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クリニックの会計ソフトおすすめ9選|タイプ別の選び方ガイド

更新:2026/4/17
クリニック向けの会計ソフトは、一般企業向けとは選び方がまったく異なります。最大の理由は「顧問税理士が使っているソフトに合わせる必要がある」という業界特有の事情があるからです。さらに、個人開業か医療法人かで必要な会計基準が変わり、保険診療の入金が約2か月遅れるという資金管理上の課題もあります。つまり、クリニックの会計ソフトは「税理士との連携方法」「開設形態」「日常業務の自動化レベル」という3つの軸で製品タイプが分かれます。本ガイドでは、この3タイプに沿っておすすめ9製品を紹介し、要件の整理から最終選定までを順を追って解説します。
レビュー担当 松浦 大輔
FP技能士2級(AFP)・日商簿記2級を保有し、財務・会計の実務知識を裏付けている。freee等の会計・経費精算システムの業務利用経験を持ち、バックオフィス業務設計の視点から製品を評価している。
FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。
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Akaunting
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価格
-
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
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Invoice Ninja
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価格
-
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
FrontAccounting
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価格
-
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
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メリットと注意点
仕様・機能
LedgerSMB
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価格
-
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
労働組合らくらく会計
価格
39,600円
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
価格
0円~
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中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
価格
0円~
医療・福祉業界でのシェア
ユーザの企業規模
中小企業
中堅企業
大企業
メリットと注意点
仕様・機能
価格
$23.00
無料トライアルあり
医療・福祉業界でのシェア
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中小企業
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メリットと注意点
仕様・機能
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