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合同会社の会計ソフトおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/5/29
会計ソフトと一口に言っても、合同会社が実際に検討する製品は幅広く、AIが仕訳を自動提案してくれるクラウド型から、顧問税理士との共同作業を前提に設計された製品、さらにはERP(統合業務システム)の会計モジュールまで多岐にわたります。合同会社は株式会社と決算書の書式が異なるうえ、設立初期は1人で経理をこなし、成長とともに税理士連携や内部統制が必要になるなど、フェーズごとに求められる機能が変わる点が選定を難しくしています。本ガイドでは「経理体制の規模」と「外部専門家との連携度合い」を軸に3タイプに整理し、要件定義から製品選定までを順を追って解説します。
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レビュー担当 松浦 大輔
FP技能士2級(AFP)・日商簿記2級を保有し、財務・会計の実務知識を裏付けている。freee等の会計・経費精算システムの業務利用経験を持ち、バックオフィス業務設計の視点から製品を評価している。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
経理の手間を最小化したい小規模法人向けタイプ 🚀
freee会計(法人)
/ マネーフォワード クラウド会計
/ 弥生会計
顧問税理士との連携や帳簿精度を重視するタイプ 📋
勘定奉行クラウド
/ PCAクラウド会計
/ FX4クラウド
グループ管理や内部統制が必要な成長フェーズ向けタイプ 🏢
奉行V ERPクラウド
/ 勘定奉行
/ SuperStream-NX 会計
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
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おすすめ製品の早見表

タイプ別おすすめ製品 9

合同会社向けの会計ソフトのおすすめ製品を製品ごとにタイプ、料金、企業規模、評価ポイントで比較する表
製品名タイプ料金企業規模評価ポイント
freee会計(法人)
経理の手間を最小化したい小規模法人向けタイプ 🚀
2,980円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

簿記未経験でも使いやすく導入しやすい。中小企業でのシェアもトップ。

マネーフォワード クラウド会計
経理の手間を最小化したい小規模法人向けタイプ 🚀
¥3,980
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

会計から請求・経費・給与まで段階拡張できる。低コストで始めやすい。

弥生会計
経理の手間を最小化したい小規模法人向けタイプ 🚀
50,000円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

中小企業シェアがトップ。電話相談もしやすく、初めての会計ソフトに向く。

勘定奉行クラウド
顧問税理士との連携や帳簿精度を重視するタイプ 📋
7,750円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

税理士と同じ会計データを共有できる。奉行シリーズの導入実績も豊富。

PCAクラウド会計
顧問税理士との連携や帳簿精度を重視するタイプ 📋
13,860円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

堅牢なクラウドで販売・給与とも連携可能。中堅企業の本格会計に向く。

FX4クラウド
顧問税理士との連携や帳簿精度を重視するタイプ 📋
要問合せ
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

税理士の月次監査で帳簿を正確に固められる。資金調達時の信用にもつながる。

奉行V ERPクラウド
グループ管理や内部統制が必要な成長フェーズ向けタイプ 🏢
要問合せ
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

会計・販売・人事労務を同じ基盤で管理可能。内部統制まで広く対応。

勘定奉行
グループ管理や内部統制が必要な成長フェーズ向けタイプ 🏢
7,750円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

会計基盤から給与・販売管理へ広げやすい。中堅企業でのシェアもトップ。

SuperStream-NX 会計
グループ管理や内部統制が必要な成長フェーズ向けタイプ 🏢
¥90,000年額
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

IFRS・多通貨・複数法人に対応する本格会計。大企業での実績も豊富。

タイプ別おすすめ製品

経理の手間を最小化したい小規模法人向けタイプ 🚀

このタイプが合う企業:

経理専任者がいない・少人数で運営している合同会社で、日々の記帳や経費処理をできるだけ自動化したい方

どんなタイプか:

銀行・カード明細の自動取込とAI仕訳を中心に、記帳、経費精算、請求書発行をまとめて処理するクラウド会計タイプです。簿記前提の入力より自動化と周辺業務の一体化に比重があります。

このタイプで重視すべき機能:

🤖明細の自動取込・AI仕訳提案
銀行・カード明細を自動取得し、AI提案で手入力や勘定科目選択の負担を減らせます。
🧾経費精算・請求書の一体管理
経費精算と請求書発行のデータを会計へつなぎ、転記や二重入力を減らせます。

おすすめ製品3選

freee会計(法人)
おすすめの理由

経理担当を置かずに月次処理を回したい小規模な合同会社におすすめ

freee会計(法人)は、借方・貸方を意識する従来型よりも「取引」登録から自動仕訳へつなげる設計が強いクラウド会計ソフトです。銀行明細取込、OCR仕訳、請求書発行、固定資産管理まで一つの流れで扱えるため、経理担当を置かない合同会社が代表者や事務兼任者だけで月次処理を回したい場合に向きます。 FitGapでは操作性・導入しやすさがカテゴリ内1位、中小企業シェアも同タイプ内で1位タイで、会計に不慣れな小規模法人でも始めやすい製品です。 一方、電話で細かく伴走してもらう運用や、簿記経験者が特殊な仕訳を作り込みたい場合は相性を確認したいところです。経費精算や仕訳承認、上位プランの連携範囲、IFRS・連結管理の不足も、成長後の要件として比較が必要です。
価格
2,980円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
マネーフォワード クラウド会計
おすすめの理由

会計と周辺業務を段階的に揃えたいひとり合同会社におすすめ

マネーフォワード クラウド会計は、会計だけでなく請求書、経費精算、給与などを必要に応じて組み合わせるモジュール型のクラウド会計ソフトです。銀行・クレジットカードなど多数の明細を取り込み、AI仕訳やOCR仕訳、固定資産管理、予算管理、家事按分まで扱えるため、ひとり合同会社や副業から法人成りした会社が、会計と周辺業務を段階的に整えたい場合に向きます。 FitGapでは操作性がこのページ内で高く、導入しやすさと料金評価も上位で、初期負担を抑えて始めやすい点が強みです。 一方、自動仕訳はルールの見直しが必要で、仕訳承認ワークフローや監査・証憑ワークフローは追加オプションです。多通貨処理や為替レート自動取込は非対応のため、海外取引や内部統制を重視する合同会社は他製品も比較してください。
価格
¥3,980
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由

電話サポートを頼りに自力で経理したい小規模法人の定番候補

弥生会計は、長年使われている定番の会計ソフトとして、画面ガイドと人的サポートを頼りに帳簿作成から決算・申告まで進めやすい製品です。銀行明細やクレジットカード明細の取込、自動仕訳、確定申告書作成、消費税申告に対応しており、個人事業から法人成りした1人合同会社や、電話で相談しながら自力で経理を済ませたい小規模法人に向きます。 FitGapでは中小企業シェアがカテゴリ内1位、サポート評価もこのタイプ内で高く、初めての会計ソフトとして選びやすい位置づけです。 一方、標準版はWindows前提でスマホやMac利用には向かず、複数人の同時入力には上位版やネットワーク版が必要です。予算管理、為替レート自動取込、マルチテナント管理は非対応のため、拠点展開や海外取引、グループ管理を見据える会社はクラウド型も比較してください。
価格
50,000円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

顧問税理士との連携や帳簿精度を重視するタイプ 📋

このタイプが合う企業:

顧問税理士に記帳チェックや決算を依頼しており、会計データの正確性・柔軟な仕訳設定を重視する合同会社

どんなタイプか:

顧問税理士とのデータ共有と精度の高い仕訳管理を軸に、複式簿記、部門別損益、消費税設定を細かく扱うタイプです。自動化より帳簿修正の自由度と確認しやすさを重視します。

このタイプで重視すべき機能:

🤝税理士・会計事務所とのデータ共有
税理士と同じ会計データを共有し、確認、修正、決算前のやり取りを進めやすくします。
📊部門別損益・消費税の詳細管理
部門別の収支と消費税区分を細かく管理し、課税判断やインボイス対応を確認できます。

おすすめ製品3選

勘定奉行クラウド
おすすめの理由

顧問税理士と同じデータで帳簿を固めたい合同会社におすすめ

勘定奉行クラウドは、奉行シリーズの会計基盤をクラウド化し、顧問税理士と同じデータを見ながら仕訳・証憑確認を進めやすい製品です。専門家ライセンスが標準付属し、仕訳承認ワークフローと監査・証憑ワークフローにも対応するため、合同会社でも月次の確認履歴を残しながら帳簿を固めたい場合に向きます。 FitGapでは全体シェアが同ページ内1位タイで、製造・建設、不動産・卸売、小売でも上位のため、複数業種を扱う税理士との共通基盤にしやすい点も強みです。 一方、顧問先ダッシュボードやマルチテナント管理、工事原価管理、多通貨処理は追加対応です。標準機能で統制や建設原価まで深く固めたい企業は、FX4クラウドも比較してください。
価格
7,750円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
PCAクラウド会計
おすすめの理由

家事按分対応で役員経費を切り分けたい法人成り合同会社向け

PCAクラウド会計は、PCAシリーズの堅牢なクラウド環境で、経営者自身の入力と顧問税理士の確認を両立しやすい本格派の会計ソフトです。このタイプでは家事按分に対応している点が特徴で、個人事業から法人成りした合同会社が、役員個人の支払いと法人経費を切り分けながら帳簿精度を高めたい場合に向きます仕訳承認ワークフロー、予算管理・連携、e-Tax連携も備え、FitGapでは中堅企業シェアが同ページ内4位、連携評価も上位です。 一方、プランが細かく、料金評価や導入しやすさは強みになりにくいため、必要機能を絞って選ぶ必要があります。税理士の巡回監査や内部統制レポートまで標準運用したい企業は、FX4クラウドと比較してください。
価格
13,860円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
FX4クラウド
おすすめの理由

税理士の月次監査前提だが帳簿の厳格運用に強いクラウド会計

FX4クラウドは、TKC会員の税理士による月次巡回監査を前提に、帳簿を毎月確定していく厳格運用型のクラウド会計です。仕訳承認ワークフロー、監査・証憑ワークフロー、内部統制レポートに対応し、この3製品では内部統制まで標準的に組みやすいのが特徴です。 監査後のデータロックで過去仕訳の改ざんや安易な修正を防げるため、資金調達を意識して正確な月次帳簿を残したい合同会社に向きます。FitGapでは医療・福祉、農林漁業でのシェアが同ページ内1位で、該当業種を扱う税理士との運用にも合います。 一方、TKC税理士経由の導入が前提で、料金評価と導入しやすさは上位ではありません。自社だけで手軽に始めたい小規模会社や、月次確定後も柔軟に修正したい企業は、勘定奉行クラウドやPCAクラウド会計を先に比べるべきです。
価格
要問合せ
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

グループ管理や内部統制が必要な成長フェーズ向けタイプ 🏢

このタイプが合う企業:

従業員数が増加し、仕訳承認や権限設定などの内部統制、または関連法人との連結管理が必要になってきた合同会社

どんなタイプか:

ERPや本格会計基盤として、仕訳承認、権限管理、他業務連携、連結管理まで扱うタイプです。会計単体より内部統制とグループ管理の一貫性を重視します。

このタイプで重視すべき機能:

🔐仕訳承認ワークフロー・権限管理
仕訳の入力者と承認者を分け、ユーザーごとの閲覧範囲や操作権限を管理できます。
🔗他業務モジュールとの統合連携
販売、購買、人事給与のデータを会計へ連携し、二重入力と部門間の確認作業を減らせます。

おすすめ製品3選

奉行V ERPクラウド
おすすめの理由

内部統制をまとめて整えたい成長期の合同会社向け基幹システム

奉行V ERPクラウドは、会計だけでなく販売管理・人事労務まで同じ基盤に集約し、合同会社が拡大する段階で内部統制をまとめて整えやすいSaaS型ERPです。FitGapでは機能性・サポート・セキュリティ統制の評価が同タイプ内で最上位で、仕訳承認、監査証憑ワークフロー、内部統制レポート、連結自動消去、マルチテナント管理まで対応しています。 部門やグループ会社が増え、会計単体では管理が追いつかない企業に向きます。 一方、導入プロジェクトや費用は重くなりやすく、銀行API取込やOCR仕訳は追加オプションです。まず低コストで日常仕訳を自動化したい小規模な合同会社は、より軽量な会計ソフトも比較すべきです。
価格
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シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由

まず会計基盤から段階的に広げたい中堅の合同会社におすすめ

勘定奉行は、会計業務を軸に部門別管理や周辺業務連携へ広げやすい、実績重視の会計ソフトです。ERP全体を一気に入れるより、まず会計基盤を整え、必要に応じて給与・販売管理や承認機能を足したい合同会社に合います。 FitGapでは中堅企業シェアがカテゴリ内1位で、サポート評価も上位に入り、専門担当者や支援を受けながら運用したい企業で候補にしやすい製品です。 一方、仕訳承認ワークフロー、監査証憑ワークフロー、マルチテナント管理は追加オプションで、連結自動消去は非対応です。IFRS連結も追加対応のため、上場準備や複数法人の連結統制を標準機能で深く固めたい場合は、奉行V ERPクラウドや他の本格ERPと比較してください。
価格
7,750円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
SuperStream-NX 会計
おすすめの理由

グループ経営や上場準備の会計管理を作り込みたい合同会社向け

SuperStream-NX 会計は、財務会計と管理会計を統合し、複数法人・多通貨・IFRSまで視野に入れた本格会計システムです。販売や人事まで含めたERP統合より、グループ経営の会計管理を深く作り込みたい合同会社に向きます。 FitGapでは大企業シェアと金融・保険業界シェアが同タイプ内で1位で、IFRS連結、GST/VATレポート、内部統制レポート、マルチテナント管理にも対応しています。海外取引、金融系の管理、将来的な上場準備を見据える企業では有力です。 一方、仕訳承認、監査証憑ワークフロー、連結自動消去、銀行API取込は追加オプションで、OCR仕訳は非対応です。小規模な合同会社が低コストで日常処理を楽にしたい段階では過剰になりやすいです。
価格
¥90,000
年額
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

比較すべき機能の優先度マップ

どこから比較すべきか

製品には数多くの機能がありますが、選定の決め手になるのは一部の機能だけです。そこで各機能を「多くの企業で必要か」と「製品ごとに対応が分かれるか」の2つの軸で4つに分け、比較する順番が分かるように並べました。下の表では、このページに登場した製品が各機能にどう対応しているかを、上から順に確認できます。
標準対応
オプション/条件付き
非対応

選定の決め手

合同会社が日々の記帳から法人決算までを自社でどこまで回せるかは差が出やすいため、自動化と申告周辺の対応状況を中心に確認してください。
freee会計(法人)
マネーフォワード クラウド会計
弥生会計
勘定奉行クラウド
PCAクラウド会計
FX4クラウド
奉行V ERPクラウド
勘定奉行
SuperStream-NX 会計
請求書発行
請求書発行機能を有し、売上仕訳をリアルタイム連携できるか
OCR仕訳
領収書やスマホ撮影画像からOCRで読み取り仕訳できるか
税務申告(法人税)
法人税申告書を作成・申告連携できるか
税務申告(内訳書・概況書)
内訳書・概況書を作成し申告へ連携できるか
固定資産管理
固定資産台帳を管理し償却を自動計算できるか
自動仕訳精算・消込
売掛金・買掛金の入金・支払を自動突合し消込できるか

一部の企業で必須

海外取引、課税事業者としての消費税申告、複数法人管理、監査対応がある合同会社では、通常機能より先に該当可否を確認すると選定ミスを避けやすくなります。
freee会計(法人)
マネーフォワード クラウド会計
弥生会計
勘定奉行クラウド
PCAクラウド会計
FX4クラウド
奉行V ERPクラウド
勘定奉行
SuperStream-NX 会計
多通貨処理
外貨での起票や期末換算差の自動仕訳に対応できるか
税務申告(消費税)
消費税申告書を作成できるか
e-Tax連携
e-Taxと連携し電子申告送信まで行えるか
内部統制レポート
SOX法など内部統制対応の監査レポートを出力できるか
マルチテナント管理
複数法人・グループ会社をテナント分離して一元管理できるか

ほぼ全製品が対応

銀行明細の取込や基本帳簿、月次・年次決算を早める機能は多くの製品で備わるため、合同会社では操作性や料金差を比べる前提機能として見てください。
freee会計(法人)
マネーフォワード クラウド会計
弥生会計
勘定奉行クラウド
PCAクラウド会計
FX4クラウド
奉行V ERPクラウド
勘定奉行
SuperStream-NX 会計
販売管理連携
受注・売上・請求から仕訳を自動連携できるか
銀行API取込
銀行やカード明細を取得し自動仕訳できるか
現金出納帳
現金の入出金を台帳管理できるか
決算早期化
月次・四半期・年次決算を自動化し決算期間を短縮できるか

優先度が低い

IFRS連結や個人向け申告などは、一般的な合同会社の会計運用では使う場面が限られるため、該当しない場合は比較から外して問題ありません。
freee会計(法人)
マネーフォワード クラウド会計
弥生会計
勘定奉行クラウド
PCAクラウド会計
FX4クラウド
奉行V ERPクラウド
勘定奉行
SuperStream-NX 会計
確定申告書作成
青色/白色の確定申告書を自動作成できるか
IFRS連結
IFRS基準で連結決算を作成できるか
連結自動消去
複数会社データを取り込み内部取引や持分を自動消去できるか

合同会社の会計ソフトの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

合同会社向けの会計ソフトでは何ができますか?

日々の記帳から決算、法人税の申告に使うデータ作成までを行い、合同会社の決算書の書式にも対応できます。銀行連携やAI仕訳で、経理の専任者がいなくても記帳を進められます。小規模法人向け・税理士連携重視型・成長フェーズ向けのERP基盤型の3タイプがあります。

経理に詳しくなくても合同会社の決算まで進められますか?

進められます。銀行やカードの明細を自動で取り込み、AIが仕訳を提案するため、簿記に不慣れでも記帳から決算書の作成まで進められます。freee会計やマネーフォワード クラウド会計は法人決算に対応し、合同会社の書式に沿った決算書を作れます。決算と申告までつながるかが要点です。

顧問税理士との連携や成長後の拡張にも対応できますか?

できます。会計データをクラウドで税理士と共有して決算や申告を分担でき、事業の拡大に合わせて上位プランやERPへ広げられます。勘定奉行クラウドやPCAクラウド会計は中堅規模の経理に対応し、奉行V ERPクラウドはグループ管理や内部統制まで広げられます。将来の規模を見込んで選ぶと乗り換えを抑えられます。

合同会社向けの会計ソフトの料金はどのくらいですか?

小規模法人向けのクラウド型は月数千円からで、freee会計は法人が月2,980円、マネーフォワード クラウド会計は月3,980円が目安です。中堅向けの勘定奉行クラウドは月7,750円、PCAクラウド会計は月13,860円、インストール型の弥生会計は5万円前後で、ERP基盤型は要問い合わせです。事業の規模と経理体制で総額が変わります。

個人の確定申告ソフトのまま合同会社を運営すると何に困りますか?

個人向けのソフトは法人の決算や法人税申告、合同会社の決算書の書式に対応しておらず、法人化したあとは記帳や決算で行き詰まります。法人向けの会計ソフトなら、合同会社の書式に沿った決算から申告データの作成までを進められます。まず法人決算と申告に対応する製品かを確かめてから選ぶと安心です。

※掲載している機能・対応範囲・料金は一般的な目安です。製品・プラン・契約条件により異なる場合があるため、導入前に各製品の最新の公式情報や比較表でご確認ください。

サービスカテゴリ

AI・エージェント

汎用生成AI・エージェント
LLM・大規模言語モデル
エージェントフレームワーク
エージェントオートメーション基盤

ソフトウェア(Saas)

オフィス環境・総務・施設管理
開発・ITインフラ・セキュリティ
データ分析・連携