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個人事業主の確定申告ソフトおすすめ9選｜タイプ別の選び方ガイド

更新：2026/6/17

個人事業主の確定申告ソフトは、簿記経験に加えて、申告書作成の進め方や明細取込・周辺業務とのつながりも比較対象になります。質問形式で申告書を作るタイプ、銀行・カード明細や請求書・経費精算をつなぐタイプ、PCにインストールしてオフラインで帳簿入力するタイプでは、日々の記帳と提出準備の進め方が変わります。まず青色申告や消費税対応の有無、明細取込で自動仕訳したいか、EC販売の入金まで扱うかを整理すると、見るべき機能を絞りやすくなります。このページでは、申告書作成の進め方と周辺業務とのつなげ方を分けて、個人事業主の確定申告ソフトの候補を比較できます。

レビュー担当 松浦大輔

FP技能士2級（AFP）・日商簿記2級を保有し、財務・会計の実務知識を裏付けている。freee等の会計・経費精算システムの業務利用経験を持ち、バックオフィス業務設計の視点から製品を評価している。

FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

個人事業主向けの確定申告ソフトのおすすめ製品を製品ごとにタイプ、料金、企業規模、評価ポイントで比較する表
製品名	タイプ	料金	企業規模	評価ポイント
freee会計（個人）	簿記知識ゼロでも使える初心者特化タイプ 🔰	1,780円月	中小中堅大企業	簿記に不慣れでも質問形式で申告できる。EC・決済連携も強い。
やよいの白色申告オンライン	簿記知識ゼロでも使える初心者特化タイプ 🔰	0円〜年	中小中堅大企業	白色申告を無料で始められる。e-Tax・インボイスにも対応。
ジョブカン青色申告	簿記知識ゼロでも使える初心者特化タイプ 🔰	13,200円年/ライセンス	中小中堅大企業	農業・不動産所得まで対応。兼業の個人事業も一つのクラウドで扱える。
マネーフォワードクラウド確定申告	自動仕訳・バックオフィス連携で効率重視タイプ ⚡	0円〜月	中小中堅大企業	請求・経費・給与まで広げられる。副業・ネット販売の入金も取り込める。
やよいの青色申告オンライン	自動仕訳・バックオフィス連携で効率重視タイプ ⚡	11,800円年	中小中堅大企業	全プラン同じ機能で、サポート量だけ選べる。消費税申告も標準対応。
JDL IBEXクラウド組曲Major 所得税確定申告書・青色申告決算書	自動仕訳・バックオフィス連携で効率重視タイプ ⚡	30,000円年額	中小中堅大企業	医療費・寄附金・外国税額控除まで対応。複雑な申告を専門家と仕上げられる。
やよいの青色申告	インストール型で買い切り・オフライン運用タイプ 💻	10,300円年	中小中堅大企業	買い切り型の定番で売上実績がトップ。制度対応と手厚いサポートも備える。
みんなの青色申告	インストール型で買い切り・オフライン運用タイプ 💻	10,780円買い切り	中小中堅大企業	低コストで買い切れる。農業・不動産の青色申告まで対応。
ジョブカンDesktop 青色申告	インストール型で買い切り・オフライン運用タイプ 💻	5,500円年	中小中堅大企業	Mac対応版も選べる。初回ガイドとかんたん取引帳で始めやすい。

確定申告ソフトの導入によって得られる効果

確定申告ソフトは、申告に必要な帳簿や書類の作成を支援するためのツールです。導入前後で変わる点は、下の表で確認できます。

導入前の課題	導入によって得られる効果
申告書作成に時間がかかる	日々の取引データから申告書を作成しやすくなり、申告前の集計作業を減らせます
経費の整理に手間がかかる	領収書や支払情報をまとめて管理し、経費分類や書類確認の手間を減らせます
控除の確認が不安	控除に関する入力項目を整理しやすくなり、申告時の確認漏れを抑えやすくなります
帳簿作成が手作業中心	取引入力から帳簿作成までをつなげ、手書きやExcel管理の作業を減らせます
税制変更への対応が不安	申告ルールに沿った入力を進めやすくなり、制度変更時の確認負担を抑えられます

続いて、個人事業主向け確定申告ソフトをタイプ別に分類し、それぞれのおすすめ製品を紹介します。

個人事業主向け確定申告ソフト3タイプを解説

比較項目	簿記知識ゼロでも使える初心者特化タイプ	自動仕訳・バックオフィス連携で効率重視タイプ	インストール型で買い切り・オフライン運用タイプ
優れている点	質問形式で申告書を自動作成	銀行明細から仕訳を自動反映	買い切りでオフライン完結
できること	質問応答型入力申告書自動作成スマホ電子申告	自動仕訳連携明細自動取込請求書経費連携	買い切りライセンスオフライン帳簿入力年度更新管理
適している企業/業種	個人事業主副業事業者	取引量の多い事業者複数口座を持つ事業者	個人事業主
料金目安	無料〜（有料プランあり）	年額30,000円〜	公式サイトで要確認

タイプ別おすすめ製品

簿記知識ゼロでも使える初心者特化タイプ 🔰

このタイプが合う企業：

開業直後の個人事業主、副業で初めて確定申告をする方、簿記の知識がまったくない方

どんなタイプか：

簿記知識がなくても、質問形式の入力やガイドに沿って収支整理から申告書作成まで進めるタイプです。専門用語を抑えた画面と自動作成の導線が特徴です。

口座連携で記帳を自動化したいネット販売の個人事業主向け

freee会計（個人）は、質問に答える感覚で帳簿と申告書作成を進められる、自動化重視のクラウド確定申告ソフトです。銀行口座・クレジットカードに加え、ECサイトや決済サービスの取引も取り込みやすく、FitGapでは連携評価がカテゴリ51製品中1位、操作性4位、サポート5位です。簿記用語を覚えるより、口座やカードをつないで日々の記帳を減らしたいフリーランス、ネット販売や複数サービスから入金がある個人事業主に向きます。一方、電話相談はプレミアムプラン限定で、料金評価は23位と低めです。スタータープランでは消費税申告書を作れないため、課税事業者や自由な仕訳・帳票設定を重視する方は他製品や上位プランとの比較が必要です。

価格

1,780円

月

無料トライアルあり

中小企業でのシェア

ユーザの企業規模

中小企業

中堅企業

大企業

使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ

メリットと注意点

仕様・機能

やよいの白色申告オンライン

製品情報を見る

無料で白色申告を自分で終わらせたい開業直後や副業の人向け

やよいの白色申告オンラインは、白色申告に必要な収支入力と申告書作成に絞り、無料で始められる入門向けクラウド確定申告ソフトです。青色申告まで見越す製品ではありませんが、その分シンプルで、FitGapでは導入しやすさが同タイプ内で1位タイ、料金評価も上位です。 副業収入や開業直後の小規模事業で、まず白色申告を自分で終わらせたい人に向きます。 e-Taxデータ出力、インボイス対応、銀行API連携、OCRに対応するため、無料でも提出や取引取り込みまで進めやすい点が強みです。一方、無料プランは電話・メールなどの個別サポート対象外で、青色申告、青色専従者給与、複数事業、不動産共通経費按分、農業には対応しません。65万円控除や事業拡大を考える方は青色申告向け製品と比較して下さい。

価格

0円〜

年

中小企業でのシェア

ユーザの企業規模

中小企業

中堅企業

大企業

使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ

メリットと注意点

仕様・機能

ジョブカン青色申告

製品情報を見る

不動産や農業を兼ねる個人事業主の青色申告におすすめ

ジョブカン青色申告は、簿記に不慣れでも画面案内に沿って青色申告書まで作れるうえ、不動産所得や農業所得など少し複雑な個人事業にも対応しやすいクラウド型ソフトです。質問に答える形式で申告書作成を進められ、FitGapでは操作性がカテゴリ51製品中4位、導入しやすさも5位と、初めて確定申告ソフトを使う人でも始めやすい評価です。複数事業・複数物件管理、不動産の共通経費按分、農業対応、消費税申告や簡易課税・本則課税まで扱えるため、副業から本業化する人や不動産・農業を兼ねる個人事業主に向きます。一方、レシート画像のOCR、AI仕訳、インボイス番号照会API連携は非対応です。スマホ撮影だけで記帳を進めたい人や、自動化を最優先する人は他製品も比較して下さい。

価格

13,200円

年/ライセンス

無料トライアルあり

中小企業でのシェア

ユーザの企業規模

中小企業

中堅企業

大企業

使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ

メリットと注意点

仕様・機能

自動仕訳・バックオフィス連携で効率重視タイプ ⚡

このタイプが合う企業：

取引件数が月数十件以上ある方、請求書発行や経費精算も一元管理したい方、複数の銀行口座やカードを使い分けている方

どんなタイプか：

銀行・カード明細の取込、AI仕訳、請求書や経費精算との連携で記帳から周辺業務まで効率化するタイプです。取引量が多い運用でも二重入力を減らせます。

投資や越境ECまで広がる収入をまとめて申告したい人向け

マネーフォワードクラウド確定申告は、銀行・カード明細の自動取得から請求書発行、経費精算、給与計算まで同じIDで広げられる、バックオフィス連携重視のクラウド確定申告ソフトです。 2,300以上のサービス連携に加え、このタイプでは証券連携（特定口座）、外貨取引、越境EC、副業プラットフォーム連携まで扱える点が強く、複数口座や副業・ネット販売の入金をまとめて申告したい個人事業主に向きます。 FitGapでは操作性・サポート評価が同ページ内1位で、経理に慣れない人でも日常処理を進めやすい製品です。一方、消費税申告書、インボイス、簡易課税、本則課税、複数事業は追加オプション扱いです。課税事業者や最安運用を重視する人は、やよいの青色申告オンラインと費用・標準機能を比べてください。

価格

0円〜

月

無料トライアルあり

中小企業でのシェア

ユーザの企業規模

中小企業

中堅企業

大企業

使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ

メリットと注意点

仕様・機能

やよいの青色申告オンライン

製品情報を見る

課税事業者になっても定額で続けやすい青色申告クラウド

やよいの青色申告オンラインは、青色申告に必要な帳簿付けと申告書作成をクラウドでまとめつつ、プラン選びを機能ではなくサポート量で決められるシンプルな製品です。 銀行明細やカード取引の取り込み、AI仕訳、Misoca連携による請求書データの自動仕訳に対応し、請求から記帳までの手入力を抑えたい個人事業主に向きます。特に消費税申告書、インボイス、簡易課税、本則課税を追加オプションなしで使えるため、課税事業者になっても定額で続けやすく、FitGapでは料金評価と導入しやすさ評価が同ページ内1位タイです。一方、インボイス番号照会API連携やデータ移行・インポートは非対応で、複業や越境ECには向きません。スマホだけで申告書作成まで完結したい人や連携範囲を広く取りたい人は、マネーフォワードも比べるべきです。

価格

11,800円

年

無料トライアルあり

中小企業でのシェア

ユーザの企業規模

中小企業

中堅企業

大企業

使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ

メリットと注意点

仕様・機能

JDL IBEXクラウド組曲Major 所得税確定申告書・青色申告決算書

製品情報を見る

税理士と連携して複雑な申告を仕上げたい個人事業主向け

JDL IBEXクラウド組曲Major 所得税確定申告書・青色申告決算書は、税理士・会計事務所側の実務に寄せて、所得税申告書と青色申告決算書を正確に作るための専門性が高い製品です。医療費集計フォーム、ふるさと納税証明書、外国税額控除、金融デリバティブや農業の申告まで扱えるため、税理士とデータをやり取りしながら複雑な申告を仕上げたい個人事業主に向きます。 FitGapでは機能性・セキュリティ・連携評価が同ページ内1位タイで、士業・金融保険・人材派遣のシェアも同ページ内1位です。一方、請求書連携、キャッシュレス連携、AI仕訳で日々の記帳を軽くする用途には合いにくく、Windows環境と年額30,000円以上の費用も前提です。自力でスマホ中心に申告まで進めたい人は、マネーフォワードややよいを先に比べる方が現実的です。

価格

30,000円

年額

中小企業でのシェア

ユーザの企業規模

中小企業

中堅企業

大企業

使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ

メリットと注意点

仕様・機能

インストール型で買い切り・オフライン運用タイプ 💻

このタイプが合う企業：

月額課金を避けたい方、オフラインで会計作業をしたい方、パッケージ型ソフトに慣れている方

どんなタイプか：

PCにインストールして帳簿入力や申告書作成を行う買い切り中心のタイプです。クラウド連携より、手元保存・オフライン作業・年度ごとの更新管理が前提になります。

買い切りで電話サポートも使いたい個人事業主の定番ソフト

やよいの青色申告は、買い切り型でも申告機能と制度対応を広く備えた、実績重視の定番インストール型ソフトです。帳簿入力から決算書・申告書類作成までPC内で進められ、消費税申告書、インボイス、簡易課税・本則課税、インボイス番号照会API連携まで対応します。 FitGapでは料金評価が同ページ内で1位タイ、サポート評価も2位タイで、費用を抑えつつ電話サポートや更新を使って毎年の申告を進めたい個人事業主に向きます。 複数事業・複数物件管理や不動産共通経費按分にも対応するため、店舗運営と不動産賃貸を兼ねる人にも候補になります。一方、導入しやすさ評価は低く、初期設定や税制改正時の更新を自力で進める負担があります。農業経営者・越境EC、Mac中心の環境では別製品も比べるべきです。

価格

10,300円

年

無料トライアルあり

中小企業でのシェア

ユーザの企業規模

中小企業

中堅企業

大企業

使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ

メリットと注意点

仕様・機能

みんなの青色申告

製品情報を見る

低コスト買い切りで農業や賃貸を含む兼業の申告に向くソフト

みんなの青色申告は、低コストで始めやすい買い切り型に、取引リスト入力や金融機関連携を組み合わせた初心者向けのインストール型ソフトです。消費税申告書、インボイス、簡易課税・本則課税に対応し、複数事業・複数物件管理、不動産共通経費按分も扱えるため、小規模な農業や不動産賃貸を含む兼業の個人事業主に合います。 FitGapでは農業、林業、漁業のシェアが同ページ内で1位、操作性評価もカテゴリ内で上位で、簿記に慣れていない人が入力負担を抑えて使う候補になります。一方、e-Taxをソフトから直接送信する機能はなく、データ出力や「みんなの確定申告クラウド」との連携を前提にした運用になります。電子帳簿保存法の電子取引・スキャナ保存は追加オプションで、保守や手厚いサポートを重視する初心者は、総額と支援体制を他製品と比べてください。

価格

10,780円

買い切り

無料トライアルあり

中小企業でのシェア

ユーザの企業規模

中小企業

中堅企業

大企業

使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ

メリットと注意点

仕様・機能

ジョブカンDesktop 青色申告

製品情報を見る

買い切りで手元PC運用したい人がすぐ立ち上げられる申告ソフト

ジョブカンDesktop 青色申告は、買い切りで使えるデスクトップ型の確定申告ソフトで、クラウド連携よりも手元PCで着実に記帳・申告書作成を進めたい個人事業主向けの製品です。 初回ガイドと「かんたん取引帳」で仕訳入力を始めやすく、FitGapでは導入しやすさが同ページのおすすめ9製品中1位タイ、買い切り型3製品の中でも立ち上げの軽さが目立ちます。青色申告決算書、確定申告書B、消費税申告書、固定資産台帳、インボイス、青色専従者給与に対応し、不動産所得や複数事業をまとめたい場合にも候補になります。一方、データ共有や外出先利用はしにくく、法改正対応やe-Tax利用は基本使用サービスと年度アップグレードの確認が必要です。銀行API連携は追加オプション、OCR・AI仕訳・キャッシュレス連携・請求書連携は非対応のため、明細取込で入力を減らしたい人は他製品も比較して下さい。

価格

5,500円

年

無料トライアルあり

中小企業でのシェア

ユーザの企業規模

中小企業

中堅企業

大企業

使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ

メリットと注意点

仕様・機能

比較すべき機能の優先度マップ

どこから比較すべきか

製品には数多くの機能がありますが、選定の決め手になるのは一部の機能だけです。そこで各機能を「多くの企業で必要か」と「製品ごとに対応が分かれるか」の2つの軸で4つに分け、比較する順番が分かるように並べました。下の表では、このページに登場した製品が各機能にどう対応しているかを、上から順に確認できます。

標準対応

オプション/条件付き

非対応

選定の決め手

個人事業主の確定申告では、青色申告の可否や電子申告の完結度、消費税対応、自動化機能で製品差が出ます。申告経験や取引量に合わせて重点的に比較してください。

	freee会計（個人）	やよいの白色申告オンライン	マネーフォワードクラウド確定申告	やよいの青色申告オンライン	やよいの青色申告	みんなの青色申告	ジョブカンDesktop 青色申告
青色申告（複式簿記）仕訳・総勘定元帳・決算書を複式簿記で作成できるか
電子申告（e-Tax送信） e-Taxへ直接送信できるか
消費税申告書消費税（本則・簡易）を計算し申告書を作成できるか
キャッシュレス連携（カード・QR・IC）カード・QR・交通系ICの明細を自動取得できるか
OCR（スマホ/画像）レシート・請求書をOCRで読み取り自動仕訳を提案できるか
AI仕訳 AIが勘定科目・税区分を推奨できるか
仕訳ルール条件ベースの自動仕訳ルールを作成・適用できるか

一部の企業で必須

請求書発行、EC販売、副業プラットフォーム、在庫を扱う個人事業主では、周辺データ連携や業態別管理が作業量を左右します。該当する運用がある場合に確認するとよい項目です。

	freee会計（個人）	やよいの白色申告オンライン	マネーフォワードクラウド確定申告	やよいの青色申告オンライン	やよいの青色申告	みんなの青色申告	ジョブカンDesktop 青色申告
請求書連携請求書サービスと連携し売上データを自動取り込みできるか
ECモール連携 ECモール/決済（Amazon/楽天等）と連携できるか
副業プラットフォーム連携フリマ/EC/配車等の副業プラットフォームと連携できるか
在庫管理在庫・仕入データを入力し原価を計算できるか
複数事業複数の事業・屋号を登録し事業別に帳簿・申告書を作成できるか

ほぼ全製品が対応

e-Tax用データの出力、固定資産管理、家事按分、不動産物件の管理は多くの製品で対応しています。候補を絞る際は、対応有無より使いやすさや手順の少なさで見比べてください。

	freee会計（個人）	やよいの白色申告オンライン	マネーフォワードクラウド確定申告	やよいの青色申告オンライン	やよいの青色申告	みんなの青色申告	ジョブカンDesktop 青色申告
e-Taxデータ出力 e-Tax用データを出力できるか
固定資産台帳固定資産台帳を作成し減価償却費を自動計算できるか
家事按分家事関連費の按分割合を設定し按分仕訳を自動計上できるか
複数物件管理不動産物件を複数登録し物件別に収支管理できるか

優先度が低い

株式・外貨・控除証明書の取り込みは、一般的な個人事業主の事業所得申告では優先度が下がります。投資や特定控除の申告がある人だけ比較対象に含めれば十分です。

	freee会計（個人）	やよいの白色申告オンライン	マネーフォワードクラウド確定申告	やよいの青色申告オンライン	やよいの青色申告	みんなの青色申告	ジョブカンDesktop 青色申告
証券連携（特定口座）特定口座年間取引報告書を取り込み譲渡損益・配当を計上できるか
外貨取引外貨建取引を換算し仕訳・申告へ反映できるか
ふるさと納税証明書取込寄附金控除の証明書データを取り込み自動計上できるか

個人事業主の確定申告ソフトの選び方

このページでの絞り込み方

1
タイプを見て、申告経験に近い製品を絞る初めての白色申告、青色申告まで進めたい運用、買い切りで手元PCに置く運用では合う製品が変わります。まずは申告経験、取引量、作業場所に近いタイプを確認します。タイプ別おすすめへ ↑
2
必要な機能は、機能の優先度マップで確認する申告書作成や明細取込は、取引量や事業内容によって優先度が変わります。レシート読取や請求書連携も、必要な人だけ深く確認すれば十分です。機能の優先度マップへ ↑
3
運用・契約条件をそろえて確認する個人事業主の確定申告ソフトは、作業場所や記帳の頻度で続けやすさが変わります。料金と相談先も、契約後の負担に直結します。下の比較ポイントでは、機能の○×に加えて確認したい運用・契約条件を整理します。

ここからは、日々の入力から申告前の確認までを無理なく続けるための条件をそろえます。スマホ中心かPC中心か、毎月処理するかまとめて入力するかで負担は変わります。費用と相談先も同じ前提で整理すると、導入後の使い方を想像しやすくなります。