あなたにぴったりの
クリニック向けの会計ソフト
を無料で選定
Q. どちらに当てはまりますか?
クリニック向けの会計ソフトを知りたい
あなたにおすすめ
条件に合う会計ソフトを知りたい
経理業務を効率化したい
今の会計ソフトから乗り換えたい

クリニックの会計ソフトおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/6/19
クリニックの会計ソフトは、帳簿入力だけの道具に見えますが、顧問税理士と帳簿を共有するか、院内で日々の記帳を回すか、医療法人や分院の損益まで見るかで比較の入口が変わります。保険診療の入金遅れや自費診療の請求、医療材料の管理が絡むため、銀行明細の取込や患者別入金消込をどこまで会計に反映するかも確認点になります。開業形態や将来の法人化を先に置くと、税務精度を優先する製品と、自動仕訳や経営レポートを使う製品、本部で拠点を管理する製品を混同せずに見られます。このページでは、税理士との連携と院内での日次処理を分けて、クリニックの会計ソフトの候補を比較できます。
レビュー担当 松浦 大輔
FP技能士2級(AFP)・日商簿記2級を保有し、財務・会計の実務知識を裏付けている。freee等の会計・経費精算システムの業務利用経験を持ち、バックオフィス業務設計の視点から製品を評価している。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。
企業規模
大企業
中小企業
個人事業主
その他
すべて表示

すべての製品

勘定奉行クラウド
価格
7,750円
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
価格
7,750円
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
奉行V ERPクラウド
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
奉行V ERP smartプラン
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
奉行V ERP Enterprise Group Management Edition
価格
要問合せ
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
弥生会計 Next
価格
9,000円
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
freee会計(法人)
価格
2,980円
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
やよいの青色申告
価格
10,300円
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
やよいの青色申告 オンライン
価格
11,800円
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
やよいの白色申告 オンライン
価格
0円〜
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
1

ぴったりの製品が見つかる

かんたんな質問に答えるだけで、あなたの要件が整理され、解消すべき注意点や導入までに必要なステップも分かります。

サービスカテゴリ

AI・エージェント

汎用生成AI・エージェント
LLM・大規模言語モデル
エージェントフレームワーク
エージェントオートメーション基盤

ソフトウェア(Saas)

オフィス環境・総務・施設管理
開発・ITインフラ・セキュリティ
データ分析・連携