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残業申請対応の勤怠管理システムおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/5/13
残業申請に対応した勤怠管理システムは、単なる打刻ツールではありません。事前・事後の申請切り替え、多段階の承認フロー、36協定の上限カウント、残業種別ごとの割増計算など、製品によって対応範囲に大きな差があります。FitGapでは、こうした違いを「勤怠管理特化」「バックオフィス一体」「大企業・複雑な就業規則対応」の3タイプに整理しました。本記事では、各タイプの代表製品を紹介したうえで、要件の優先度の付け方から実機検証のポイントまで、自社に合った1製品を選び抜くためのステップを解説します。
レビュー担当 加藤 杏奈
業務システムベンダーでCOMPANY・リシテア等の人事・給与・勤怠システムの導入支援に5年間従事。要件確認・設定・テスト・保守対応まで一連の工程を経験し、制度と運用の両面を踏まえた評価を行っている。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。
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kincone
価格
200円
ユーザー/月
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スマレジ・タイムカード
価格
0円~
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中小企業
中堅企業
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990円
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中堅企業
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メリットと注意点
仕様・機能
価格
要問合せ
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中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
価格
6,000円
ユーザー/年
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中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
リシテア/人事給与管理
価格
要問合せ
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中小企業
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仕様・機能
価格
200円
月/ユーザー
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中小企業
中堅企業
大企業
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仕様・機能
オフィスステーション勤怠
価格
330円
ユーザー/月
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中小企業
中堅企業
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メリットと注意点
仕様・機能
freee勤怠管理Plus
価格
300円
ユーザー/月
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大企業
メリットと注意点
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価格
300円
ユーザー/月
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中小企業
中堅企業
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メリットと注意点
仕様・機能
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