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電子帳簿保存法対応の会計ソフトおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/4/17
電子帳簿保存法に対応した会計ソフトは、単に帳簿を電子保存するだけのツールではありません。AI-OCRによる証憑の自動読み取りやタイムスタンプの自動付与など、法令対応と経理業務の効率化を同時に実現する製品へと進化しています。しかし、中小企業向けのクラウド会計からERPの会計モジュール、税理士連携を前提とした製品まで、対象とする企業規模や運用体制によって最適な製品は大きく異なります。FitGapでは、この違いを「会計体制」と「組織規模」の2軸で3タイプに整理し、要件定義から製品選定までを独自の視点でガイドします。
レビュー担当 松浦 大輔
FP技能士2級(AFP)・日商簿記2級を保有し、財務・会計の実務知識を裏付けている。freee等の会計・経費精算システムの業務利用経験を持ち、バックオフィス業務設計の視点から製品を評価している。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
中小企業向けクラウド会計タイプ 🌤️
勘定奉行クラウド
/ freee会計(法人)
/ マネーフォワード クラウド会計
中堅〜大企業向けERP会計タイプ 🏢
奉行V ERPクラウド
/ FX4クラウド
/ Galileopt DX
会計事務所・税理士連携重視タイプ 🤝
財務大将 (Galileopt DX 財務大将)
/ JDL IBEX会計net
/ 会計王
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
すべて表示

タイプ別お勧め製品

中小企業向けクラウド会計タイプ 🌤️

このタイプが合う企業:

従業員数10〜300名程度の中小企業で、経理担当が1〜数名の企業。電子帳簿保存法への対応と同時に経理業務全体を効率化したい方。

どんなタイプか:

電子帳簿保存法への対応を、日々の会計業務とセットで効率化したい中小企業に最適なタイプです。銀行口座やクレジットカードとの自動連携、AIによる自動仕訳といったクラウドならではの機能が充実しており、経理の専任担当者が少ない企業でも無理なく電子帳簿保存法の要件を満たせます。FitGapでは、はじめて電子帳簿保存法に対応する企業にまず検討していただきたいタイプだと考えています。JIIMA認証済みの製品が多く、タイムスタンプの自動付与や検索要件への対応もソフト任せにできるため、法令対応の不安を最小限にできます。

このタイプで重視すべき機能:

🔗銀行・クレカ自動連携による仕訳自動化
銀行口座やクレジットカードの取引明細を自動取得し、AIが勘定科目を推測して仕訳を作成してくれます。手入力の手間が大幅に減るだけでなく、入力ミスの防止にもつながります。
🔍電子取引データの自動保存・検索機能
メールやクラウド経由で受け取った請求書・領収書のPDFを、取引日・金額・取引先名で検索可能な状態で自動保存します。電子帳簿保存法が求める検索要件をソフト側で満たしてくれるため、自社で複雑なルールを整備する必要がありません。

おすすめ製品3選

勘定奉行クラウド
おすすめの理由
仕訳の承認ワークフローと監査・証憑ワークフローを標準で備えている点が、このタイプの他2製品にはない強みです。電子帳簿保存法への対応だけでなく、経理担当の増員や内部統制の整備を見据える企業に向いています。FitGapの利用シェアはおすすめ9製品中1位タイ(全体)で、特に製造業・卸売・建設業といった仕訳量が多い業種で支持されています。一方、要件対応数は85項目中36件でおすすめ9製品中7位にとどまり、OCR仕訳や請求書発行はオプション扱いです。電子帳簿保存法の証憑保存と日常経理の自動化を1つの製品で完結させたい場合は、追加費用の見積もりが判断の分かれ目になります。
価格
7,750円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
freee会計(法人)
おすすめの理由
OCR仕訳・請求書発行・多通貨処理・為替レート自動取込にいずれも○(対応)しており、電子帳簿保存法の証憑取り込みから海外取引の記帳まで手入力なしで処理できる範囲が広い点が特徴です。FitGapの利用シェアは中小企業セグメントで単独1位、IT・広告・飲食・士業など経理専任者が少ない業種で特に支持されています。要件対応数は85項目中40件でおすすめ9製品中5位です。ただし仕訳承認ワークフローや監査・証憑ワークフローはオプション扱いのため、部門間の承認フローを厳格に運用したい企業は追加コストを確認してください。
価格
2,980円
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
マネーフォワード クラウド会計
おすすめの理由
電子帳簿保存法対応において、証憑のスキャナ保存と電子取引データ保存の両方に対応し、請求書・経費精算の各サービスで取り込んだ証憑を会計データと紐づけて一元管理できる点が特徴です。取引先から受領した電子請求書やレシート画像を自動取込し、タイムスタンプ付きで保存する運用により、検索要件(取引先・日付・金額)を満たした証憑管理が可能です。FitGapの要件チェック(85項目)では41件対応で4位、シェアは3位です。一方、仕訳承認ワークフローや監査ワークフローは非対応のため、電子帳簿保存法の運用ルールとして承認・証跡のフローを会計ソフト内で完結させたい企業には不向きです。バックオフィス一体型の証憑取込で電子帳簿保存法対応を効率化したい中小企業に向き、承認フローまで含めた内部統制の整備を求める企業には他製品を検討してください。
価格
¥3,980
無料トライアルあり
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

中堅〜大企業向けERP会計タイプ 🏢

このタイプが合う企業:

従業員数300名以上の中堅〜大企業、グループ経営を行う企業、IPO準備中の企業。複数拠点・複数法人で統一的な会計管理と電子帳簿保存法対応を実現したい方。

どんなタイプか:

部門別会計やグループ連結決算など複雑な会計要件を持つ中堅〜大企業向けのタイプです。電子帳簿保存法への対応はもちろんのこと、内部統制やワークフロー承認、監査対応といったガバナンス機能が充実している点がFitGapとしての注目ポイントです。ERPの一機能として会計が組み込まれているため、販売管理・購買管理・人事給与など他の業務領域とデータが自動連携し、仕訳の二重入力を防げます。大量の電子取引データを部門横断で一元管理する必要がある企業は、このタイプを軸に検討するのがおすすめです。

このタイプで重視すべき機能:

🏗️部門別・グループ連結会計
事業部や子会社ごとの個別会計から、グループ全体の連結決算までを一つのシステム上で完結できます。セグメント別の損益管理やグループ間取引の消去仕訳も自動化されるため、決算業務のスピードと正確性が大幅に向上します。
🛡️内部統制・仕訳承認ワークフロー
仕訳の入力・承認・確定を段階的に管理するワークフロー機能により、不正や誤入力を組織的に防止できます。操作ログの記録や権限管理も細かく設定でき、電子帳簿保存法が求める改ざん防止要件と企業のガバナンス強化を同時に実現します。

おすすめ製品3選

奉行V ERPクラウド
おすすめの理由
電子帳簿保存法対応の会計ソフトおすすめ9製品のうち、要件対応数は2位(85項目中58件対応)、利用シェアは全体1位タイです。このタイプ3製品の中では、連結自動消去やGST/VATレポートに標準対応している唯一の製品で、海外子会社を含むグループ連結決算や多通貨処理が必要な企業に向いています。仕訳承認ワークフローと監査・証憑ワークフローの両方が標準搭載されており、内部統制の強化を進める上場準備企業にも適合します。一方、銀行API取込やOCR仕訳はオプション課金となるため、自動仕訳の効率化を重視する場合は追加コストを見込む必要があります。
価格
要問合せ
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
FX4クラウド
おすすめの理由
電子帳簿保存法対応の会計ソフトおすすめ9製品のうち、要件対応数は1位(85項目中60件対応)です。銀行API取込・OCR仕訳が標準対応で、電子取引データの自動取込から仕訳生成までを追加費用なく完結できる点が、同タイプの奉行V ERPクラウド(いずれもオプション課金)との明確な差です。資金収支計算書の自動作成や予算シミュレーション機能にも標準対応しており、社会福祉法人・NPO法人の資金管理にも活用できます。注意点として、利用にはTKCの会計事務所との顧問契約が前提となるため、自社単独での導入はできません。
価格
要問合せ
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
電子帳簿保存法対応において、証憑の取込・保存・検索に加え、承認ワークフローを標準搭載している点が中堅以上の企業にとっての実務上の強みです。電子取引データの受領からタイムスタンプ付き保存、取引先・日付・金額による検索、承認者による証跡確認までを1つの基盤で処理でき、法対応の運用ルールをシステム上に組み込めます。FitGapの要件チェック(85項目)では47件対応で3位、このタイプ3製品の中で唯一IFRSデュアル帳簿にも対応しているため、電子帳簿保存法対応とIFRS対応を同時に進めたい企業では検討候補になります。一方、シェアは5位タイで、同タイプの奉行V ERPクラウドやFX4クラウドと比べると導入実績は限定的です。電子帳簿保存法の証憑管理とIFRS対応を1基盤で実現したい中堅企業に向きます。
価格
要問合せ
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ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

会計事務所・税理士連携重視タイプ 🤝

このタイプが合う企業:

小規模法人や個人事業主で、顧問税理士・会計事務所に経理業務を一部または全面的に委託している方。記帳代行を利用しつつ電子帳簿保存法に確実に対応したい方。

どんなタイプか:

顧問税理士や会計事務所とのデータ共有・連携を前提に設計されたタイプです。FitGapでは、経理の専門知識が社内に乏しく、税理士に記帳代行や決算を依頼している企業にとって最も現実的な選択肢だと考えています。電子帳簿保存法の対応方針を税理士と相談しながら進められるよう、仕訳データのリアルタイム共有や証憑の受け渡し機能が充実しています。税理士事務所側で同じシステムを使っているケースも多いため、導入後のサポートや運用相談がスムーズに行えるのも大きな利点です。

このタイプで重視すべき機能:

👨‍💼税理士とのリアルタイムデータ共有
入力した仕訳データや証憑を、顧問税理士とリアルタイムで共有できます。書類の郵送や手渡しが不要になり、月次チェックや決算作業のやり取りが格段にスピードアップします。
JIIMA認証による優良電子帳簿対応
JIIMA認証(電子帳簿ソフト法的要件認証)を取得した製品が揃っており、優良な電子帳簿の要件を自動的に満たします。過少申告加算税の5%軽減措置を受けられる可能性があり、税務リスクの軽減にもつながります。

おすすめ製品3選

財務大将 (Galileopt DX 財務大将)
おすすめの理由
電子帳簿保存法対応において、MJS系会計事務所と同一基盤で証憑データを共有できる点が、法対応の運用ルールを税理士と共同で構築する際の実務上の強みです。税理士側で証憑の保存状況や検索要件の充足を直接確認できるため、電子帳簿保存法の運用ルール策定から日常の証憑管理までを顧問先と一体で進められます。おすすめ9製品中、要件対応数は6位(85項目中38件)で、上位製品と比べると対応範囲は限定的ですが、証憑の電子保存と税理士連携を両立させる用途では過不足のない構成です。一方、OCR仕訳は非対応のため、紙の証憑を大量に処理する企業では手入力の工数が発生します。MJS系税理士と連携しながら電子帳簿保存法の運用体制を整えたい企業に向き、自社完結で証憑管理を自動化したい場合は他製品を検討してください。
価格
要問合せ
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
JDL IBEX会計net
おすすめの理由
電子帳簿保存法対応において、JDL系会計事務所と証憑データを直接やり取りできる点が法対応の実務面での特徴です。税理士事務所側で証憑の保存・検索状況を確認しながら、電子帳簿保存法の運用ルールに沿った月次チェックを進められます。一方、要件対応数はおすすめ9製品中9位(85項目中24件)と最少で、OCR仕訳は×(非対応)のため、証憑の自動取込や仕訳の自動生成を自社側で完結させることはできません。電子取引データの保存・検索要件への対応は、JDL側の証憑管理機能と組み合わせて運用する前提です。顧問税理士がJDL環境を使っており、証憑管理を含めて税理士主導で電子帳簿保存法対応を進めたい企業に向きます。自社側で証憑の取込・検索・承認まで完結させたい場合は、OCR仕訳や承認ワークフローを備えた他製品を検討してください。
価格
3,610円
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
おすすめの理由
電子帳簿保存法対応において、買い切り型の低コストで証憑の電子保存と検索要件を満たせる点が、小規模法人や個人事業主にとっての実務的な利点です。電子取引データの保存に対応しており、取引先・日付・金額での検索が可能なため、法対応の最低限の要件をコストを抑えて満たしたい事業者に向いています。おすすめ9製品中、要件対応数は8位(85項目中35件)で、承認ワークフローや監査ワークフローは非対応です。そのため、電子帳簿保存法の運用ルールとして社内承認フローをシステム上に組み込みたい企業には不向きです。確定申告書作成にも対応しているため、税理士への受け渡しと自社での申告作業を並行する小規模事業者が、法対応と申告を1製品で処理する用途に向きます。証憑の自動取込やクラウド保存を重視する場合は他製品を検討してください。
価格
¥44,000
買い切り
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

🏅JIIMA認証の取得有無
JIIMA認証を取得している会計ソフトは、電子帳簿保存法の法的要件を第三者機関が保証しています。認証がないソフトでは自社で要件充足を確認する手間が発生するため、FitGapでは認証取得済みの製品を強くおすすめしています。
📩電子取引データの保存機能
メールやクラウド経由で受け取った請求書・領収書などの電子取引データを、法令要件に沿った形式で自動保存する機能です。2024年1月から完全義務化されたため、対応の有無が製品選定の最重要ポイントになります。
📷スキャナ保存への対応範囲
紙で受け取った請求書や領収書をスキャンして電子保存する機能です。タイムスタンプの自動付与や訂正削除履歴の管理など、スキャナ保存要件をどこまでカバーしているかが製品ごとに大きく異なります。
📘優良な電子帳簿の作成機能
訂正・削除履歴の記録、帳簿間の相互関連性、検索機能の3要件を満たすと「優良な電子帳簿」として認められ、過少申告加算税が軽減されます。FitGapでは、この優良帳簿に対応しているかどうかを選定の決め手として重視しています。
🤖AI-OCRによる自動データ化精度
領収書や請求書をスキャンした際に、取引日・金額・取引先名をAIで自動読み取りする機能です。精度が高いほど手入力の手間が減り、検索要件の入力負担も大幅に軽減されます。製品によって精度差が大きいため要比較です。
🔗既存システムとの連携方法
現在使っている経費精算や請求書管理などのシステムとAPI連携やCSV連携ができるかは、運用効率を左右する重要な要件です。会計ソフト単体で完結しない業務が多い企業ほど、連携の柔軟性が選定の決め手になります。

一部の企業で必須

🧾インボイス制度への対応
適格請求書の発行・受領・保存を会計ソフト上で一体管理できる機能です。課税事業者として仕入税額控除を受ける企業では必須ですが、免税事業者であれば優先度は下がります。
🔒内部統制・仕訳承認ワークフロー
仕訳の登録・修正に承認フローを設定し、不正な変更を防止する機能です。IPO準備中の企業や上場企業では必須ですが、小規模事業者には過剰になることもあります。
🏢多拠点・部門別管理
複数の事業所や部門ごとに帳簿を分けて管理し、連結処理まで対応する機能です。拠点数が多い中堅〜大企業では不可欠ですが、単一拠点の企業には不要な場合があります。
💱外貨建取引の処理
外貨建ての仕入・売上を自動で邦貨換算し、為替差損益を計上する機能です。海外取引がある企業では必須ですが、国内取引のみの企業では優先度が低くなります。
👨‍💼税理士・会計事務所とのデータ共有
顧問税理士や会計事務所と同じデータをリアルタイムで共有し、遠隔で帳簿チェックや決算作業を行える機能です。税理士に記帳代行を依頼している企業では業務効率が大きく変わります。

ほぼ全製品が対応

🔍取引日・金額・取引先の検索機能
電子帳簿保存法で必須とされている3項目(取引日・金額・取引先)での検索機能です。電帳法対応を謳う会計ソフトであれば、ほぼすべての製品に標準搭載されています。
📝訂正削除の履歴管理
仕訳データの訂正・削除を行った場合にその操作履歴を自動記録する機能です。電子帳簿保存法の「真実性の確保」要件に該当し、対応製品であればほぼ標準で備わっています。
🏦銀行口座・クレジットカード連携
金融機関やクレジットカードの取引明細を自動で取り込み、仕訳候補を生成する機能です。現在のクラウド会計ソフトではほぼ全製品が対応しており、差別化ポイントにはなりにくいです。
🔄法改正時の自動アップデート
電子帳簿保存法や税制改正があった際に、ソフトウェアが自動でアップデートされる機能です。クラウド型の会計ソフトであればほぼ全製品が対応しています。

優先度が低い

🖨️紙の帳簿の印刷・出力機能
電子帳簿保存を前提とした場合、紙への印刷・出力機能の充実度は選定における優先度が低くなります。むしろ電子保存の運用にどれだけ最適化されているかを重視すべきです。
🌐多言語対応
日本国内の電子帳簿保存法への対応が主目的であれば、英語やその他の言語への対応は優先度が低い要件です。海外拠点がない企業では検討不要なケースがほとんどです。

電子帳簿保存法対応の会計ソフトおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイドの選び方

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