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中小企業向け電子契約システムおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/4/9
電子契約システムは「契約書をオンラインで締結・保管するツール」という単純な括りでは語れません。近年はクラウド会計との自動連携やAI契約レビューなど、締結の前後工程までカバーする製品が増え、製品ごとの守備範囲に大きな差が生まれています。中小企業にとっての悩みどころは、シンプルに電子化だけしたいのか、バックオフィス全体を効率化したいのか、契約の管理・更新まで一元化したいのかで最適な製品がまったく変わる点です。FitGapでは、この「どこまでの業務範囲をカバーしたいか」という軸で製品を3タイプに整理し、要件定義から選定までをステップごとにガイドします。
レビュー担当 松浦 大輔
知財管理士3級・薬事法管理者の資格を保有。マスターピース・グループでは法務として契約レビューや労働紛争・訴訟対応に従事し、法務実務の視点から製品を評価している。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
契約締結特化・スモールスタートタイプ 🚀
電子印鑑GMOサイン
/ 契約大臣
/ ベクターサイン
バックオフィス連携・業務効率化タイプ 🔗
freeeサイン
/ マネーフォワード クラウド契約
/ ジンジャーサイン
契約ライフサイクル管理タイプ 📂
クラウドサイン
/ BtoBプラットフォーム 契約書
/ Shachihata Cloud
企業規模
中小企業
個人事業主
機能
その他
すべて表示

タイプ別お勧め製品

契約締結特化・スモールスタートタイプ 🚀

このタイプが合う企業:

月間の契約件数が少なく、初期費用・ランニングコストを最小限に抑えて電子契約を導入したい中小企業やスタートアップ

どんなタイプか:

「まずは紙の契約をなくしたい」「できるだけコストを抑えて電子契約を始めたい」という中小企業に最適なタイプです。契約書のアップロード→電子署名→締結→保管というシンプルな流れに絞り込んだ設計で、無料プランや低価格プランが用意されている製品が多いのが特徴です。FitGapでは、月間の契約件数が少なく、まず電子契約の第一歩を踏み出したい企業にこのタイプをおすすめしています。

このタイプで重視すべき機能:

💰無料プラン・低価格プラン
月額0円〜数千円台で利用できるプランが用意されており、送信件数が少ない企業でも費用対効果が合いやすいです。FitGapとしては、月5〜10件程度の契約なら無料プランでも十分運用可能と考えています。
✉️取引先アカウント不要の署名機能
相手方がサービスのアカウントを持っていなくても、メールやSMSのリンクから署名できる仕組みです。取引先に負担をかけずに電子契約を始められるため、中小企業同士のやり取りでもスムーズに導入が進みます。

おすすめ製品3選

電子印鑑GMOサイン
おすすめの理由
紙契約を電子化しつつ、将来の署名方式や契約種別の広がりにも1製品で備えたい中小企業で候補になる製品です。立会人型と当事者型の両運用を想定した厳格署名運用利用は○(対応)、大量送信利用・B2C署名利用・雇用・人事契約利用もすべて○(推奨)で、ページ9製品中のどの用途でも運用範囲を絞らずに始められます。タイムスタンプ・長期署名対応(LTV)・電子帳簿保存法対応もそろっており、FitGapのセキュリティ評価はおすすめ9製品中1位タイ、中小企業シェアも1位タイです。一方、AIドラフトや条件分岐承認は×(非対応)のため、契約書作成の自動化や複雑な承認分岐を重視する企業はバックオフィス連携型やCLM型との比較が必要です。
価格
0円~
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
月数件の契約から費用対効果を確かめつつ電子契約を始めたい中小企業で候補になる製品です。FitGapの料金評価と導入しやすさ評価はおすすめ9製品中ともに1位タイで、低価格プランから段階的に送信量を増やせる設計が、まだ電子契約の運用が固まっていない企業と相性よく機能します。署名2FA対応・多段階承認・タイムスタンプ・監査証跡出力・更新ワークフローは○(対応)で、社内承認と更新管理という中小企業が最初に必要とする業務は一通りカバーできます。ただし一括送信・Webフォーム署名・電子証明書署名対応・eKYC本人確認は×(非対応)のため、送信件数が月数百件規模に伸びる企業や厳格な本人確認を求める取引が多い企業は、同タイプ他製品や契約ライフサイクル管理タイプとの比較が必要です。
価格
0円~
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ベクターサイン
おすすめの理由
スモールスタートしつつも、取引先から電子証明書付きの署名を求められるケースに備えたい中小企業で候補になる製品です。このタイプ3製品のうち電子証明書署名対応を○(対応)しているのはこの製品のみで、署名2FA対応・長期署名対応(LTV)・タイムスタンプ対応・電子帳簿保存法対応もすべて○(対応)しています。FitGapの料金評価はおすすめ9製品中1位タイ、中小企業シェアも2位タイで、価格を抑えつつ当事者型署名を選べる中小企業向けの選択肢になります。一方、一括送信・Webフォーム署名・外部文書管理・eKYC本人確認は×(非対応)で、API連携の拡張性も同タイプ内では低めです。大量送信や他システム連携を前提にした運用を想定している場合は、バックオフィス連携型や契約ライフサイクル管理タイプとの比較が必要です。
価格
0円~
1通
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

バックオフィス連携・業務効率化タイプ 🔗

このタイプが合う企業:

クラウド会計や経費精算システムをすでに導入しており、契約業務を含むバックオフィス全体をシームレスに効率化したい中小企業

どんなタイプか:

電子契約の締結だけでなく、会計・経費精算・請求書といったバックオフィス業務と一気通貫で連携できるタイプです。契約締結と同時に仕訳の自動生成や支払い管理まで連動するため、管理部門の二重入力や転記ミスを大幅に削減できます。FitGapでは、すでにfreeeやマネーフォワードなどのクラウド会計を利用している企業にとって、最も導入効果が出やすいタイプだと考えています。

このタイプで重視すべき機能:

🔄クラウド会計・経費精算との自動連携
契約締結をトリガーに仕訳データや支払い依頼を自動生成し、会計ソフトへ連携します。手入力の手間が省けるだけでなく、入力ミスや計上漏れといったヒューマンエラーのリスクも低減できます。
📋ワークフロー(社内承認)機能
契約書の起案から上長承認・法務確認・締結までの一連の承認フローをシステム上で完結できます。承認状況がリアルタイムで可視化されるため、「誰で止まっているか」が一目で分かり、契約締結のスピードが上がります。

おすすめ製品3選

freeeサイン
おすすめの理由
freee会計・人事労務をすでに使っている中小企業で、契約締結から仕訳連携までを1つの基盤で回したい場合の第一候補になる製品です。FitGapの要件対応率は同タイプ3製品中1位(43項目中18件対応)で、連携・拡張性評価もおすすめ9製品中1位タイ、中小企業シェアも1位タイです。契約義務管理・CRM連携・Webフォーム署名に○(対応)しており、受注から契約・会計までのデータ分断を抑えられます。一方、freeeエコシステム外の企業では連携による利点が薄れ、電子証明書署名や多段階承認は追加オプション扱いのため、厳格な社内統制や本人性を重視する管理部門では契約締結特化タイプとの比較が必要です。
価格
0円~
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
マネーフォワード クラウド契約
おすすめの理由
マネーフォワード クラウド会計・請求書をすでに運用している中小企業で、契約書も同じバックオフィス共通UIで回したい場合に候補になる製品です。FitGapの料金評価はおすすめ9製品中1位タイ、使いやすさ・サポート・連携評価も2位タイで、月額固定の料金体系と大量送信○(対応)により件数が増えても運用コストが読みやすい設計です。中小企業シェアは2位タイで採用実績も一定あります。ただし要件対応数は同タイプ3製品中最下位の11件で、電子帳簿保存法対応・対面署名・電子証明書署名・署名2FAは×(非対応)です。対面締結や厳格な本人確認が中心の業種では、freeeサインや他タイプとの比較が必要になります。
価格
900円
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ジンジャーサイン
おすすめの理由
ジンジャー人事労務をすでに使っており、雇用契約や業務委託契約を人事データと紐づけて運用したい中小企業で候補になる製品です。FitGapの要件対応率は同タイプ3製品中2位(43項目中17件対応)で、契約義務管理・更新ワークフロー・配信ステータス分析・カスタムメタデータに○(対応)しており、人事異動に合わせた更新運用や監査対応を想定した設計です。雇用・人事契約利用は○(推奨)で、厳格署名運用利用にも○(推奨)です。一方、電子証明書署名・Webフォーム署名・電子帳簿保存法は×(非対応)のため、取引先向けB2B契約の大量送信や電帳法対応を主軸に据える企業では、freeeサインやマネーフォワード クラウド契約との比較が必要です。
価格
要問合せ
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

契約ライフサイクル管理タイプ 📂

このタイプが合う企業:

契約書の種類・件数が多く、作成から更新管理・保管までを一元化したい中小企業。紙の契約書が残っており、電子データと統合管理したい企業

どんなタイプか:

契約書の作成・テンプレート管理から、締結、更新期限の自動通知、保管・検索まで、契約のライフサイクル全体をカバーするタイプです。紙の契約書をスキャンして電子データと一元管理できる製品も多く、電子契約への移行期にありがちな「紙と電子の二重管理」問題を解消できます。FitGapとしては、取り扱う契約書の種類や件数が多い中小企業、あるいは過去の紙契約も含めて一元管理したい企業にこのタイプをおすすめします。

このタイプで重視すべき機能:

📝テンプレート管理・契約書作成支援
NDAや業務委託契約書などの雛形をテンプレートとして登録しておけば、毎回ゼロから作成する手間がなくなります。入力項目の自動補完や条文のバリエーション管理にも対応し、契約書の品質を均一に保てます。
🔔更新期限アラート・台帳管理
契約の満了日や自動更新日が近づくと自動で通知してくれる機能です。更新漏れによる意図しない契約失効や、解約し忘れによる無駄なコスト発生を未然に防ぐことができます。台帳画面で全契約の状況を一覧管理できる点も実務上の大きなメリットです。

おすすめ製品3選

クラウドサイン
おすすめの理由
取引先にも普及している電子契約サービスで社内外の契約書を一元的に回したい中小企業で第一候補となる製品です。中小企業シェアはおすすめ9製品中1位タイで、相手方の受信経験が揃いやすく依頼時の操作説明コストを抑えやすい点が決め手になります。FitGapの機能性評価とサポート評価はともにおすすめ9製品中単独1位、連携評価も1位タイで、長期署名・タイムスタンプ・契約義務管理に○(対応)しており締結後の保管運用まで1つの画面で確認できます。一方で多段階承認・条件分岐承認は×(非対応)、テンプレート管理やAI‑OCR台帳は追加オプション扱いのため、部署ごとに承認ルートが分岐する中小企業や料金評価を最優先する企業では、要件対応数で上回る同タイプの他製品も併せて比較する価値があります。
価格
0円~
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
BtoBプラットフォーム 契約書
おすすめの理由
紙と電子が混在した契約書類を社内承認ワークフローに乗せて一覧管理したい中小企業で候補になる製品です。FitGapの要件対応率は同タイプ3製品中1位(43項目中16件対応)で、多段階承認・条件分岐承認・外部文書管理・更新リマインド・カスタムメタデータ・配信ステータス分析にすべて○(対応)しており、既存の紙契約もスキャンして台帳に取り込みながら締結後の更新漏れを防ぐ運用が組めます。一括送信も○(対応)のため請求書・発注書を多数発行する卸売や飲食系の中小企業と相性が良く、実際に卸売・小売業界シェアは1位、飲食・宿泊業界シェアも1位タイです。ただし電子証明書署名・対面署名・eKYC本人確認は×(非対応)のため、当事者型の厳格署名運用や店頭での対面締結を前提とする企業には向きません。
価格
10,000円
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
Shachihata Cloud
おすすめの理由
押印文化が残る中小企業で、電子印鑑の見た目と承認ルートを保ったまま契約書の作成から締結・保管までを移行したい場合の候補です。対面署名・多段階承認・条件分岐承認にすべて○(対応)している製品は同タイプ3製品中この製品のみで、店頭や現場で相手方と顔を合わせて締結する運用と、本社側の稟議フローを1つの基盤に収められます。長期署名(LTV)と電子帳簿保存法対応も○(対応)しており、建設・不動産業界シェアは2位、官公庁シェアも2位タイで、取引先や発注者に押印済み書類のイメージを共有しやすい点も判断材料になります。一方で更新リマインドは×(非対応)、契約義務管理・AI‑OCR台帳は追加オプション扱いのため、満了日管理や過去契約の全文検索までを標準機能で完結させたい中小企業には他製品との比較が必要です。
価格
¥13,200
年額/5ユーザー
無料トライアルあり
中小企業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

✍️署名方式の選択肢(立会人型・当事者型)
電子契約システムの選定で最も差がつくのが、署名方式に対応しているかどうかです。多くの中小企業は手軽な「立会人型」だけで十分ですが、不動産や金融など証拠力が求められる契約では「当事者型」が必要になります。FitGapでは、自社の契約書の種類を棚卸しして、立会人型だけで足りるのか、当事者型も使い分けたいのかを最初に整理することをおすすめしています。
💰料金体系(従量課金 vs 月額固定)
電子契約システムの料金体系は大きく「送信件数ごとの従量課金」と「月額固定制」に分かれます。月に数件しか送らない企業と、数十件送る企業では最適なプランがまったく異なります。FitGapとしては、月額基本料だけでなく1件あたりの送信料やユーザー追加料金も含めた年間総コストで比較することが鉄則だと考えています。
📄契約書テンプレート・一括作成機能
契約書をゼロから毎回作るのは中小企業にとって大きな負担です。よく使う契約書のひな形をテンプレートとして登録し、宛先だけ変えて一括作成できる機能があると、業務効率が劇的に上がります。特に雇用契約や業務委託契約など定型文書が多い企業は、テンプレートの充実度を必ずチェックしてください。
🔀社内承認ワークフロー機能
契約書を送る前に上長の承認が必要な企業は多いですが、メールやチャットでの確認だと抜け漏れが起きがちです。システム内で申請・承認・差し戻しまで完結するワークフロー機能があれば、無断締結や承認漏れを防げます。FitGapでは、少人数の企業ほどこの機能の有無で運用の安定感が変わると感じています。
🗂️契約書の保管・検索・管理機能
電子帳簿保存法への対応も兼ねて、締結済みの契約書をクラウド上で保管し、取引先名や契約日で素早く検索できることは実務上とても重要です。紙の契約書もスキャンして一元管理できる製品もあり、過去の書面契約が多い企業にはこの対応範囲が選定の分かれ目になります。
🤝取引先の操作負担の少なさ
電子契約は相手方の同意と協力が不可欠です。相手にアカウント登録を求めないシステムや、メールのリンクを開くだけで署名が完了するシステムであれば、取引先の心理的ハードルを大幅に下げられます。FitGapでは、自社よりもむしろ取引先の使いやすさを優先して選ぶくらいがちょうど良いと考えています。
🆓無料プラン・トライアルの有無
初めて電子契約を導入する中小企業にとって、実際に触って確認できるかどうかは非常に大きなポイントです。無料プランで月数件の送信ができる製品や、30日間のトライアルで全機能を試せる製品があります。FitGapとしては、必ず2〜3製品を実際に操作してみてから最終決定することを強くおすすめします。

一部の企業で必須

🔌外部サービスとのAPI連携
会計ソフトやCRM・SFAなど既存の業務システムと電子契約を連携させたい場合、API連携の対応範囲が重要になります。たとえばfreee会計やマネーフォワードとの連携がある製品なら、契約締結と経理業務をシームレスにつなげられます。ただし、まだ他のシステムを使っていない企業には優先度が下がる要件です。
🌐多言語・海外取引への対応
海外企業との取引がある場合、英語をはじめとした多言語インターフェースや、海外の電子署名規格への対応が必要です。DocuSignやAcrobat Signのようなグローバル製品は44言語以上に対応しているものもあります。国内取引のみの企業には不要ですが、今後海外展開を見据えている場合は考慮しておくと良いでしょう。
🔏当事者型の電子証明書発行
高額取引や法的紛争リスクの高い契約では、第三者認証局が発行する電子証明書を使った当事者型署名が求められる場合があります。不動産業・金融業・建設業などで重要度が高い要件ですが、一般的な業務委託契約やNDAが中心の企業にはオーバースペックになることが多いです。
👥複数者間契約(三者以上)
元請・下請・孫請のように三者以上が関わる契約が発生する業種では、リレー方式で順番に署名を回せる複数者間契約機能が欠かせません。建設業や不動産仲介などで特にニーズが高い要件です。二者間の契約しか発生しない企業は、この機能にこだわる必要はありません。
🛡️IPアドレス制限・SSO(シングルサインオン)
セキュリティポリシーが厳格な企業や、取引先から高いセキュリティ水準を求められる企業では、IPアドレス制限やSSOによるアクセス管理が必要になります。社内の情報セキュリティ規程と照らし合わせて、必要かどうかを判断してください。

ほぼ全製品が対応

⏱️電子署名・タイムスタンプの付与
電子契約の法的有効性を担保するための根幹機能です。電子署名法に準拠した電子署名と、契約締結日時を証明するタイムスタンプの付与は、現在販売されているほぼすべての電子契約システムで標準搭載されています。この機能自体で製品を絞り込む必要はありません。
📚電子帳簿保存法への準拠
2024年1月から電子取引データの電子保存が完全義務化されたことを受け、電子帳簿保存法に準拠した検索・保存機能はほぼ全製品が対応済みです。法令対応は前提条件として確認するだけで十分でしょう。
📧メール認証による本人確認
契約相手にメールでリンクを送り、メールアドレスによる本人確認を行う仕組みは、立会人型の標準的な認証方法としてほぼ全製品に備わっています。特別な差別化ポイントにはなりにくい機能です。
☁️締結済み契約書のクラウド保管
締結が完了した契約書を自動でクラウド上に保管する機能は、電子契約システムの基本機能として標準的に提供されています。保管容量や検索性の細かな差異はありますが、機能の有無自体は選定基準になりにくいです。

優先度が低い

🤖AI契約書レビュー・リスクチェック
AIが契約書の条文リスクを自動チェックする機能は先進的ですが、法務部門がない中小企業ではそもそも活用しきれないケースが多いです。FitGapとしては、まずは契約業務の電子化を優先し、AI機能は必要になってから検討しても遅くないと考えています。
📠紙の契約書のスキャン代行サービス
過去の紙の契約書を業者に送ってスキャン・データ化してもらえるサービスです。大量の紙契約書を抱える企業には便利ですが、中小企業では自社でスキャンして取り込める量であることが多く、追加費用をかけてまで利用する優先度は低めです。

中小企業の電子契約システムの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

中小企業向け電子契約システムは、それ以外の電子契約システムと何が違いますか?
ポイントとしては、大企業向けの電子契約システムは、複数の部署や拠点にまたがる承認フローの設定や、数千件を超える契約書の管理機能が充実しています。取引先との契約形態も多岐にわたるため、高度なカスタマイズ機能や外部システムとの連携機能を備えています。導入費用や月額費用は高額になりますが、大規模な契約業務を一元管理できる体制を構築できます。中堅企業向けの電子契約システムは、部門ごとの権限設定や複数の承認ルートを管理できる機能を持ちます。

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