FitGap | 残業申請対応の勤怠管理システムのおすすめ製品を徹底比較！

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残業申請対応の勤怠管理システムおすすめ9選｜タイプ別の選び方ガイド

更新：2025年11月02日

残業申請に対応した勤怠管理システムは、単なる打刻ツールではありません。事前・事後の申請切り替え、多段階の承認フロー、36協定の上限カウント、残業種別ごとの割増計算など、製品によって対応範囲に大きな差があります。FitGapでは、こうした違いを「勤怠管理特化」「バックオフィス一体」「大企業・複雑な就業規則対応」の3タイプに整理しました。本記事では、各タイプの代表製品を紹介したうえで、要件の優先度の付け方から実機検証のポイントまで、自社に合った1製品を選び抜くためのステップを解説します。

FitGapにおけるすべての評価は、公平性を最優先に、客観的なアルゴリズムを用いて計算されています。製品の評価方法は「FitGapの評価メソッド」、シェアデータの算出根拠は「シェアスコアの算出方法」をご覧ください。

タイプ別お勧め製品

勤怠管理特化タイプ 🕐

このタイプが合う企業：

既存の給与計算ソフトや人事システムは変えずに、残業申請を含む勤怠管理だけをクラウド化・効率化したい中小〜中堅企業の管理部門担当者

どんなタイプか：

残業申請や打刻、休暇管理といった勤怠管理の基本業務にフォーカスした製品群です。給与計算や人事管理は外部製品と連携する前提で設計されているため、勤怠まわりの機能が非常に充実しています。FitGapでは、まず勤怠だけをしっかり整えたい企業や、既存の給与ソフトをそのまま使い続けたい企業におすすめしています。残業申請のワークフローや36協定チェック機能など、コンプライアンス対応に強い製品が多く、設定の柔軟性が高いのも特徴です。

このタイプで重視すべき機能：

📝残業申請ワークフローの柔軟設定

事前申請・事後申請の切り替えや、部署ごとの承認ルート設定、上限時間超過時の自動アラートなど、残業申請に関するルールを自社の就業規則に合わせて細かくカスタマイズできます。申請漏れや承認遅れを防ぐ通知機能も備わっています。

🔗多様な外部給与ソフト連携

勤怠データをCSVやAPI経由で各社の給与計算ソフトへスムーズに受け渡せます。勤怠に特化しているぶん連携先の選択肢が幅広く、既存の給与システムを変更せずに導入できるのが大きなメリットです。