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クリニックの会計ソフトおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/6/19
クリニックの会計ソフトは、帳簿入力だけの道具に見えますが、顧問税理士と帳簿を共有するか、院内で日々の記帳を回すか、医療法人や分院の損益まで見るかで比較の入口が変わります。保険診療の入金遅れや自費診療の請求、医療材料の管理が絡むため、銀行明細の取込や患者別入金消込をどこまで会計に反映するかも確認点になります。開業形態や将来の法人化を先に置くと、税務精度を優先する製品と、自動仕訳や経営レポートを使う製品、本部で拠点を管理する製品を混同せずに見られます。このページでは、税理士との連携と院内での日次処理を分けて、クリニックの会計ソフトの候補を比較できます。
レビュー担当 松浦 大輔
FP技能士2級(AFP)・日商簿記2級を保有し、財務・会計の実務知識を裏付けている。freee等の会計・経費精算システムの業務利用経験を持ち、バックオフィス業務設計の視点から製品を評価している。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。
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PCA公益法人会計DX
価格
7,480円
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
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中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
価格
25ドル
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
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大企業
メリットと注意点
仕様・機能
パワフル会計「組合」
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
Web財政部長
価格
40,000円
医療・福祉業界でのシェア
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中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
価格
0円〜
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医療・福祉業界でのシェア
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中小企業
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メリットと注意点
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円簿青色申告
価格
9,500円
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
価格
0円〜
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
QuickBooks Online
価格
38ドル
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
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メリットと注意点
仕様・機能
価格
要問合せ
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
スマホ会計FinFin
価格
0円〜
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
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メリットと注意点
仕様・機能
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