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クラウドの年末調整ソフトおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2025年10月02日
クラウドの年末調整ソフトは、年末調整の申告回収だけに特化した製品から、給与計算や労務管理と一体になった製品まで幅広く存在します。近年はアンケート形式の入力UIやスマホ対応、マイナポータル連携といった機能が充実し、従業員・人事担当者双方の負担を軽減できる製品が増えています。一方で、製品タイプによって導入の前提条件や既存システムとの相性が大きく異なるため、自社に合わないタイプを選ぶと効果を十分に得られません。本ガイドでは、3つのタイプ別におすすめ製品を紹介したうえで、要件の優先度整理から具体的な選定ステップまでを順を追って解説します。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
年末調整の申告回収に特化したタイプ 📋
マネーフォワード クラウド年末調整
/ オフィスステーション年末調整
/ ジョブカン年末調整
給与計算と年末調整を一元管理できるタイプ 💰
給与奉行クラウド
/ ジンジャー給与
/ 弥生給与Next
労務管理の中で年末調整も完結するタイプ 👥
SmartHR 労務管理
/ freee人事労務
/ HRMOS年末調整
企業規模
大企業
中小企業
その他
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タイプ別お勧め製品

年末調整の申告回収に特化したタイプ 📋

このタイプが合う企業:

すでに給与計算ソフトや労務管理ソフトを導入済みで、年末調整業務だけをクラウド化・ペーパーレス化したい企業の人事・総務担当者

どんなタイプか:

既に給与計算ソフトや労務管理ソフトを導入済みの企業が、年末調整業務だけをクラウド化するために使う製品群です。申告書のWeb配布・回収・進捗管理に機能を絞っている分、既存システムを入れ替えずに導入できます。他社の給与ソフトとCSVやAPIで連携し、年税額の算出や電子申告まで対応する製品が多く、年末調整の時期だけ発生する繁忙業務をピンポイントで効率化したい企業に向いています。FitGapとしては、すでに給与計算や勤怠管理の仕組みが社内にある中堅〜大企業ほど、このタイプのメリットを感じやすいと考えています。

このタイプで重視すべき機能:

📨Web申告書の配布・回収・進捗管理
従業員へ申告書をWebで配布し、提出状況をリアルタイムで一覧管理できます。未提出者へのリマインド送信にも対応しており、紙の回収・督促にかかる工数を減らすことに役立ちます。
🔗外部給与ソフトとのデータ連携
CSVインポートやAPI連携により、既存の給与計算ソフトから支給データを取り込み、年税額の自動計算や源泉徴収票の作成につなげることができます。給与ソフトを変更せずに導入できる点がこのタイプの強みです。

おすすめ製品3選

マネーフォワード クラウド年末調整
おすすめの理由
他社給与ソフトとも連携可能で、年末調整の単体導入ができるクラウド製品として高いシェアを持っています。アンケート形式の入力UIやe-Tax・eLTAX連携も備えています。
価格
2,980円
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
オフィスステーション年末調整
おすすめの理由
年末調整の申告書配布・回収に特化した設計で、各種給与ソフトとのAPI・CSV連携に幅広く対応しています。従量課金で低コストから導入しやすい点も特徴です。
価格
¥11,000
年額
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ジョブカン年末調整
おすすめの理由
ジョブカンシリーズとの連携はもちろん、単体でも導入でき、シンプルな操作性と手頃な価格帯でシェアを伸ばしています。
価格
2,000円
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

給与計算と年末調整を一元管理できるタイプ 💰

このタイプが合う企業:

給与計算ソフトの新規導入や入れ替えを検討中で、月次の給与計算から年末調整までを一つのシステムで完結させたい企業

どんなタイプか:

毎月の給与計算機能の一部として年末調整が組み込まれている製品群です。1年間の給与・賞与データがそのまま年末調整計算に引き継がれるため、データの転記や取り込み作業が不要になります。過不足税額の精算を給与・賞与のどちらで行うかを従業員ごとに選べるなど、給与計算と連動しているからこそ可能な処理がある点も特徴です。FitGapでは、給与計算ソフトの導入・刷新を検討しているタイミングであれば、このタイプから選ぶのが効率的だと考えています。

このタイプで重視すべき機能:

🔄給与・賞与データとの自動連動
毎月の給与計算データや賞与データが自動的に年末調整の計算に反映されます。手作業によるデータ転記が不要になるため、入力ミスの防止や作業時間の短縮に役立ちます。
🧮過不足税額の精算処理
年末調整で算出された過不足税額を、12月給与や賞与など精算タイミングを指定して自動反映できます。給与計算と一体だからこそ、精算までシステム内で完結します。

おすすめ製品3選

給与奉行クラウド
おすすめの理由
中堅企業での導入実績が豊富な給与計算ソフトで、年末調整計算から法定調書作成までを一貫して処理できます。奉行Edgeシリーズとの連携で申告書のWeb回収にも対応します。
価格
5,500円
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
ジンジャー給与
おすすめの理由
ジンジャーシリーズの給与計算ソフトで、人事労務データとの連携により年末調整計算を自動化できます。過不足税額の給与・賞与精算の切り替えにも対応しています。
価格
300円
ユーザー/月
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
弥生給与Next
おすすめの理由
給与計算・勤怠管理・労務管理を一つのソフトで扱えるクラウド製品です。業務の進捗を画面上で確認でき、初めて給与計算ソフトを使う担当者にも使いやすい設計になっています。
価格
9,000円
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

労務管理の中で年末調整も完結するタイプ 👥

このタイプが合う企業:

入退社手続き・社会保険手続き・年末調整など、労務管理業務を包括的にクラウド化して従業員情報を一元管理したい企業

どんなタイプか:

人事労務管理システムの一機能として年末調整が搭載されている製品群です。従業員の入退社・住所変更・扶養異動といった人事情報をデータベースで一元管理しており、その情報がそのまま年末調整の申告書に自動反映されます。従業員が自身の情報をセルフサービスで更新できるため、人事部門の確認・転記作業が減り、情報の鮮度も保たれやすくなります。FitGapとしては、年末調整だけでなく入退社手続きや社会保険手続きなどの労務業務全体をまとめてクラウド化したい企業に適していると見ています。

このタイプで重視すべき機能:

🗂️従業員データベースとの自動連携
従業員の氏名・住所・扶養家族情報などを人事データベースで管理し、年末調整の申告書に自動で反映します。転記作業がなくなり、情報の不整合や入力漏れを防ぐことに役立ちます。
📱従業員セルフサービスでの情報更新
従業員自身がスマートフォンやPCから個人情報の変更や年末調整の回答を行えます。紙の書類を配る必要がなくなり、担当者・従業員双方の負担を減らすことができます。

おすすめ製品3選

SmartHR 労務管理
おすすめの理由
クラウド労務管理のトップシェア製品で、年末調整はスマホから最短数分で提出でき、従業員のUI評価が高い製品です。各種給与ソフトへのデータ連携にも対応しています。
価格
0円~
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
freee人事労務
おすすめの理由
給与計算・勤怠管理・入退社手続き・年末調整を一つのソフトで完結できる統合型の製品です。freee会計との連携により、バックオフィス業務を横断的に効率化できます。
価格
2,000円
無料トライアルあり
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
HRMOS年末調整
おすすめの理由
ビズリーチが提供する人事労務プラットフォームの年末調整機能で、従業員情報の一元管理と連動した申告書作成が可能です。
価格
0円~
シェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能

要件の優先度のチャート:比較すべき機能はどれか

要件の優先度チャートとは?

製品の機能は多岐にわたりますが、選定の結果を左右するのは一部の機能です。 FitGapの要件の優先度チャートは、各機能を"必要とする企業の多さ"と"製品ごとの対応差"で4つに整理し、比較の優先順位をわかりやすく示します。

選定の決め手

🧩製品タイプ(年末調整特化型 or 給与・労務一体型)
年末調整だけを効率化したいのか、給与計算や労務管理もまとめて導入したいのかによって、選ぶべき製品が根本的に変わります。既存の給与ソフトを使い続けるなら特化型、バックオフィス全体を刷新するなら一体型が適しています。
🔗既存の給与計算ソフトとの連携方法
年末調整の結果を給与計算ソフトに取り込む際、CSV連携のみか、API連携にも対応しているかで作業負荷が大きく変わります。自社で使っている給与ソフトとスムーズに連携できるか、導入前に必ず確認してください。
📝従業員の入力方式(アンケート型 or 帳票一覧型)
「はい・いいえ」で回答するアンケート型と、申告書の項目を直接埋める一覧型の2パターンがあります。ITに不慣れな従業員が多い場合はアンケート型の方が問い合わせが減りやすく、人事経験者が多い場合は一覧型の方が効率的です。
🏛️e-Tax・eLTAX電子申告への対応
100枚以上の源泉徴収票を提出する企業にはe-Tax電子申告が義務化されています。ソフトから直接電子申告データを出力できるかどうかは、対応が必須かどうかを含めて確認しておく必要があります。
📊提出状況の管理・リマインド機能
従業員ごとの提出状況を一覧で確認でき、未提出者への督促メールを一括送信できる機能は、製品によって精度や使い勝手に差があります。FitGapでは、特に従業員数が多い企業ほど重視すべき要件と考えています。
📱スマートフォン対応
現場作業が多い業種や店舗勤務の従業員が多い企業では、PCを使わずにスマホから申告できるかが提出率に直結します。スマホ対応の有無だけでなく、画面の操作性まで確認すると安心です。

一部の企業で必須

🪪マイナポータル連携(控除証明書の自動取得)
マイナポータルから保険料控除証明書等を電子データで自動取得できる機能です。従業員に紙の証明書を提出してもらう手間が省けますが、従業員側のマイナンバーカード利用率が低い場合は効果が限定的です。
🌐多言語対応(英語表記など)
外国籍の従業員が一定数いる企業では、申告画面の英語表記や多言語対応があると、問い合わせ対応の負担が減ります。FitGapでは、対応製品がまだ限られるため、該当する場合は早めに候補を絞ることをおすすめします。
📸証明書画像のアップロード機能
保険料控除証明書などの原本を写真に撮ってアップロードできる機能です。紙の証明書を郵送・手渡しする手間が省けますが、電子化が進んでいない取引先が多い場合に特に役立ちます。
🏢団体保険データの一括取り込み
団体扱い保険に加入している企業では、保険会社から受け取ったデータを一括で取り込める機能があると、従業員の入力負担を軽減できます。対象者が多いほど効果は大きいですが、対応製品は限られます。
🔄前年データの自動引き継ぎ
前年の申告内容を自動で翌年のフォームに反映する機能です。変更がない項目の再入力が不要になるため、特に毎年の申告内容に大きな変動がない従業員が多い企業に有効です。

ほぼ全製品が対応

🧮控除額の自動計算
入力された情報をもとに、各種控除額や過不足税額を自動で計算する機能です。ほぼすべてのクラウド年末調整ソフトに標準搭載されており、手計算による計算ミスを防ぐことができます。
💻申告書の作成・回収のWeb完結
申告書の配布・入力・回収・差し戻しをすべてWeb上で完結できる機能です。クラウド型であればほぼ標準で備わっており、紙の配布・回収コストの削減に役立ちます。
📄源泉徴収票・法定調書の作成
年末調整の結果をもとに源泉徴収票や給与支払報告書を自動作成する機能です。多くの製品で対応しており、帳票作成の手間を省くことができます。
⚖️法改正への自動アップデート
毎年の税制改正に合わせてシステムが自動更新される機能です。クラウド型の基本的なメリットであり、担当者が改正内容を手動で反映する必要がありません。

優先度が低い

🤖AIによる控除証明書のOCR読み取り
保険料控除証明書などの画像をAI-OCRで自動読み取りする機能です。あると便利ですが、対応精度は製品により異なり、最終的に目視確認が必要な場合も多いため、選定の決め手にはなりにくいです。
ワークフロー承認機能
申告内容を上長が承認するワークフローを設定できる機能です。組織の内部統制上必要な場合もありますが、年末調整業務では人事部門が直接確認するケースが大半のため、優先度は低めです。

クラウドの年末調整ソフトの選び方

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