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マイナンバー管理システムの比較表を作成!おすすめや選び方も解説
マイナンバー管理システムおすすめ6選|タイプ別の選び方ガイド
更新:2026/4/17
マイナンバー管理システムとは、従業員や扶養家族のマイナンバーを安全に収集・保管・利用・廃棄するための専用ツールです。近年はスマートフォンからの番号提出や本人確認書類の撮影提出が当たり前になり、従業員セルフサービス型の収集が主流になっています。さらに保管期限を過ぎた番号の自動廃棄や、給与・年末調整システムとのAPI連携など、法令遵守と業務効率化を両立する機能が標準装備される時代に入っています。 しかし製品ごとに「自社の担当者がすべて運用する前提のもの」と「BPO事業者に実務を委託する前提のもの」に大きく分かれており、自社に合わないタイプを選ぶと運用が破綻しかねません。 この違いを生む最大の軸は「マイナンバーの実務を社内で完結させるか、外部に委託するか」という運用方針です。本ガイドではこの軸で製品をタイプ分けし、要件の整理から選定手順までを順を追って解説します。
レビュー担当
松浦 大輔
人事統括として新卒・中途採用から育成・離職抑制・制度改定まで一貫して担当。約20件の人事・給与・勤怠システム導入プロジェクトに携わり、制度と運用の両面を踏まえた要件整理を強みとしている。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は
「FitGapの評価メソッド」
、シェアデータの算出根拠は
「シェアスコアの算出方法」
をご覧ください。
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COMPANY マイナンバー管理
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STAFFBRAIN マイナンバー管理
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1,600,000円
300名
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Generalist/MN
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SuperStream-NX 人事給与
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ヤマトシステム開発 マイナンバー収集代行サービス
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セコムあんしんマイナンバー収集サービス
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12,000円
月
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スマカン
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スマート大臣 マイナンバー
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¥990
年額/1人
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SmartHR 労務管理
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0円~
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オフィスステーション マイナンバー
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¥3,300
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