入力できるかどうかは、個人事業主の負担軽減に直結します。紙を配って回収する手間がなくなるだけでなく、転記ミスも防げます。スマホアプリやLINE連携に対応しているかも確認しておくと安心です。
💡少人数向けの料金体系
個人事業主は従業員が数名というケースも多いため、1名あたり月額いくらの従量課金なのか、最低利用人数の縛りはないかが重要です。基本料金が高額な製品を選んでしまうと、少人数ではコストが見合いません。FitGapでは、初期費用ゼロ・月額数百円/人から始められる製品を中心に検討することをおすすめしています。
📤社会保険・労働保険の電子申請
入退社時の健康保険・厚生年金・雇用保険の届出をe-Gov経由で電子申請できるかは、個人事業主にとって大きな時間短縮になります。対応する届出の種類や、加入している健康保険組合のフォーマットに合っているかまで確認しておくと、導入後に「使えなかった」という失敗を防げます。

一部の企業で必須

勤怠管理の内蔵・打刻機能
すでに別の勤怠管理ツールを使っている場合は不要ですが、まだExcelや紙で管理しているなら勤怠機能が内蔵された製品を選ぶとシステムを一本化できます。打刻方法(スマホGPS・ICカード・PC打刻など)やシフト管理への対応範囲は製品ごとに異なるため、自社の働き方に合うか確認してください。
🤝社労士との共有・連携機能
個人事業主の中には社会保険労務士に手続きを委託している方も多いです。その場合、クラウド上で社労士とリアルタイムにデータ共有できる機能があると、書類の郵送やメールでのやり取りが不要になります。社労士側が同じシステムを使えるかどうかも事前に確認しておくと導入がスムーズです。
✍️雇用契約書の電子締結
アルバイトやパートの採用が多い個人事業主では、雇用契約書をオンラインで作成・締結できる機能が重宝します。テンプレートから契約書を生成して電子署名で完結すれば、紙の印刷・押印・郵送がゼロになります。頻繁に人の入れ替わりがない事業者には優先度が下がる要件です。
🏢複数拠点・複数事業の管理
店舗や現場を複数持つ個人事業主の場合、拠点ごとに従業員情報や勤怠を分けて管理できるかがポイントになります。一方、自宅兼オフィスで数名のスタッフだけという方には不要な機能です。将来の事業拡大を見据えて確認しておくと安心です。

ほぼ全製品が対応

🗂️従業員情報の一元管理
氏名・住所・入社日・扶養家族などの基本的な従業員情報をクラウド上で一元管理する機能は、現在の人事システムであればほぼすべての製品に搭載されています。この機能自体では製品間の差が出にくいため、選定の決め手にはなりにくいです。
📄Web給与明細の発行
給与明細をPDFやWeb画面で従業員に配布する機能も、今ではほとんどの製品が標準対応しています。紙の明細を印刷・配布する手間がなくなるのは大きなメリットですが、製品を絞り込む基準にはなりません。
🔒マイナンバーの収集・保管
マイナンバーの安全な収集と暗号化保管は、法令対応として各社が標準機能で提供しています。アクセス権限の設定やログ管理も含めて、どの製品を選んでもほぼ対応済みです。

優先度が低い

🧩タレントマネジメント・人材配置シミュレーション
スキル分析や配置シミュレーションといったタレントマネジメント機能は、数十名〜数百名規模の組織で力を発揮する機能です。従業員が数名規模の個人事業主にとっては過剰な機能であり、コスト増にもつながりやすいため、現段階では優先度を下げてよいでしょう。
🌐多言語対応
外国籍のスタッフが多い事業者でなければ、英語・中国語などの多言語UIは使う機会がほぼありません。将来的に外国人雇用を予定している場合のみ考慮すれば十分です。

個人事業主の人事システムの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

個人事業主向け人事システムは、それ以外の人事システムと何が違いますか?
重要な差異として、大企業向けの人事システムは、数百人から数千人規模の従業員管理に対応しています。人事評価制度や教育研修管理、タレントマネジメント(従業員の能力や適性を把握して配置する仕組み)など、高度な機能を搭載しています。導入費用は高額で、専任の担当者が運用することを前提とした設計です。中堅企業向けの人事システムは、数十人から数百人規模に適しています。組織階層の管理や部門別の集計機能が充実しており、複雑な勤務形態にも対応できます。

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