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せどりの確定申告ソフトおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/5/29
せどりの確定申告ソフトは、単なる帳簿付けツールではなく、AmazonやメルカリなどのECサイトと連携して売上・手数料を自動取込したり、AIが仕訳を提案してくれたりと、せどり特有の大量取引を効率よくさばくための進化を続けています。ただし、簿記知識ゼロでも使えるガイド型から、EC連携・AI自動仕訳に強い自動化重視型、買い切りで低コストに本格管理できる型まで、製品の方向性はさまざまです。FitGapでは、取引件数と販売チャネル数を軸に3タイプへ分類し、要件の整理から製品選定までをステップごとにご案内します。
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レビュー担当 松浦 大輔
FP技能士2級(AFP)・日商簿記2級を保有し、財務・会計の実務知識を裏付けている。freee等の会計・経費精算システムの業務利用経験を持ち、バックオフィス業務設計の視点から製品を評価している。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

目次

1
タイプ別おすすめ製品
簿記知識ゼロでも使えるかんたん操作タイプ 🔰
freee会計(個人)
/ やよいの白色申告 オンライン
/ ジョブカン青色申告
自動仕訳・EC連携で大量取引を効率処理するタイプ ⚡
マネーフォワード クラウド確定申告
/ やよいの青色申告 オンライン
/ やよいの青色申告
買い切り・低コストで本格帳簿管理するタイプ 💰
みんなの青色申告
/ ジョブカンDesktop 青色申告
/ やるぞ!青色申告
企業規模
大企業
個人事業主
その他
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おすすめ製品の早見表

タイプ別おすすめ製品 9

経費精算システムのおすすめ製品を製品ごとにタイプ、料金、企業規模、評価ポイントで比較する表
製品名タイプ料金企業規模評価ポイント
freee会計(個人)
簿記知識ゼロでも使えるかんたん操作タイプ 🔰
1,780円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

複数販路の明細を自動集約。AI仕訳と在庫管理まで使える。

やよいの白色申告 オンライン
簿記知識ゼロでも使えるかんたん操作タイプ 🔰
0円~
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

白色申告を無料で始められる。収支入力から申告書作成まで対応。

ジョブカン青色申告
簿記知識ゼロでも使えるかんたん操作タイプ 🔰
13,200円年/ライセンス
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

青色申告から在庫・消費税申告まで対応。標準機能が広いクラウド。

マネーフォワード クラウド確定申告
自動仕訳・EC連携で大量取引を効率処理するタイプ ⚡
0円~
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

EC・副業・金融明細を広く集約。多い取引も自動仕訳しやすい。

やよいの青色申告 オンライン
自動仕訳・EC連携で大量取引を効率処理するタイプ ⚡
11,800円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

初年度無料で全機能を使える。青色申告と消費税申告まで標準対応。

やよいの青色申告
自動仕訳・EC連携で大量取引を効率処理するタイプ ⚡
10,300円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

長年使われる定番デスクトップ。手元PCで青色申告と消費税申告を管理。

みんなの青色申告
買い切り・低コストで本格帳簿管理するタイプ 💰
¥10,780買い切り
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

買い切りでコストを抑えやすい。取引リスト入力と在庫管理にも対応。

ジョブカンDesktop 青色申告
買い切り・低コストで本格帳簿管理するタイプ 💰
5,500円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

買い切り型で複数事業の申告に対応。消費税申告と電子帳簿保存も扱える。

やるぞ!青色申告
買い切り・低コストで本格帳簿管理するタイプ 💰
9,357円
  • 中小
  • 中堅
  • 大企業

申告書に近い画面で入力できる。低コストで在庫管理にも対応。

タイプ別おすすめ製品

簿記知識ゼロでも使えるかんたん操作タイプ 🔰

このタイプが合う企業:

せどり初心者や副業で始めたばかりの個人事業主・会社員で、簿記や会計の知識にまったく自信がない方

どんなタイプか:

簿記用語を抑え、質問・ステップガイドに沿って帳簿付けから申告書作成まで進めるタイプです。せどりの少量取引を入力しやすく、操作のわかりやすさを重視します。

このタイプで重視すべき機能:

📝ステップガイド式の確定申告書作成
質問に答える流れで申告書類を自動作成し、勘定科目や複式簿記の判断を減らせます。
📱スマホだけで完結する記帳・申告
レシート読取、仕訳登録、e-Tax申告をスマホで扱い、移動中でも経理作業を進められます。

おすすめ製品3選

freee会計(個人)
おすすめの理由
freee会計(個人)は、せどりで分散しやすい売上・仕入・手数料データを自動で集め、簿記を意識せず帳簿化したい人向けの自動化重視型クラウドです。ECモール、銀行、カード、キャッシュレス、副業プラットフォーム連携に対応し、AI仕訳や在庫管理も使えるため、FitGapでは連携評価・機能性評価が同じおすすめ製品の中で1位です。AmazonやメルカリShopsなど複数チャネルを使う副業〜専業せどらー、青色申告で控除を狙う人に向きます。一方、借方・貸方で仕訳を切る従来型の会計画面に慣れたい人には独自UIが合わない場合があります。消費税申告や簡易課税はプラン・オプション確認が必要です。
価格
1,780円
無料トライアルあり
卸売・小売業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
やよいの白色申告 オンライン
おすすめの理由
やよいの白色申告 オンラインは、白色申告に絞って無料で記帳から申告書作成まで進められる、せどり初心者向けの入門クラウドです。画面ガイドに沿って収支内訳書を作れ、ECモール連携、銀行API連携、AI仕訳、消費税申告書にも対応するため、FitGapでは導入容易性と料金の評価が同じおすすめ製品の中で高く出ています。副業せどりを始めたばかりで取引量が少なく、まず費用をかけずに申告したい人に向きます。一方、青色申告の複式簿記や青色専従者給与には対応せず、65万円控除を狙う段階では別製品や同シリーズ上位への移行が前提です。在庫管理、仕訳ルール、副業プラットフォーム連携も非対応なので、複数販路で月の取引が多い人は自動化の強い製品と比べて下さい。
価格
0円~
卸売・小売業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
ジョブカン青色申告
おすすめの理由
ジョブカン青色申告は、青色申告の帳簿、在庫管理、消費税申告まで一つにまとめたいせどり事業者向けの、標準機能の広さを重視したクラウドです。質問に答えるガイドで申告書作成を進めやすく、青色申告、在庫管理、複数事業、簡易課税・本則課税に対応するため、FitGapでは導入容易性が同じおすすめ製品の中で最上位です。仕入商品を棚卸まで管理し、課税事業者になっても同じ環境で続けたい小規模事業者に向きます。一方、AI仕訳、OCR、ECモール連携、キャッシュレス連携、インボイス番号照会APIは非対応です。Amazonやメルカリの売上を大量に扱う場合は手入力やCSV取込が増えやすく、自動連携を重視するなら他製品との比較が必要です。
価格
13,200円
年/ライセンス
無料トライアルあり
卸売・小売業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

自動仕訳・EC連携で大量取引を効率処理するタイプ ⚡

このタイプが合う企業:

Amazon・メルカリ・楽天など複数チャネルで販売し、月の取引件数が多い中級〜上級のせどり事業者

どんなタイプか:

銀行・クレカ・EC明細を自動取込し、AI仕訳で大量の売上・仕入・手数料を処理するタイプです。繰り返し取引の学習による省力化が特徴です。

このタイプで重視すべき機能:

🔗銀行・クレカ・ECサイトとの自動明細取込
銀行・カード・ECサイトの明細を取り込み、売上や手数料の手入力を減らせます。
🤖AIによる自動仕訳と学習機能
取り込んだ明細へAIが勘定科目を提案し、過去の仕訳パターンも反映できます。

おすすめ製品3選

マネーフォワード クラウド確定申告
おすすめの理由
マネーフォワード クラウド確定申告は、EC・金融・副業サービスの明細を広く集約して自動仕訳につなげるクラウド型確定申告ソフトです。ECモール、副業プラットフォーム、キャッシュレス、銀行API、証券口座、インボイス番号照会APIまで連携でき、Amazon・メルカリに加えて投資や複数の副業収入も扱うせどらーに向きます。FitGapでは操作性・サポート・セキュリティ評価が同ページ内で最上位で、入力件数が多くても日常運用を進めやすい点が強みです。一方、消費税申告書、インボイス、簡易課税・本則課税、複数事業は追加オプションで、料金評価は同ページ内で低めです。国内ECが少量で口座も少ない場合は、より低コストな製品と比べてから選ぶ方がよいです。
価格
0円~
無料トライアルあり
卸売・小売業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
やよいの青色申告 オンライン
おすすめの理由
やよいの青色申告 オンラインは、クラウドで明細を取り込みながら、課税事業者の申告まで標準機能で進めやすい青色申告ソフトです。ECモール連携、副業プラットフォーム連携、銀行API、AI仕訳、仕訳ルールに対応し、国内せどりの売上・入出金を自動化しながら、消費税申告書、インボイス、簡易課税・本則課税まで扱えます。FitGapでは料金評価が同ページ内で最上位で、初年度無料や全プラン同一機能もあり、課税売上が増えてきた個人せどらーが費用を抑えて使いやすい候補です。一方、在庫管理とインボイス番号照会APIには非対応で、越境ECや海外投資家向けの用途は推奨されていません。スマホアプリだけでは申告書を作成できないため、PCブラウザ中心の運用で問題ないかも確認して下さい。
価格
11,800円
無料トライアルあり
卸売・小売業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
やよいの青色申告
おすすめの理由
やよいの青色申告は、PCにインストールしてデータを手元で管理しながら、青色申告と消費税申告をまとめて処理するパッケージ型ソフトです。銀行API連携、AI仕訳、仕訳ルール、インボイス番号照会APIに対応し、複数事業や複数物件管理も扱えるため、せどりと不動産賃貸などを分けて記帳したい個人事業主に向きます。FitGapでは料金評価が同ページ内で最上位で、月額課金を避けたい場合に選びやすい位置づけです。一方、ECモール、キャッシュレス、副業プラットフォーム、請求書連携は追加オプションで、在庫管理は非対応です。セットアップ評価も同ページ内では低いため、Amazonやメルカリの明細を手間なく取り込みたい人、Macや複数端末で作業したい人はクラウド型も比較した方がよいです。
価格
10,300円
無料トライアルあり
卸売・小売業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

買い切り・低コストで本格帳簿管理するタイプ 💰

このタイプが合う企業:

ランニングコストを抑えたいせどり事業者や、PC上でオフラインでも帳簿管理をしたい方、税理士と対面で相談しながら申告を進めたい方

どんなタイプか:

買い切り型のインストールソフトで、PC上に帳簿データを置きながら申告書作成まで進めるタイプです。自動連携より低コストと複式簿記での管理を重視します。

このタイプで重視すべき機能:

🏷️買い切り型のコストパフォーマンス
初回購入と更新料中心で使えるため、クラウド型の月額費用を抑え、長期の固定費を把握しやすくします。
📒複式簿記による本格的な帳簿管理
仕訳帳・総勘定元帳・試算表を作成し、青色申告に必要な帳簿を整えられます。

おすすめ製品3選

みんなの青色申告
おすすめの理由
みんなの青色申告は、月額課金を避けながら、せどりの仕入・販売・在庫まわりまで手元のPCで管理したい人に合う買い切り型の青色申告ソフトです。取引リストから選ぶ入力に加え、銀行明細の取込、AI仕訳、OCR、在庫管理、複数事業管理まで対応しており、Amazon・楽天・メルカリなど複数チャネルの入出金や在庫を日々整理したい個人せどらーに向きます。FitGapでは操作性評価がカテゴリ51製品中4位で、簿記に慣れない人でも始めやすい点も強みです。一方、Windows環境が前提で、e-Tax送信はできずデータ出力での運用となります。ECモール連携や請求書連携、インボイス登録番号の自動確認は非対応または追加オプションのため、販売データの自動連携やブラウザ完結の申告を重視する場合はクラウド型も比較した方がよいです。
価格
¥10,780
買い切り
無料トライアルあり
卸売・小売業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
ジョブカンDesktop 青色申告
おすすめの理由
ジョブカンDesktop 青色申告は、せどりの取引データを細かく自動化するより、買い切り型で申告書作成と税制対応を手堅く進めたい人向けのデスクトップ型ソフトです。同じ買い切り・低コスト系の候補の中でも、消費税申告書と電子帳簿保存法の両方を押さえたい場合に目立ちます。青色申告決算書、確定申告書B、消費税申告書の作成・印刷に対応し、インボイス、e-Taxデータ出力、固定資産台帳、青色専従者給与も扱えるため、課税事業者になった兼業せどらーや税理士へ渡す前に帳簿を整えたい人に向きます。FitGapでも複数の事業・副業を持つ個人での利用が推奨されています。一方、在庫管理、OCR、AI仕訳、Amazonや楽天などのECモール連携は非対応で、銀行明細の自動連携も追加オプションです。大量の取引を自動取込したい運用では、連携重視の製品と比較してください。
価格
5,500円
無料トライアルあり
卸売・小売業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能
やるぞ!青色申告
おすすめの理由
やるぞ!青色申告は、申告書の紙面に近い画面で帳簿入力から青色申告まで進められる、買い切り型中心のインストール型ソフトです。せどり用途では、在庫管理に対応し、仕入れ商品の棚卸と申告書類作成を1本で進めたい個人事業主に向きます。低コストで始めやすい点も強く、FitGapでは料金評価が9製品中1位タイです。操作性評価もカテゴリ51製品中4位で、複式簿記に慣れていない人でも画面案内に沿って作業しやすい点が強みです。一方、銀行明細やキャッシュレス決済、ECモール、OCR、AI仕訳の自動連携は弱く、CSV取込や手入力が中心です。月の取引件数が多いせどり事業者やスマホ・ブラウザ中心で処理したい人は、クラウド型や自動連携に強い製品との比較が必要です。
価格
9,357円
卸売・小売業でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
使いやすさ
セットアップ
料金
サポート充実
連携・拡張性
機能性
セキュリティ
メリットと注意点
仕様・機能

比較すべき機能の優先度マップ

どこから比較すべきか

製品には数多くの機能がありますが、選定の決め手になるのは一部の機能だけです。そこで各機能を「多くの企業で必要か」と「製品ごとに対応が分かれるか」の2つの軸で4つに分け、比較する順番が分かるように並べました。下の表では、このページに登場した製品が各機能にどう対応しているかを、上から順に確認できます。
標準対応
オプション/条件付き
非対応

選定の決め手

せどりではAmazonやフリマの売上、カード明細、レシート、在庫原価をどこまで自動化できるかで作業量が大きく変わるため、対応差の大きい項目を中心に確認します。
freee会計(個人)
やよいの白色申告 オンライン
ジョブカン青色申告
マネーフォワード クラウド確定申告
やよいの青色申告 オンライン
やよいの青色申告
みんなの青色申告
ジョブカンDesktop 青色申告
やるぞ!青色申告
キャッシュレス連携(カード・QR・IC)
カード・QR・交通系ICの明細を自動取得できるか
ECモール連携
ECモール/決済(Amazon/楽天等)と連携できるか
副業プラットフォーム連携
フリマ/EC/配車等の副業プラットフォームと連携できるか
OCR(スマホ/画像)
レシート・請求書をOCRで読み取り自動仕訳を提案できるか
AI仕訳
AIが勘定科目・税区分を推奨できるか
仕訳ルール
条件ベースの自動仕訳ルールを作成・適用できるか
在庫管理
在庫・仕入データを入力し原価を計算できるか

一部の企業で必須

課税事業者になる、複数屋号で運営する、海外仕入れを扱うなど、せどりの運用条件が広がる場合に必要性が高まる項目です。自分の販売形態に当てはまるものだけ比較します。
freee会計(個人)
やよいの白色申告 オンライン
ジョブカン青色申告
マネーフォワード クラウド確定申告
やよいの青色申告 オンライン
やよいの青色申告
みんなの青色申告
ジョブカンDesktop 青色申告
やるぞ!青色申告
簡易課税(事業区分)
簡易課税の事業区分(第1〜5種)を設定できるか
インボイス番号照会API連携
公表サイトAPIで適格請求書の登録番号を照会し記録できるか
複数事業
複数の事業・屋号を登録し事業別に帳簿・申告書を作成できるか
外貨取引
外貨建取引を換算し仕訳・申告へ反映できるか

ほぼ全製品が対応

確定申告ソフトとして多くの製品が備える基本項目です。せどり用途でも通常は前提機能として見てよく、細かな使い勝手やプラン差を確認すると選びやすくなります。
freee会計(個人)
やよいの白色申告 オンライン
ジョブカン青色申告
マネーフォワード クラウド確定申告
やよいの青色申告 オンライン
やよいの青色申告
みんなの青色申告
ジョブカンDesktop 青色申告
やるぞ!青色申告
e-Taxデータ出力
e-Tax用データを出力できるか
銀行API連携
銀行APIで口座明細を自動取得できるか
固定資産台帳
固定資産台帳を作成し減価償却費を自動計算できるか
家事按分
家事関連費の按分割合を設定し按分仕訳を自動計上できるか

優先度が低い

投資関連の申告や農業、不動産収支など、せどり中心の申告では使う場面が限られる項目です。該当する副収入がない場合は比較の優先度を下げても問題ありません。
freee会計(個人)
やよいの白色申告 オンライン
ジョブカン青色申告
マネーフォワード クラウド確定申告
やよいの青色申告 オンライン
やよいの青色申告
みんなの青色申告
ジョブカンDesktop 青色申告
やるぞ!青色申告
農業対応
農業向け科目・棚卸機能で申告書を作成できるか
証券連携(特定口座)
特定口座年間取引報告書を取り込み譲渡損益・配当を計上できるか
医療費集計フォーム取込
国税庁の医療費集計フォーム(Excel)を取り込み明細へ反映できるか

せどりの確定申告ソフトの選び方

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

よくある質問

せどり業において確定申告ソフトを導入する際、どのような点に注意すべきですか?

注意点はいくつかありますが、なかでも「利用する販売サイトとの連携対応状況」「在庫管理方式と会計処理の整合性」「初期データ移行の手間と正確性」が特に重要です。とりわけ利用する販売サイトとの連携対応状況については、確定申告ソフトを導入する前に、自分が利用している販売サイトと連携できるか必ず確認することが大切です。また在庫管理方式と会計処理の整合性については、確定申告ソフトが採用している在庫管理方式が、自分の事業に合っているか確認が必要です。このほか「初期データ移行の手間と正確性」「月額費用と事業規模のバランス」「操作習得までの学習期間」なども、事前に確認しておくことをおすすめします。

※掲載している機能・対応範囲・料金は一般的な目安です。製品・プラン・契約条件により異なる場合があるため、導入前に各製品の最新の公式情報や比較表でご確認ください。

サービスカテゴリ

AI・エージェント

汎用生成AI・エージェント
LLM・大規模言語モデル
エージェントフレームワーク
エージェントオートメーション基盤

ソフトウェア(Saas)

オフィス環境・総務・施設管理
開発・ITインフラ・セキュリティ
データ分析・連携