あなたにぴったりの
農業、林業、漁業向けの会計ソフト
を無料で選定
Q. どちらに当てはまりますか?
農業、林業、漁業向けの会計ソフトを知りたい
あなたにおすすめ
条件に合う会計ソフトを知りたい
経理業務を効率化したい
今の会計ソフトから乗り換えたい

農業・林業・漁業向け会計ソフトおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/5/29
会計ソフトと一口に言っても、農業・林業・漁業の現場で本当に使える製品は限られています。種苗費や素畜費といった一次産業特有の勘定科目への対応、農業所得用の青色申告決算書の自動作成、JA取引データの取り込みなど、汎用ソフトではカバーしきれない要件が数多く存在するからです。さらに近年はAI仕訳やクラウド連携の進化により、現場作業の合間にスマホで経理を済ませるスタイルも広がっています。FitGapでは、こうした製品の多様性を「業種特化」「クラウド自動化」「税理士連携」という3つのタイプに整理し、要件定義から最終選定までを順を追ってガイドします。
続きを読む
レビュー担当 松浦 大輔
FP技能士2級(AFP)・日商簿記2級を保有し、財務・会計の実務知識を裏付けている。freee等の会計・経費精算システムの業務利用経験を持ち、バックオフィス業務設計の視点から製品を評価している。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
一次産業の勘定科目・申告書にそのまま対応できる専用ソフトタイプ 🌾
農業簿記
/ 弥生会計
/ 大蔵大臣NX
銀行連携・AI仕訳で日々の経理を自動化するクラウド会計タイプ ☁️
freee会計(法人)
/ マネーフォワード クラウド会計
/ ALL-IN
税理士・会計事務所とリアルタイム連携して法人経理を行うタイプ 🤝
FX4クラウド
/ JDL IBEX会計net
/ 勘定奉行クラウド
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
すべて表示

おすすめ製品の早見表

タイプ別おすすめ製品 9

農業、林業、漁業向けの会計ソフトのおすすめ製品を製品ごとにタイプ、料金、企業規模、評価ポイントで比較する表
製品名タイプ料金企業規模評価ポイント
農業簿記
一次産業の勘定科目・申告書にそのまま対応できる専用ソフトタイプ 🌾
66000買い切り
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

農業の勘定科目・申告様式に標準対応。JA全中推奨で農林漁業シェアもトップ。

弥生会計
一次産業の勘定科目・申告書にそのまま対応できる専用ソフトタイプ 🌾
50,000円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

農業・不動産・副業収入を一つの帳簿で整理。手厚いサポートも強み。

大蔵大臣NX
一次産業の勘定科目・申告書にそのまま対応できる専用ソフトタイプ 🌾
264,000円買い切り
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

部門別損益や共通費配賦まで管理できる。複数部門の法人会計に強い。

freee会計(法人)
銀行連携・AI仕訳で日々の経理を自動化するクラウド会計タイプ ☁️
2,980円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

簿記知識が不要な取引入力設計。使いやすく導入が容易で中小企業にも強い。

マネーフォワード クラウド会計
銀行連携・AI仕訳で日々の経理を自動化するクラウド会計タイプ ☁️
¥3,980
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

銀行・カード・領収書データを幅広く取り込める。低コストで段階導入しやすい。

ALL-IN
銀行連携・AI仕訳で日々の経理を自動化するクラウド会計タイプ ☁️
3,900円月/ユーザー
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

販売・在庫・顧客管理まで会計と統合可能。直売やECの売上管理まで扱える。

FX4クラウド
税理士・会計事務所とリアルタイム連携して法人経理を行うタイプ 🤝
要問合せ
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

税理士と毎月帳簿を確認し、部門別収支や補助金管理まで進められる。

JDL IBEX会計net
税理士・会計事務所とリアルタイム連携して法人経理を行うタイプ 🤝
3,610円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

JDL利用の会計事務所と仕訳・帳簿を共有。月次確認のやり取りを減らせる。

勘定奉行クラウド
税理士・会計事務所とリアルタイム連携して法人経理を行うタイプ 🤝
7,750円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

専門家ライセンスで税理士と共有。奉行シリーズ連携で給与・販売まで広げられる。

タイプ別おすすめ製品

一次産業の勘定科目・申告書にそのまま対応できる専用ソフトタイプ 🌾

このタイプが合う企業:

個人農家・新規就農者・小規模な農林漁業の個人事業主で、簿記知識が少なくても手軽に記帳から確定申告まで完結させたい方

どんなタイプか:

一次産業特有の勘定科目や農業所得用の申告書式を標準搭載した会計ソフトです。育成資産の減価償却やJA取引の取り込みまで専用機能で扱える点が特徴です。

このタイプで重視すべき機能:

📋農業・林業・漁業専用の勘定科目プリセット
種苗費・肥料費・素畜費・漁具費などの科目を選び、一次産業の取引を仕訳できます。
📝農業所得用の青色申告決算書・収支内訳書の自動作成
記帳データから農業所得用の申告書類を作成し、育成資産の償却計算も反映できます。

おすすめ製品3選

農業簿記
おすすめの理由
農業簿記は、農業所得の記帳から青色申告までを、農業特有の勘定科目やJA取引に寄せて扱える専用ソフトです。JAバンクCSV取込と共済契約連携を標準で使えるため、JAとの入出金や共済契約が日常的に発生する個人農家、新規就農者、兼業農家に向きます。39年のロングセラーでJA全中推奨という安心感もあり、FitGapでは農業・林業・漁業シェアがページ内1位です。一方、税込66,000円の初期費用とWindows前提の環境は確認が必要です。汎用法人向けや法人税申告には向かないため、法人化後の税務まで一体管理したい農業法人は、法人会計に強い製品と比較してください。
価格
66000
買い切り
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
弥生会計は、農業専用に作り込むより、農業所得を含む個人事業の申告と日々の経理をまとめて扱いやすい定番会計ソフトです。確定申告書作成、個人消費税申告、e-Tax連携、家事按分を標準で使えるため、農業に加えて不動産所得や副業収入も一つの帳簿で整理したい個人事業主に向きます。FitGapではサポート評価がページ内1位タイ、操作性も上位で、申告期に相談しながら進めたい初心者にも選びやすい製品です。一方、JAバンクCSV取込は追加オプションで、農業特有の取引を無加工で取り込みたい専業農家には農業簿記の方が合いやすい場面があります。Windows前提や複数人同時入力の上位版対応も確認してください。
価格
50,000円
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
大蔵大臣NX
おすすめの理由
大蔵大臣NXは、個人の青色申告よりも、法人化した一次産業事業者の本体会計と部門別管理に寄せて選ぶ財務会計システムです。振替伝票に近い入力画面で仕訳から試算表・決算書まで作成でき、共通費配賦や部門別損益、売掛・買掛、固定資産まで扱えます。FitGapでは汎用法人向け・協同組合向けに向く製品として整理され、販売管理連携、全銀データ出力、複合配賦・活動区分配賦を標準で確認できます。複数拠点や部門を持つ農業法人・漁業法人には、農業簿記や弥生会計より管理会計寄りの候補です。一方、e-Tax連携、確定申告書作成、JAバンクCSV取込は非対応です。個人農家の申告やJA明細取込を軽く済ませたい場合は別製品を比較し、導入前は操作性とサポート範囲もデモで確認してください。
価格
264,000円
買い切り
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

銀行連携・AI仕訳で日々の経理を自動化するクラウド会計タイプ ☁️

このタイプが合う企業:

日常の記帳作業を極力自動化したい方、スマホで経理を済ませたい若手農林漁業者、兼業で複数の所得を一元管理したい方

どんなタイプか:

銀行口座やカード明細を自動取得し、AI仕訳で日々の記帳を省力化するクラウド会計です。スマホでの確認や承認まで進めやすく、経理作業を場所に縛られず処理できます。

このタイプで重視すべき機能:

🔗銀行口座・クレジットカードとの自動データ連携
銀行・カード・電子マネー明細を取り込み、手入力なしで記帳候補を確認できます。
🤖AIによる自動仕訳提案
取引内容から勘定科目を提案し、仕訳ミスの確認と記帳時間の短縮に役立ちます。

おすすめ製品3選

freee会計(法人)
おすすめの理由
freee会計(法人)は、簿記の借方・貸方よりも「取引」入力を軸に、銀行明細とAI仕訳で法人経理を軽くするクラウド会計です。スマホから明細確認や仕訳承認を進めやすく、FitGapでは操作性、導入しやすさ、料金の評価がこのページ内で上位のため、圃場・漁場に出る時間が長く、代表者や少人数で記帳する農林漁業法人に向きます。JAバンクCSV取込と固定資産管理に対応し、育成資産の減価償却も口座入出金と合わせて整理しやすい点が強みです。多通貨処理やマルチテナント管理も使えるため、輸出や複数法人管理を見据える場合はマネーフォワードより候補にしやすい一方、確定申告書作成や家事按分、個人消費税申告まで一体で行いたい個人事業者は別製品と比べる必要があります。
価格
2,980円
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
マネーフォワード クラウド会計
おすすめの理由
マネーフォワード クラウド会計は、銀行・カード・電子マネーなどの明細を幅広く取り込み、日々の取引から申告準備までつなげやすいクラウド会計です。JAバンクCSV取込に加えて銀行API取込やOCR仕訳に対応するため、JA以外の口座、紙の領収書、直売や副業収入が混在する農林漁業者でも入力を集約しやすいです。FitGapでは導入しやすさと料金の評価がこのタイプ内で高く、確定申告書作成、個人消費税申告、家事按分にも対応するため、兼業農家や個人事業寄りの運用ではfreeeより候補にしやすい製品です。一方、多通貨処理や為替レート自動取込はできないため、輸出取引が多い法人は注意が必要です。電話・訪問支援を重視する場合や、大規模で複雑な会計処理を行う場合も、上位版や他製品を比較した方が安心です。
価格
¥3,980
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
ALL-INは、会計ソフト単体というより、販売・在庫・顧客管理まで同じ基盤で扱う中小企業向け統合業務システムです。直売所、EC、会員制の産直など販売チャネルが複数ある農林漁業者では、売上・入金・在庫を会計と分けずに管理できる点がfreeeやマネーフォワードとの違いです。FitGapでは、在庫リアル連携、販売管理連携、請求書発行、会員管理をこのタイプ内でまとめて使える候補として目立ち、JAバンクCSV取込、銀行API取込、自動仕訳精算・消込にも対応しています。一方、確定申告書作成、e-Tax連携、個人消費税申告、固定資産管理には対応していません。青色申告や育成資産の減価償却を重視する個人事業者、会計だけを軽く始めたい企業、既存システムと標準連携したい企業は過剰または追加開発が負担になりやすいです。
価格
3,900円
月/ユーザー
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

税理士・会計事務所とリアルタイム連携して法人経理を行うタイプ 🤝

このタイプが合う企業:

税理士・会計事務所と緊密に連携したい農業法人・林業法人・漁業法人、経営規模の拡大に伴い管理会計の強化が必要な中堅以上の一次産業事業者

どんなタイプか:

農業法人や組合の会計データを税理士・会計事務所と共有し、月次監査から決算まで連携して進めるタイプです。部門別収支や補助金管理など、管理会計まで扱える点が特徴です。

このタイプで重視すべき機能:

📡税理士・会計事務所とのリアルタイムデータ共有
同じ会計データを税理士と共有し、仕訳確認や修正指示をオンラインで進められます。
📊部門別・作目別の管理会計
作目・部門・圃場別の収支を分けて把握し、利益構造や経営状況を確認できます。

おすすめ製品3選

FX4クラウド
おすすめの理由
FX4クラウドは、TKC会員の税理士による月次監査を前提に、法人経理を経営管理まで広げるハイエンド寄りのクラウド会計です。JAバンクCSV取込、組合員管理、複合配賦、予算管理、仕訳承認ワークフロー、内部統制レポートまで扱え、FitGapでも機能性・セキュリティ評価が同ページ上位で、農業、林業、漁業でのシェアも2位です。部門別収支や補助金管理を顧問税理士と毎月確認したい中堅の農業法人・漁業法人に向きます。一方、税理士支援前提で単独利用は重く、操作性・導入しやすさ・料金の評価は低めです。e-Tax連携や確定申告書作成まで自社完結したい小規模事業者は、より簡易な製品や申告側の併用を比較した方がよいです。
価格
要問合せ
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
JDL IBEX会計net
おすすめの理由
JDL IBEX会計netは、JDL製品を使う会計事務所とのデータ受け渡しを軸にした、専門家協業型の会計ソフトです。顧問税理士側の運用に合わせて仕訳や帳簿を共有しやすく、監査・証憑ワークフローにも対応するため、地場の会計事務所を窓口に月次確認を進めたい農業法人に向きます。FitGapでは農業、林業、漁業でのシェアが3位タイですが、銀行API取込は追加オプションで、OCR仕訳、JAバンクCSV取込、e-Tax連携、財務ダッシュボードには対応していません。日々の入力自動化やJA取引明細の内製化、社内での経営分析まで求める場合は、勘定奉行クラウドやFX4クラウドも見比べたいところです。Windows環境前提で、顧問先・事務所双方がJDL系でないと連携メリットも薄れます。
価格
3,610円
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
勘定奉行クラウド
おすすめの理由
勘定奉行クラウドは、奉行シリーズの会計基盤に専門家ライセンスやAI・OCR入力、銀行明細連携を組み合わせた、汎用性の高い法人向けクラウド会計です。JAバンクCSV取込、銀行API取込、e-Tax連携、仕訳承認ワークフロー、監査・証憑ワークフロー、財務ダッシュボードまで扱え、FitGapでも全体シェア、機能性、サポート、連携の評価が高く出ています。給与・販売・固定資産など奉行シリーズと合わせ、顧問税理士と同じ基盤で月次確認したい中堅の農業法人に向きます。一方、農業、林業、漁業でのシェアは同ページ内では上位ではなく、農業簿記特有の勘定科目や育成資産の仕訳は自社または税理士側で設計が必要です。経理1名の小規模法人や一次産業専用の標準設定を重視する企業は、専用ソフトやFX4クラウドも比較してください。
価格
7,750円
無料トライアルあり
農業・林業・漁業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

比較すべき機能の優先度マップ

どこから比較すべきか

製品には数多くの機能がありますが、選定の決め手になるのは一部の機能だけです。そこで各機能を「多くの企業で必要か」と「製品ごとに対応が分かれるか」の2つの軸で4つに分け、比較する順番が分かるように並べました。下の表では、このページに登場した製品が各機能にどう対応しているかを、上から順に確認できます。
標準対応
オプション/条件付き
非対応

選定の決め手

農業・林業・漁業の会計では、JA取引、証憑入力、消費税、売掛消込などで対応差が出ます。日々の記帳負荷と申告準備の手戻りを比較してください。
農業簿記
弥生会計
大蔵大臣NX
freee会計(法人)
マネーフォワード クラウド会計
ALL-IN
FX4クラウド
JDL IBEX会計net
勘定奉行クラウド
OCR仕訳
領収書やスマホ撮影画像からOCRで読み取り仕訳できるか
税務申告(消費税)
消費税申告書を作成できるか
JAバンクCSV取込
JAバンク・共済CSVを取込み仕訳化できるか
自動仕訳精算・消込
売掛金・買掛金の入金・支払を自動突合し消込できるか

一部の企業で必須

個人農家、農業法人、漁協・組合、在庫を持つ販売事業では必要機能が変わります。自社の申告形態や取引先、管理単位に合うものだけ確認しましょう。
農業簿記
弥生会計
大蔵大臣NX
freee会計(法人)
マネーフォワード クラウド会計
ALL-IN
FX4クラウド
JDL IBEX会計net
勘定奉行クラウド
在庫リアル連携
入出庫・棚卸評価を即時に会計へ反映できるか
共済契約連携
共済契約データから仕訳を生成できるか
家事按分
家事関連費を設定比率で自動按分仕訳できるか
確定申告書作成
青色/白色の確定申告書を自動作成できるか
組合員管理
出資金・利用高・配当・債権債務を管理できるか

ほぼ全製品が対応

農林漁業向けでも、現金管理や大量データ処理、決算短縮は多くの製品で備わる基本機能です。まずは搭載有無より操作性や処理速度を見てください。
農業簿記
弥生会計
大蔵大臣NX
freee会計(法人)
マネーフォワード クラウド会計
ALL-IN
FX4クラウド
JDL IBEX会計net
勘定奉行クラウド
現金出納帳
現金の入出金を台帳管理できるか
大量仕訳処理
数万件規模の仕訳データを一括で高速処理できるか
決算早期化
月次・四半期・年次決算を自動化し決算期間を短縮できるか

優先度が低い

海外取引や高度な統制レポートは、一般的な農業・林業・漁業の会計選定では優先度が下がります。該当する法人だけ追加で比較すれば十分です。
農業簿記
弥生会計
大蔵大臣NX
freee会計(法人)
マネーフォワード クラウド会計
ALL-IN
FX4クラウド
JDL IBEX会計net
勘定奉行クラウド
GST/VATレポート
VATやGSTの国別集計レポートを出力できるか
IFRS連結
IFRS基準で連結決算を作成できるか
内部統制レポート
SOX法など内部統制対応の監査レポートを出力できるか

農業、林業、漁業の会計ソフトの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

農業・林業・漁業向けの会計ソフトでは何ができますか?

種苗費や素畜費といった一次産業に特有の勘定科目で記帳し、農業所得用の青色申告決算書を作成できます。JAの取引データの取り込みや補助金の管理に対応する製品もあります。一次産業に専用対応した型・銀行連携で自動化するクラウド型・税理士と連携する型の3タイプがあります。

種苗費や素畜費など一次産業特有の科目に対応できますか?

対応できます。種苗費や素畜費、肥料費といった農業簿記に特有の勘定科目をあらかじめ備え、農業所得用の青色申告決算書まで作成できる製品があります。農業簿記や弥生会計は専用の科目に対応し、freee会計やマネーフォワード クラウド会計は銀行連携で記帳を自動化できます。自分の営みに合う科目で記帳できるかが要点です。

JAの取引データの取り込みや補助金の管理に対応できますか?

できます。JAの取引明細を取り込んで記帳の手間を減らし、受け取った補助金や交付金を使途ごとに管理できる製品があります。FX4クラウドやJDL IBEX会計、勘定奉行クラウドは税理士と連携して法人化や補助金の管理にも対応します。取引データの取り込みと補助金の管理の細かさに合うかを確かめましょう。

農業・林業・漁業向けの会計ソフトの料金はどのくらいですか?

クラウド自動化型は手頃で、freee会計は個人が月980円から、マネーフォワード クラウド確定申告は無料から、弥生会計は5万円前後が目安です。一次産業に専用対応する農業簿記や税理士連携の勘定奉行クラウドは月7,750円、大蔵大臣NXは264,000円の買い切り、FX4クラウドは要問い合わせです。営みの規模と法人格で総額が変わります。

表計算や手書きで農業の会計を続けると何に困りますか?

一次産業に特有の科目や補助金の管理を表計算で続けると、農業所得用の青色申告決算書づくりに手間がかかり、控除の取りこぼしや記帳漏れが起きやすくなります。農林漁業に向く製品なら、専用の科目での記帳からJA取引の取り込み、青色申告までを進められます。まず必要な科目と補助金の管理、法人化の見込みを整理して選ぶと安心です。

※掲載している機能・対応範囲・料金は一般的な目安です。製品・プラン・契約条件により異なる場合があるため、導入前に各製品の最新の公式情報や比較表でご確認ください。

サービスカテゴリ

AI・エージェント

汎用生成AI・エージェント
LLM・大規模言語モデル
エージェントフレームワーク
エージェントオートメーション基盤

ソフトウェア(Saas)

オフィス環境・総務・施設管理
開発・ITインフラ・セキュリティ
データ分析・連携